Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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BRCA | |||||||
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UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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DLBC | |||
KIRC | |||
LUSC | |||
PAAD | |||
READ | |||
STAD | |||
TGCT | |||
THCA | |||
UCS |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
STAD | ||
SARC | ||
MESO | ||
SKCM | ||
LUSC | ||
BRCA | ||
ESCA | ||
KIRP | ||
PCPG | ||
CESC | ||
LAML | ||
UCEC | ||
LIHC | ||
LGG | ||
OV |
PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
---|---|---|---|---|---|
7370264 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000325307 | HMGB3-201 | 3560 | XM_024452369 | ENSP00000359393 | 200 (aa) | XP_024308137 | O15347 |
ENST00000430118 | HMGB3-203 | 529 | - | ENSP00000417027 | 153 (aa) | - | E9PES6 |
ENST00000419110 | HMGB3-202 | 707 | - | ENSP00000410354 | 188 (aa) | - | E7ES08 |
ENST00000448905 | HMGB3-204 | 812 | - | ENSP00000442758 | 200 (aa) | - | O15347 |
ENST00000455596 | HMGB3-205 | 793 | - | ENSP00000405601 | 193 (aa) | - | E7EQU1 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000029993 | HMGB3 | 100 | 97.500 | ENSMUSG00000015217 | Hmgb3 | 100 | 97.500 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000400 | four-way junction DNA binding | - | ISS | Function |
GO:0000790 | nuclear chromatin | 21873635. | IBA | Component |
GO:0003690 | double-stranded DNA binding | - | ISS | Function |
GO:0003723 | RNA binding | 22681889. | HDA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 21044950.25416956. | IPI | Function |
GO:0005737 | cytoplasm | 21873635. | IBA | Component |
GO:0006310 | DNA recombination | 21873635. | IBA | Process |
GO:0006310 | DNA recombination | - | ISS | Process |
GO:0006338 | chromatin remodeling | 21873635. | IBA | Process |
GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 21873635. | IBA | Process |
GO:0007275 | multicellular organism development | 9598312. | TAS | Process |
GO:0008134 | transcription factor binding | 21873635. | IBA | Function |
GO:0008301 | DNA binding, bending | 21873635. | IBA | Function |
GO:0008301 | DNA binding, bending | - | ISS | Function |
GO:0032392 | DNA geometric change | - | ISS | Process |
GO:0045087 | innate immune response | - | IEA | Process |
GO:0045089 | positive regulation of innate immune response | 21873635. | IBA | Process |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 21873635. | IBA | Process |