Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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Cancer | P-value | Q-value |
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CESC | ||
LAML | ||
KICH | ||
UCEC | ||
DLBC | ||
LGG | ||
LUAD |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
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ENST00000472585 | VCL-204 | 556 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000478896 | VCL-205 | 727 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000372755 | VCL-202 | 6489 | - | ENSP00000361841 | 1066 (aa) | - | P18206 |
ENST00000624354 | VCL-207 | 3307 | - | ENSP00000485551 | 57 (aa) | - | A0A096LPE1 |
ENST00000623461 | VCL-206 | 7995 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000461383 | VCL-203 | 268 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000211998 | VCL-201 | 5490 | - | ENSP00000211998 | 1134 (aa) | - | P18206 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000035403 | rs3812625 | 10 | 73997944 | ? | Left ventricular internal dimension in diastole | 29403010 | [0.039-0.081] unit decrease | 0.05998 | EFO_0008204 |
ENSG00000035403 | rs10824058 | 10 | 74031881 | ? | Systolic blood pressure | 30595370 | EFO_0006335 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000035403 | VCL | 54 | 38.614 | ENSG00000044115 | CTNNA1 | 95 | 32.075 | Homo_sapiens |
ENSG00000035403 | VCL | 100 | 99.343 | ENSMUSG00000021823 | Vcl | 100 | 99.343 | Mus_musculus |
ENSG00000035403 | VCL | 59 | 33.529 | ENSMUSG00000037815 | Ctnna1 | 51 | 33.529 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | 20086044. | IMP | Process |
GO:0002102 | podosome | - | IEA | Component |
GO:0002162 | dystroglycan binding | 18341635. | IPI | Function |
GO:0002576 | platelet degranulation | - | TAS | Process |
GO:0003779 | actin binding | 16803572. | IDA | Function |
GO:0003779 | actin binding | 7816144. | IDA | Function |
GO:0005198 | structural molecule activity | - | IEA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 9054445.9885244.10320934.12473693.15070891.15163412.15988023.16803572.16826238.17082770.17289036.17932491.18028034.22427331.25416956. | IPI | Function |
GO:0005576 | extracellular region | - | TAS | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0005856 | cytoskeleton | 16130169. | TAS | Component |
GO:0005911 | cell-cell junction | - | ISS | Component |
GO:0005912 | adherens junction | - | ISS | Component |
GO:0005913 | cell-cell adherens junction | 20086044. | IDA | Component |
GO:0005916 | fascia adherens | - | IEA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 20086044.29162887. | IDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | - | ISS | Component |
GO:0006936 | muscle contraction | - | TAS | Process |
GO:0007155 | cell adhesion | 15501673. | TAS | Process |
GO:0007160 | cell-matrix adhesion | 20086044. | TAS | Process |
GO:0008013 | beta-catenin binding | 20086044. | ISS | Function |
GO:0030032 | lamellipodium assembly | - | ISS | Process |
GO:0030055 | cell-substrate junction | 2116004. | NAS | Component |
GO:0030336 | negative regulation of cell migration | 15494027. | TAS | Process |
GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | 19725078. | IPI | Function |
GO:0032991 | protein-containing complex | 9700171. | IDA | Component |
GO:0034333 | adherens junction assembly | 20086044. | IMP | Process |
GO:0034394 | protein localization to cell surface | 20086044. | IMP | Process |
GO:0034774 | secretory granule lumen | - | TAS | Component |
GO:0035580 | specific granule lumen | - | TAS | Component |
GO:0042383 | sarcolemma | - | ISS | Component |
GO:0043034 | costamere | 9415431. | IDA | Component |
GO:0043034 | costamere | - | ISS | Component |
GO:0043297 | apical junction assembly | 9700171. | IMP | Process |
GO:0043312 | neutrophil degranulation | - | TAS | Process |
GO:0045294 | alpha-catenin binding | 9700171. | IPI | Function |
GO:0045296 | cadherin binding | 25468996. | HDA | Function |
GO:0045296 | cadherin binding | 20086044. | ISS | Function |
GO:0048675 | axon extension | - | IEA | Process |
GO:0070062 | extracellular exosome | 19056867.20458337. | HDA | Component |
GO:0070527 | platelet aggregation | 23382103. | HMP | Process |
GO:0090136 | epithelial cell-cell adhesion | 20086044. | IMP | Process |
GO:1903561 | extracellular vesicle | 24769233. | HDA | Component |
GO:1904813 | ficolin-1-rich granule lumen | - | TAS | Component |