Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
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PAAD | |||||||
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UCEC | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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BRCA | |||
ESCA | |||
TGCT | |||
UCEC |
Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
ACC | ||
UCS | ||
PRAD | ||
PAAD | ||
READ | ||
KICH | ||
UCEC | ||
GBM | ||
LIHC | ||
LGG | ||
OV |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000480887 | RSF1-204 | 5318 | - | ENSP00000434509 | 1189 (aa) | - | Q96T23 |
ENST00000467567 | RSF1-203 | 2982 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000534794 | RSF1-212 | 487 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000529470 | RSF1-207 | 448 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000440064 | RSF1-202 | 604 | - | ENSP00000408844 | 202 (aa) | - | H7C306 |
ENST00000531768 | RSF1-210 | 626 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000530604 | RSF1-208 | 520 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000308488 | RSF1-201 | 11550 | XM_005274051 | ENSP00000311513 | 1441 (aa) | XP_005274108 | Q96T23 |
ENST00000526324 | RSF1-205 | 2409 | - | ENSP00000432022 | 803 (aa) | - | H0YCN2 |
ENST00000531026 | RSF1-209 | 830 | - | ENSP00000433603 | 276 (aa) | - | H0YDG9 |
ENST00000528095 | RSF1-206 | 2107 | - | ENSP00000436408 | 702 (aa) | - | H0YER1 |
ENST00000532556 | RSF1-211 | 495 | - | ENSP00000436728 | 165 (aa) | - | H0YEX0 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000048649 | RSF1 | 100 | 97.826 | ENSMUSG00000035623 | Rsf1 | 99 | 82.809 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000123 | histone acetyltransferase complex | 21873635. | IBA | Component |
GO:0000790 | nuclear chromatin | 21873635. | IBA | Component |
GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 12972596. | IPI | Function |
GO:0005634 | nucleus | 21873635. | IBA | Component |
GO:0005634 | nucleus | 11788598.12972596. | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
GO:0006334 | nucleosome assembly | 12972596. | IDA | Process |
GO:0006338 | chromatin remodeling | 9836642. | IDA | Process |
GO:0006352 | DNA-templated transcription, initiation | 9836642. | IDA | Process |
GO:0016573 | histone acetylation | - | IEA | Process |
GO:0016584 | nucleosome positioning | 9836642. | IDA | Process |
GO:0016887 | ATPase activity | 12972596. | IDA | Function |
GO:0031213 | RSF complex | 9836642. | IPI | Component |
GO:0034080 | CENP-A containing nucleosome assembly | - | TAS | Process |
GO:0042393 | histone binding | 21873635. | IBA | Function |
GO:0042393 | histone binding | 12972596. | IDA | Function |
GO:0043392 | negative regulation of DNA binding | 12972596. | IDA | Process |
GO:0045892 | negative regulation of transcription, DNA-templated | 21873635. | IBA | Process |
GO:0045892 | negative regulation of transcription, DNA-templated | 11944984. | IDA | Process |
GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-templated | 11788598. | IDA | Process |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 21873635. | IBA | Process |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |
GO:0050434 | positive regulation of viral transcription | 11788598. | IDA | Process |