Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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UCS | |||||||
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UVM |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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ACC | |||
SARC | |||
THCA |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
STAD | ||
SARC | ||
MESO | ||
READ | ||
KICH | ||
LIHC |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000469129 | SMC1A-205 | 847 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000375340 | SMC1A-202 | 9930 | - | ENSP00000364489 | 1211 (aa) | - | G8JLG1 |
ENST00000428014 | SMC1A-203 | 868 | - | ENSP00000413509 | 262 (aa) | - | H0Y7K8 |
ENST00000470241 | SMC1A-206 | 838 | - | ENSP00000476416 | 279 (aa) | - | V9GY57 |
ENST00000322213 | SMC1A-201 | 9784 | - | ENSP00000323421 | 1233 (aa) | - | Q14683 |
ENST00000463684 | SMC1A-204 | 880 | - | ENSP00000476958 | 54 (aa) | - | V9GYN9 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000072501 | SMC1A | 100 | 99.838 | ENSMUSG00000041133 | Smc1a | 100 | 99.838 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | 7757074. | TAS | Process |
GO:0000775 | chromosome, centromeric region | - | TAS | Component |
GO:0000776 | kinetochore | 11682612.12199140. | IDA | Component |
GO:0000777 | condensed chromosome kinetochore | - | IEA | Component |
GO:0000794 | condensed nuclear chromosome | 7757074. | TAS | Component |
GO:0003682 | chromatin binding | 11076961. | IDA | Function |
GO:0003723 | RNA binding | 22681889. | HDA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 11076961.11590136.11877377.12930902.15837422.16438930.17112726.17113138.17349791.18832153.19629043.20818333.22628566.22885700.22977523.23242214.24136289.26496610.30021884. | IPI | Function |
GO:0005524 | ATP binding | - | IEA | Function |
GO:0005634 | nucleus | 11076961. | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
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GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0006281 | DNA repair | 11877377. | TAS | Process |
GO:0007062 | sister chromatid cohesion | 15917200. | IMP | Process |
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GO:0008278 | cohesin complex | 11590136.22628566. | IDA | Component |
GO:0008278 | cohesin complex | 11076961. | TAS | Component |
GO:0009314 | response to radiation | 11877377. | IEP | Process |
GO:0016363 | nuclear matrix | 11590136. | IDA | Component |
GO:0019827 | stem cell population maintenance | - | IEA | Process |
GO:0030893 | meiotic cohesin complex | 21242291. | IDA | Component |
GO:0032876 | negative regulation of DNA endoreduplication | 15917200. | IMP | Process |
GO:0036033 | mediator complex binding | - | IEA | Function |
GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 11590136. | IPI | Function |
GO:0051301 | cell division | - | IEA | Process |
GO:0051321 | meiotic cell cycle | - | ISS | Process |
GO:0072423 | response to DNA damage checkpoint signaling | 11877377. | IDA | Process |
GO:0097431 | mitotic spindle pole | 11590136. | IDA | Component |
GO:1901673 | regulation of mitotic spindle assembly | 11590136. | IMP | Process |