Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
BLCA | |||||||
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OV | |||||||
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READ | |||||||
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SARC | |||||||
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UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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CESC | |||
PAAD | |||
PAAD |
Cancer | P-value | Q-value |
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SARC | ||
MESO | ||
ACC | ||
HNSC | ||
LUSC | ||
ESCA | ||
KIRP | ||
COAD | ||
BLCA | ||
CESC | ||
LAML | ||
KICH | ||
LIHC | ||
LUAD | ||
UVM |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000409176 | MAP3K20-203 | 2572 | XM_005246640 | ENSP00000387259 | 800 (aa) | XP_005246697 | Q9NYL2 |
ENST00000476618 | MAP3K20-206 | 4010 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000480606 | MAP3K20-207 | 821 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000375213 | MAP3K20-202 | 3741 | - | ENSP00000364361 | 800 (aa) | - | Q9NYL2 |
ENST00000468408 | MAP3K20-205 | 585 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000338983 | MAP3K20-201 | 7179 | XM_017004323 | ENSP00000340257 | 455 (aa) | XP_016859812 | Q9NYL2 |
ENST00000539448 | MAP3K20-208 | 2312 | XM_017004324 | ENSP00000439414 | 455 (aa) | XP_016859813 | Q9NYL2 |
ENST00000422149 | MAP3K20-204 | 661 | - | ENSP00000411923 | 138 (aa) | - | C9J3F7 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa04010 | MAPK signaling pathway | KEGG |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000091436 | rs722864 | 2 | 173118476 | G | Lung cancer | 28604730 | [1.05-1.11] | 1.0751604 | EFO_0001071 |
ENSG00000091436 | rs1866631 | 2 | 173211033 | A | Lung cancer in ever smokers | 28604730 | [1.04-1.11] | 1.0744331 | EFO_0006527|EFO_0001071 |
ENSG00000091436 | rs4972539 | 2 | 173242571 | ? | Parental longevity (mother's age at death) | 27015805 | [0.018-0.043] unit decrease | 0.03089 | EFO_0007796 |
ENSG00000091436 | rs10497399 | 2 | 173249411 | ? | Adiponectin levels | 26299439 | EFO_0004502 | ||
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Educational attainment (MTAG) | 30038396 | [0.0087-0.0145] unit increase | 0.0116 | EFO_0004784 |
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Highest math class taken | 30038396 | [0.012-0.023] unit increase | 0.0175 | EFO_0004875 |
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Self-reported math ability (MTAG) | 30038396 | [0.0094-0.0172] unit increase | 0.0133 | EFO_0004875 |
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Highest math class taken (MTAG) | 30038396 | [0.012-0.019] unit increase | 0.0154 | EFO_0004875 |
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Cognitive performance (MTAG) | 30038396 | [0.013-0.024] unit increase | 0.0186 | EFO_0008354 |
ENSG00000091436 | rs10193498 | 2 | 173229617 | A | Educational attainment (years of education) | 30038396 | [0.0066-0.0128] unit increase | 0.0097 | EFO_0004784 |
ENSG00000091436 | rs7575189 | 2 | 173150440 | A | Smoking status (ever vs never smokers) | 30643258 | [0.0071-0.0151] unit decrease | 0.011123441 | EFO_0004318 |
ENSG00000091436 | rs13035366 | 2 | 173194654 | ? | Lung function (FEV1/FVC) | 30595370 | EFO_0004713 | ||
ENSG00000091436 | rs6758859 | 2 | 173100328 | T | Diastolic blood pressure | 30224653 | [0.086-0.156] mmHg increase | 0.1211 | EFO_0006336 |
ENSG00000091436 | rs6750801 | 2 | 173202452 | A | Smoking initiation (ever regular vs never regular) (MTAG) | 30643251 | [0.0048-0.0092] unit increase | 0.00698417 | EFO_0006527 |
ENSG00000091436 | rs13004345 | 2 | 173172619 | C | Chronotype | 30696823 | 1.0190797 | EFO_0008328 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000091436 | MAP3K20 | 100 | 99.275 | ENSMUSG00000004085 | Map3k20 | 100 | 100.000 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000077 | DNA damage checkpoint | 11836244. | IMP | Process |
GO:0000186 | activation of MAPKK activity | 11836244. | TAS | Process |
GO:0000287 | magnesium ion binding | 11836244. | IDA | Function |
GO:0003723 | RNA binding | 22681889. | HDA | Function |
GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 11836244. | IDA | Function |
GO:0004709 | MAP kinase kinase kinase activity | 11836244. | IDA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 21988832. | IPI | Function |
GO:0005524 | ATP binding | 11836244. | IDA | Function |
GO:0005634 | nucleus | - | IEA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | - | ISS | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0006468 | protein phosphorylation | 11836244. | IDA | Process |
GO:0007010 | cytoskeleton organization | - | IEA | Process |
GO:0007050 | cell cycle arrest | 11836244. | IMP | Process |
GO:0007093 | mitotic cell cycle checkpoint | 15342622. | IDA | Process |
GO:0007257 | activation of JUN kinase activity | 11836244. | IDA | Process |
GO:0008219 | cell death | 11836244. | NAS | Process |
GO:0008283 | cell proliferation | 11836244. | NAS | Process |
GO:0030154 | cell differentiation | 11836244. | NAS | Process |
GO:0042733 | embryonic digit morphogenesis | 26755636. | IMP | Process |
GO:0043065 | positive regulation of apoptotic process | 10924358. | IDA | Process |
GO:0051403 | stress-activated MAPK cascade | 11836244. | IDA | Process |
GO:0060173 | limb development | 26755636. | IMP | Process |
GO:0071480 | cellular response to gamma radiation | 11836244. | IDA | Process |