Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
BLCA | |||||||
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ESCA | |||||||
ESCA | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
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HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
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HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
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KICH | |||||||
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KIRC | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
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LAML | |||||||
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LIHC | |||||||
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LUSC | |||||||
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MESO | |||||||
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OV | |||||||
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PCPG | |||||||
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READ | |||||||
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READ | |||||||
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SARC | |||||||
SARC | |||||||
SARC | |||||||
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TGCT | |||||||
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THYM | |||||||
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UCEC | |||||||
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UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCS | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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CHOL | |||
COAD | |||
LUAD | |||
UCEC |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
SKCM | ||
ESCA | ||
PAAD | ||
CESC | ||
LIHC | ||
UVM |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000262519 | RRM_1 | PF00076.22 | 2.5e-05 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000452917 | SETD1A-202 | 315 | - | ENSP00000391408 | 63 (aa) | - | C9J2Z9 |
ENST00000262519 | SETD1A-201 | 6451 | XM_005255723 | ENSP00000262519 | 1707 (aa) | XP_005255780 | O15047 |
ENST00000640410 | SETD1A-203 | 718 | - | - | - (aa) | - | - |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa00310 | Lysine degradation | KEGG |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000099381 | rs67517081 | 16 | 30976060 | G | Mean corpuscular hemoglobin | 27863252 | [0.018-0.032] unit decrease | 0.02491798 | EFO_0004527 |
ENSG00000099381 | rs62055866 | 16 | 30958236 | C | Neurociticism | 29500382 | z score increase | 6.29 | EFO_0007660 |
ENSG00000099381 | rs7204459 | 16 | 30972891 | ? | Red blood cell count | 30595370 | EFO_0004305 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000099381 | SETD1A | 65 | 69.649 | ENSAPLG00000005217 | SETD1B | 53 | 70.530 | Anas_platyrhynchos |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 91.953 | ENSBTAG00000002345 | SETD1A | 100 | 92.177 | Bos_taurus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 96.431 | ENSCJAG00000003000 | SETD1A | 100 | 96.431 | Callithrix_jacchus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 91.953 | ENSCAFG00000016758 | SETD1A | 100 | 91.953 | Canis_familiaris |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 92.258 | ENSCAFG00020018051 | SETD1A | 100 | 92.258 | Canis_lupus_dingo |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 92.267 | ENSCHIG00000025896 | SETD1A | 100 | 92.236 | Capra_hircus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 92.213 | ENSCPOG00000025456 | SETD1A | 100 | 92.213 | Cavia_porcellus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 95.902 | ENSCCAG00000025600 | SETD1A | 100 | 95.960 | Cebus_capucinus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.602 | ENSCATG00000035417 | SETD1A | 100 | 97.602 | Cercocebus_atys |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 90.946 | ENSCLAG00000011583 | SETD1A | 100 | 98.381 | Chinchilla_lanigera |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.834 | ENSCSAG00000005791 | SETD1A | 100 | 97.834 | Chlorocebus_sabaeus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 89.108 | ENSCGRG00001022425 | - | 100 | 88.651 | Cricetulus_griseus_chok1gshd |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 89.166 | ENSCGRG00000016965 | - | 100 | 88.709 | Cricetulus_griseus_crigri |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 93.626 | ENSFCAG00000002588 | SETD1A | 100 | 93.275 | Felis_catus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 70 | 69.707 | ENSFHEG00000013126 | setd1ba | 51 | 69.205 | Fundulus_heteroclitus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.715 | ENSGGOG00000016052 | SETD1A | 100 | 97.715 | Gorilla_gorilla |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 94.438 | ENSSTOG00000005369 | SETD1A | 100 | 94.321 | Ictidomys_tridecemlineatus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 90.568 | ENSLAFG00000023335 | SETD1A | 100 | 90.744 | Loxodonta_africana |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.778 | ENSMFAG00000003435 | SETD1A | 100 | 97.778 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.251 | ENSMMUG00000003233 | SETD1A | 100 | 99.595 | Macaca_mulatta |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.367 | ENSMLEG00000030176 | SETD1A | 100 | 97.367 | Mandrillus_leucophaeus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 93.732 | ENSMICG00000001575 | SETD1A | 100 | 93.732 | Microcebus_murinus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 89.057 | ENSMOCG00000012528 | - | 100 | 89.587 | Microtus_ochrogaster |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 89.766 | ENSPPRG00000012737 | SETD1A | 100 | 89.357 | Panthera_pardus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 99.531 | ENSPTRG00000008024 | SETD1A | 100 | 99.531 | Pan_troglodytes |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 97.427 | ENSPANG00000025141 | SETD1A | 100 | 97.427 | Papio_anubis |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 88.355 | ENSPEMG00000024243 | - | 100 | 96.341 | Peromyscus_maniculatus_bairdii |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 93.263 | ENSPCOG00000020896 | SETD1A | 100 | 93.204 | Propithecus_coquereli |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 89.108 | ENSRNOG00000055028 | Setd1a | 100 | 88.812 | Rattus_norvegicus |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 94.746 | ENSSBOG00000020392 | SETD1A | 100 | 95.213 | Saimiri_boliviensis_boliviensis |
ENSG00000099381 | SETD1A | 56 | 98.119 | ENSSSCG00000007782 | SETD1A | 95 | 98.089 | Sus_scrofa |
ENSG00000099381 | SETD1A | 58 | 68.810 | ENSTNIG00000009090 | setd1ba | 53 | 68.954 | Tetraodon_nigroviridis |
ENSG00000099381 | SETD1A | 100 | 92.267 | ENSTTRG00000015493 | SETD1A | 100 | 92.150 | Tursiops_truncatus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000790 | nuclear chromatin | 27141965. | IDA | Component |
GO:0003723 | RNA binding | - | IEA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 12670868.17998332.18765639.20622854.22723415.22843687.23870121.26886794. | IPI | Function |
GO:0005634 | nucleus | 17500065. | IDA | Component |
GO:0005634 | nucleus | 22723415. | IMP | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
GO:0008013 | beta-catenin binding | 22723415. | IDA | Function |
GO:0008134 | transcription factor binding | 27141965. | IPI | Function |
GO:0016607 | nuclear speck | - | IDA | Component |
GO:0035097 | histone methyltransferase complex | 17355966.17500065. | IDA | Component |
GO:0042800 | histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) | 20862685. | IDA | Function |
GO:0045652 | regulation of megakaryocyte differentiation | - | TAS | Process |
GO:0048188 | Set1C/COMPASS complex | 17998332.18838538. | IDA | Component |
GO:0048188 | Set1C/COMPASS complex | 27141965. | TAS | Component |
GO:0051568 | histone H3-K4 methylation | - | IEA | Process |
GO:1902036 | regulation of hematopoietic stem cell differentiation | 27141965. | IDA | Process |
GO:1902275 | regulation of chromatin organization | 27141965. | IDA | Process |