Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
---|---|---|---|---|---|---|---|
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CHOL | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
DLBC | |||||||
ESCA | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
LGG | |||||||
LGG | |||||||
LIHC | |||||||
LIHC | |||||||
LIHC | |||||||
LIHC | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
PAAD | |||||||
PRAD | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
SARC | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
THCA | |||||||
THYM | |||||||
THYM | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
---|---|---|---|
ACC | |||
CHOL | |||
COAD | |||
GBM | |||
KIRC | |||
KIRP | |||
LGG | |||
MESO | |||
OV | |||
PAAD | |||
READ |
Cancer | P-value | Q-value |
---|---|---|
THYM | ||
STAD | ||
SARC | ||
MESO | ||
ACC | ||
PAAD | ||
BLCA | ||
CESC | ||
LAML | ||
KICH | ||
UCEC | ||
LUAD | ||
UVM | ||
OV |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000555709 | MTHFD1-211 | 803 | - | ENSP00000450560 | 261 (aa) | - | P11586 |
ENST00000557370 | MTHFD1-215 | 571 | - | ENSP00000477199 | 107 (aa) | - | V9GYY3 |
ENST00000555858 | MTHFD1-212 | 386 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000554057 | MTHFD1-205 | 560 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000216605 | MTHFD1-201 | 3136 | - | ENSP00000216605 | 935 (aa) | - | P11586 |
ENST00000554768 | MTHFD1-209 | 563 | - | ENSP00000477501 | 25 (aa) | - | V9GZ78 |
ENST00000555252 | MTHFD1-210 | 2053 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000554353 | MTHFD1-206 | 556 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000556284 | MTHFD1-213 | 932 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000557539 | MTHFD1-216 | 509 | - | ENSP00000476468 | 68 (aa) | - | V9GY75 |
ENST00000554739 | MTHFD1-208 | 688 | - | ENSP00000477359 | 23 (aa) | - | V9GZ32 |
ENST00000553391 | MTHFD1-203 | 568 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000545908 | MTHFD1-202 | 6814 | - | ENSP00000438588 | 1020 (aa) | - | F5H2F4 |
ENST00000554677 | MTHFD1-207 | 783 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000556771 | MTHFD1-214 | 813 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000553405 | MTHFD1-204 | 833 | - | - | - (aa) | - | - |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000100714 | rs10498514 | 14 | 64432337 | ? | Cognitive performance | 19734545 | EFO_0003926 | ||
ENSG00000100714 | rs2281603 | 14 | 64459379 | C | Lymphocyte counts | 27863252 | [0.022-0.038] unit increase | 0.02984291 | EFO_0004587 |
ENSG00000100714 | rs6573559 | 14 | 64456448 | T | Educational attainment (years of education) | 30038396 | [0.0076-0.0134] unit increase | 0.0105 | EFO_0004784 |
ENSG00000100714 | rs1950902 | 14 | 64415662 | ? | Longevity | 30294719 | [1.34-1.90] | 1.595 | EFO_0004300 |
ENSG00000100714 | rs3783727 | 14 | 64435010 | ? | Heel bone mineral density | 30595370 | EFO_0009270 |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000105 | histidine biosynthetic process | - | IEA | Process |
GO:0001780 | neutrophil homeostasis | - | IEA | Process |
GO:0001843 | neural tube closure | - | ISS | Process |
GO:0004329 | formate-tetrahydrofolate ligase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0004329 | formate-tetrahydrofolate ligase activity | 1881876. | IDA | Function |
GO:0004329 | formate-tetrahydrofolate ligase activity | - | ISS | Function |
GO:0004477 | methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0004477 | methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity | 1881876. | IDA | Function |
GO:0004486 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase [NAD(P)+] activity | 1881876. | IDA | Function |
GO:0004487 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NAD+) activity | - | ISS | Function |
GO:0004488 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 24169621. | IPI | Function |
GO:0005524 | ATP binding | - | IEA | Function |
GO:0005737 | cytoplasm | 21873635. | IBA | Component |
GO:0005739 | mitochondrion | 3528153. | TAS | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0006164 | purine nucleotide biosynthetic process | - | ISS | Process |
GO:0006555 | methionine metabolic process | - | ISS | Process |
GO:0006730 | one-carbon metabolic process | 25633902. | IMP | Process |
GO:0007507 | heart development | - | ISS | Process |
GO:0009069 | serine family amino acid metabolic process | - | ISS | Process |
GO:0009070 | serine family amino acid biosynthetic process | 25633902. | IMP | Process |
GO:0009086 | methionine biosynthetic process | 25633902. | IMP | Process |
GO:0009113 | purine nucleobase biosynthetic process | 21873635. | IBA | Process |
GO:0009257 | 10-formyltetrahydrofolate biosynthetic process | 21873635. | IBA | Process |
GO:0009257 | 10-formyltetrahydrofolate biosynthetic process | 1881876. | IDA | Process |
GO:0009257 | 10-formyltetrahydrofolate biosynthetic process | - | ISS | Process |
GO:0016020 | membrane | 19946888. | HDA | Component |
GO:0019346 | transsulfuration | - | IEA | Process |
GO:0035999 | tetrahydrofolate interconversion | 1881876. | IDA | Process |
GO:0035999 | tetrahydrofolate interconversion | - | IEA | Process |
GO:0035999 | tetrahydrofolate interconversion | - | ISS | Process |
GO:0046655 | folic acid metabolic process | - | TAS | Process |
GO:0048702 | embryonic neurocranium morphogenesis | - | ISS | Process |
GO:0048703 | embryonic viscerocranium morphogenesis | - | ISS | Process |
GO:0055114 | oxidation-reduction process | - | IEA | Process |
GO:0061053 | somite development | - | ISS | Process |
GO:0070062 | extracellular exosome | 19056867.20458337.23533145. | HDA | Component |