Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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PAAD | |||
TGCT | |||
THYM |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
SARC | ||
ACC | ||
UCS | ||
HNSC | ||
SKCM | ||
KIRP | ||
CESC | ||
LAML | ||
KICH | ||
UCEC | ||
LIHC | ||
UVM |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000494126 | ResIII | PF04851.15 | 8.7e-10 | 1 | 1 |
ENSP00000494981 | ResIII | PF04851.15 | 1.1e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000494247 | ResIII | PF04851.15 | 1.2e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000493829 | ResIII | PF04851.15 | 1.4e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000349508 | ResIII | PF04851.15 | 1.4e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000496543 | ResIII | PF04851.15 | 1.5e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000494574 | ResIII | PF04851.15 | 1.5e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000493471 | ResIII | PF04851.15 | 1.5e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000494456 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000493619 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000496358 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000440542 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000496163 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000440392 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000496634 | ResIII | PF04851.15 | 1.6e-09 | 1 | 1 |
ENSP00000496707 | ResIII | PF04851.15 | 2.3e-09 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000647394 | CHD4-251 | 1995 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000642860 | CHD4-215 | 1799 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646462 | CHD4-244 | 2301 | - | ENSP00000496291 | 605 (aa) | - | A0A2R8Y7I0 |
ENST00000645991 | CHD4-238 | 1253 | - | ENSP00000496457 | 73 (aa) | - | A0A2R8Y7X1 |
ENST00000644077 | CHD4-222 | 1972 | - | ENSP00000496233 | 560 (aa) | - | A0A2R8Y7M9 |
ENST00000647112 | CHD4-249 | 1564 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000642594 | CHD4-211 | 6142 | - | ENSP00000493619 | 1889 (aa) | - | A0A2R8Y425 |
ENST00000646145 | CHD4-240 | 620 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000647333 | CHD4-250 | 753 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646268 | CHD4-241 | 6236 | - | ENSP00000495023 | 1377 (aa) | - | A0A2R8Y685 |
ENST00000644289 | CHD4-225 | 5007 | - | ENSP00000496707 | 1669 (aa) | - | A0A2R8Y8C1 |
ENST00000642637 | CHD4-212 | 2501 | - | ENSP00000495233 | 458 (aa) | - | A0A2R8YE38 |
ENST00000544484 | CHD4-207 | 6555 | - | ENSP00000440392 | 1937 (aa) | - | A0A0C4DGG9 |
ENST00000643538 | CHD4-220 | 2533 | - | ENSP00000494571 | 554 (aa) | - | A0A2R8Y5M9 |
ENST00000645645 | CHD4-236 | 6297 | XM_017018730 | ENSP00000496543 | 1899 (aa) | XP_016874219 | A0A2R8YFK9 |
ENST00000646787 | CHD4-247 | 171 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000430771 | CHD4-202 | 527 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000645265 | CHD4-235 | 200 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646806 | CHD4-248 | 6359 | XM_017018732 | ENSP00000494574 | 1892 (aa) | XP_016874221 | A0A2R8Y5J0 |
ENST00000540960 | CHD4-205 | 913 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000545083 | CHD4-208 | 511 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000537634 | CHD4-204 | 792 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000642879 | CHD4-216 | 6309 | XM_024448804 | ENSP00000494456 | 1920 (aa) | XP_024304572 | A0A2R8Y521 |
ENST00000642810 | CHD4-214 | 6630 | - | ENSP00000495160 | 1425 (aa) | - | A0A2R8Y5Z7 |
ENST00000642686 | CHD4-213 | 1204 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000643367 | CHD4-219 | 764 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646609 | CHD4-246 | 854 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646608 | CHD4-245 | 4988 | - | ENSP00000493829 | 1554 (aa) | - | A0A2R8YDJ9 |
ENST00000644352 | CHD4-226 | 4111 | - | ENSP00000494981 | 1215 (aa) | - | A0A2R8YDW2 |
ENST00000645199 | CHD4-234 | 1327 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000643815 | CHD4-221 | 4945 | - | ENSP00000494247 | 1484 (aa) | - | A0A2R8YD40 |
ENST00000644356 | CHD4-227 | 3075 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000647535 | CHD4-254 | 3099 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646070 | CHD4-239 | 582 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000645095 | CHD4-232 | 6291 | XM_006718958 | ENSP00000496634 | 1940 (aa) | XP_006719021 | Q14839 |
ENST00000545942 | CHD4-210 | 1267 | - | ENSP00000437506 | 354 (aa) | - | F5H6N4 |
ENST00000644652 | CHD4-228 | 1616 | - | ENSP00000495539 | 103 (aa) | - | A0A2R8Y6G9 |
ENST00000642893 | CHD4-217 | 361 | - | ENSP00000494441 | 16 (aa) | - | A0A2R8Y512 |
ENST00000645717 | CHD4-237 | 311 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000357008 | CHD4-201 | 6438 | XM_006718962 | ENSP00000349508 | 1902 (aa) | XP_006719025 | A0A2U3TZM0 |
ENST00000645005 | CHD4-230 | 6175 | XM_006718959 | ENSP00000493471 | 1914 (aa) | XP_006719022 | A0A2R8Y212 |
ENST00000644801 | CHD4-229 | 5326 | - | ENSP00000496660 | 1147 (aa) | - | A0A2R8Y8B3 |
ENST00000544040 | CHD4-206 | 6582 | XM_017018726 | ENSP00000440542 | 1912 (aa) | XP_016874215 | Q14839 |
ENST00000647483 | CHD4-253 | 4145 | - | ENSP00000494126 | 1262 (aa) | - | A0A2R8Y4X2 |
ENST00000643335 | CHD4-218 | 6411 | - | ENSP00000496358 | 1903 (aa) | - | A0A2R8YFD8 |
ENST00000645143 | CHD4-233 | 612 | - | ENSP00000495834 | 48 (aa) | - | A0A2R8Y795 |
ENST00000646360 | CHD4-242 | 2867 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000535717 | CHD4-203 | 1405 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000646366 | CHD4-243 | 4622 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000545584 | CHD4-209 | 555 | - | ENSP00000444614 | 125 (aa) | - | F5H596 |
ENST00000645022 | CHD4-231 | 6673 | XM_005253668 | ENSP00000496163 | 1905 (aa) | XP_005253725 | F5GWX5 |
ENST00000644137 | CHD4-224 | 6499 | - | ENSP00000495816 | 1645 (aa) | - | A0A2R8YER1 |
ENST00000647426 | CHD4-252 | 168 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000644132 | CHD4-223 | 773 | - | ENSP00000494498 | 51 (aa) | - | A0A2R8Y539 |
ensgID | Trait | pValue | Pubmed ID |
---|---|---|---|
ENSG00000111642 | Myopia, Degenerative | 6E-6 | 23049088 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000111642 | rs1057510 | 12 | 6574121 | ? | Myopia (pathological) | 23049088 | [NR] | EFO_0004207 | |
ENSG00000111642 | rs10849492 | 12 | 6611629 | A | Heel bone mineral density | 30598549 | [0.0096-0.019] unit decrease | 0.0142951 | EFO_0009270 |
ENSG00000111642 | rs7308584 | 12 | 6597578 | ? | Red cell distribution width | 30595370 | EFO_0005192 | ||
ENSG00000111642 | rs1639122 | 12 | 6601981 | ? | Red blood cell count | 30595370 | EFO_0004305 | ||
ENSG00000111642 | rs1639122 | 12 | 6601981 | ? | Heel bone mineral density | 30595370 | EFO_0009270 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Paralog | Gene Symbol | Coverage | Identiy |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000111642 | CHD4 | 67 | 37.062 | ENSG00000173575 | CHD2 | 87 | 68.367 |
ENSG00000111642 | CHD4 | 52 | 36.256 | ENSG00000127616 | SMARCA4 | 91 | 39.437 |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 75.184 | ENSG00000170004 | CHD3 | 99 | 64.038 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 82.594 | ENSAPOG00000008935 | chd4a | 99 | 78.930 | Acanthochromis_polyacanthus |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 74.315 | ENSAPOG00000020502 | - | 93 | 71.104 | Acanthochromis_polyacanthus |
ENSG00000111642 | CHD4 | 100 | 98.849 | ENSAMEG00000014179 | - | 100 | 98.864 | Ailuropoda_melanoleuca |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 79.487 | ENSACIG00000012387 | - | 95 | 76.092 | Amphilophus_citrinellus |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 81.547 | ENSACIG00000019310 | chd4a | 90 | 92.825 | Amphilophus_citrinellus |
ENSG00000111642 | CHD4 | 100 | 80.095 | ENSAOCG00000016412 | - | 98 | 81.098 | Amphiprion_ocellaris |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 80.725 | ENSAOCG00000000507 | - | 98 | 76.157 | Amphiprion_ocellaris |
ENSG00000111642 | CHD4 | 94 | 79.643 | ENSAPEG00000001757 | chd4a | 99 | 77.347 | Amphiprion_percula |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 80.469 | ENSAPEG00000005957 | - | 98 | 75.501 | Amphiprion_percula |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 | 74.485 | ENSAPEG00000020306 | - | 89 | 83.019 | Amphiprion_percula |
ENSG00000111642 | CHD4 | 99 |