Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
---|---|---|---|---|---|---|---|
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRP | |||||||
LGG | |||||||
LGG | |||||||
LIHC | |||||||
LIHC | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
OV | |||||||
PRAD | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
SARC | |||||||
SARC | |||||||
SARC | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
TGCT | |||||||
THCA | |||||||
THCA | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
---|---|---|---|
BRCA | |||
CESC | |||
COAD | |||
GBM | |||
MESO | |||
PRAD | |||
SKCM | |||
STAD | |||
TGCT |
Cancer | P-value | Q-value |
---|---|---|
THYM | ||
SARC | ||
ACC | ||
SKCM | ||
BRCA | ||
KIRP | ||
COAD | ||
LAML | ||
GBM | ||
LIHC | ||
LGG | ||
UVM |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000497519 | RPL5-205 | 1210 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000461952 | RPL5-203 | 1116 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000644759 | RPL5-208 | 1085 | - | ENSP00000495549 | 297 (aa) | - | P46777 |
ENST00000645300 | RPL5-210 | 896 | - | ENSP00000495589 | 238 (aa) | - | A0A2R8Y6J3 |
ENST00000646852 | RPL5-212 | 733 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000643510 | RPL5-206 | 277 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000370321 | RPL5-202 | 1028 | - | ENSP00000359345 | 297 (aa) | - | P46777 |
ENST00000644549 | RPL5-207 | 271 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000645908 | RPL5-211 | 591 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000645119 | RPL5-209 | 629 | - | ENSP00000493811 | 170 (aa) | - | A0A2R8Y4A2 |
ENST00000315741 | RPL5-201 | 681 | - | ENSP00000359338 | 130 (aa) | - | Q5T7N0 |
ENST00000470843 | RPL5-204 | 694 | - | ENSP00000473675 | 63 (aa) | - | R4GNJ2 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa03010 | Ribosome | KEGG |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000122406 | rs6604026 | 1 | 92838046 | G | Multiple sclerosis | 19525955 | [NR] | 1.17 | EFO_0003885 |
ENSG00000122406 | rs6604026 | 1 | 92838046 | C | Multiple sclerosis | 17660530 | [1.08-1.22] | 1.15 | EFO_0003885 |
ENSG00000122406 | rs189162117 | 1 | 92839027 | ? | Mean corpuscular hemoglobin | 30595370 | EFO_0004527 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 82.540 | WBGene00004416 | rpl-5 | 99 | 58.362 | Caenorhabditis_elegans |
ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 85.714 | FBgn0064225 | RpL5 | 97 | 68.621 | Drosophila_melanogaster |
ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 98.462 | ENSMUSG00000058558 | Rpl5 | 100 | 98.773 | Mus_musculus |
ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 69.841 | YPL131W | RPL5 | 99 | 49.488 | Saccharomyces_cerevisiae |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000027 | ribosomal large subunit assembly | 21873635. | IBA | Process |
GO:0000027 | ribosomal large subunit assembly | 24120868. | IMP | Process |
GO:0000184 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay | - | TAS | Process |
GO:0003723 | RNA binding | 22658674.22681889. | HDA | Function |
GO:0003730 | mRNA 3'-UTR binding | 16213212. | IDA | Function |
GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 12962325. | NAS | Function |
GO:0005515 | protein binding | 9465063.9687515.12054647.15314173.15469983.16648475.17110929.17373842.18560357.20434207.20926688.21399665. | IPI | Function |
GO:0005634 | nucleus | 9687515. | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | 24120868. | IDA | Component |
GO:0005730 | nucleolus | 16791210. | HDA | Component |
GO:0005730 | nucleolus | 15469983.24120868. | IDA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | 16791210. | HDA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | 15314173.15469983. | IDA | Component |
GO:0005783 | endoplasmic reticulum | - | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
GO:0006364 | rRNA processing | 18697920. | IMP | Process |
GO:0006412 | translation | 12962325. | NAS | Process |
GO:0006413 | translational initiation | - | TAS | Process |
GO:0006614 | SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane | - | TAS | Process |
GO:0008097 | 5S rRNA binding | 21873635. | IBA | Function |
GO:0008097 | 5S rRNA binding | 18560357. | IDA | Function |
GO:0010628 | positive regulation of gene expression | 18560357. | IDA | Process |
GO:0016020 | membrane | 19946888. | HDA | Component |
GO:0019083 | viral transcription | - | TAS | Process |
GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 12962325. | HDA | Component |
GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 21873635. | IBA | Component |
GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | 18560357. | IPI | Function |
GO:0032991 | protein-containing complex | 15314173. | IDA | Component |
GO:0042273 | ribosomal large subunit biogenesis | 18697920. | IMP | Process |
GO:0045202 | synapse | - | IEA | Component |
GO:0045727 | positive regulation of translation | 16213212. | IDA | Process |
GO:0048027 | mRNA 5'-UTR binding | 16213212. | IDA | Function |
GO:0050821 | protein stabilization | 18560357. | IMP | Process |
GO:0070062 | extracellular exosome | 20458337. | HDA | Component |
GO:1901796 | regulation of signal transduction by p53 class mediator | 24120868. | IMP | Process |
GO:1904667 | negative regulation of ubiquitin protein ligase activity | 18560357. | IDA | Process |
GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 18809582. | IDA | Component |
GO:1990948 | ubiquitin ligase inhibitor activity | 18560357. | IDA | Function |
GO:2000059 | negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process | 18560357. | IDA | Process |
GO:2000435 | negative regulation of protein neddylation | 18560357. | IDA | Process |