| Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BLCA | |||||||
| BLCA | |||||||
| BLCA | |||||||
| BLCA | |||||||
| BRCA | |||||||
| BRCA | |||||||
| BRCA | |||||||
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| BRCA | |||||||
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| CESC | |||||||
| CESC | |||||||
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| COAD | |||||||
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| GBM | |||||||
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| GBM | |||||||
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| HNSC | |||||||
| HNSC | |||||||
| HNSC | |||||||
| KIRC | |||||||
| KIRP | |||||||
| LGG | |||||||
| LGG | |||||||
| LIHC | |||||||
| LIHC | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUAD | |||||||
| LUSC | |||||||
| LUSC | |||||||
| LUSC | |||||||
| LUSC | |||||||
| LUSC | |||||||
| OV | |||||||
| PRAD | |||||||
| READ | |||||||
| READ | |||||||
| READ | |||||||
| READ | |||||||
| SARC | |||||||
| SARC | |||||||
| SARC | |||||||
| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
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| SKCM | |||||||
| SKCM | |||||||
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| STAD | |||||||
| STAD | |||||||
| STAD | |||||||
| STAD | |||||||
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| TGCT | |||||||
| THCA | |||||||
| THCA | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
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| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC | |||||||
| UCEC |
| Cancer | Type | Freq | Q-value |
|---|---|---|---|
| BRCA | |||
| CESC | |||
| COAD | |||
| GBM | |||
| MESO | |||
| PRAD | |||
| SKCM | |||
| STAD | |||
| TGCT |
| Cancer | P-value | Q-value |
|---|---|---|
| THYM | ||
| SARC | ||
| ACC | ||
| SKCM | ||
| BRCA | ||
| KIRP | ||
| COAD | ||
| LAML | ||
| GBM | ||
| LIHC | ||
| LGG | ||
| UVM |
| Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ENST00000497519 | RPL5-205 | 1210 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000461952 | RPL5-203 | 1116 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000644759 | RPL5-208 | 1085 | - | ENSP00000495549 | 297 (aa) | - | P46777 |
| ENST00000645300 | RPL5-210 | 896 | - | ENSP00000495589 | 238 (aa) | - | A0A2R8Y6J3 |
| ENST00000646852 | RPL5-212 | 733 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000643510 | RPL5-206 | 277 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000370321 | RPL5-202 | 1028 | - | ENSP00000359345 | 297 (aa) | - | P46777 |
| ENST00000644549 | RPL5-207 | 271 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000645908 | RPL5-211 | 591 | - | - | - (aa) | - | - |
| ENST00000645119 | RPL5-209 | 629 | - | ENSP00000493811 | 170 (aa) | - | A0A2R8Y4A2 |
| ENST00000315741 | RPL5-201 | 681 | - | ENSP00000359338 | 130 (aa) | - | Q5T7N0 |
| ENST00000470843 | RPL5-204 | 694 | - | ENSP00000473675 | 63 (aa) | - | R4GNJ2 |
| Pathway ID | Pathway Name | Source |
|---|---|---|
| hsa03010 | Ribosome | KEGG |
| ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ENSG00000122406 | rs6604026 | 1 | 92838046 | G | Multiple sclerosis | 19525955 | [NR] | 1.17 | EFO_0003885 |
| ENSG00000122406 | rs6604026 | 1 | 92838046 | C | Multiple sclerosis | 17660530 | [1.08-1.22] | 1.15 | EFO_0003885 |
| ENSG00000122406 | rs189162117 | 1 | 92839027 | ? | Mean corpuscular hemoglobin | 30595370 | EFO_0004527 |

| Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 82.540 | WBGene00004416 | rpl-5 | 99 | 58.362 | Caenorhabditis_elegans |
| ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 85.714 | FBgn0064225 | RpL5 | 97 | 68.621 | Drosophila_melanogaster |
| ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 98.462 | ENSMUSG00000058558 | Rpl5 | 100 | 98.773 | Mus_musculus |
| ENSG00000122406 | RPL5 | 100 | 69.841 | YPL131W | RPL5 | 99 | 49.488 | Saccharomyces_cerevisiae |
| Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
|---|---|---|---|---|
| GO:0000027 | ribosomal large subunit assembly | 21873635. | IBA | Process |
| GO:0000027 | ribosomal large subunit assembly | 24120868. | IMP | Process |
| GO:0000184 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay | - | TAS | Process |
| GO:0003723 | RNA binding | 22658674.22681889. | HDA | Function |
| GO:0003730 | mRNA 3'-UTR binding | 16213212. | IDA | Function |
| GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 12962325. | NAS | Function |
| GO:0005515 | protein binding | 9465063.9687515.12054647.15314173.15469983.16648475.17110929.17373842.18560357.20434207.20926688.21399665. | IPI | Function |
| GO:0005634 | nucleus | 9687515. | IDA | Component |
| GO:0005654 | nucleoplasm | 24120868. | IDA | Component |
| GO:0005730 | nucleolus | 16791210. | HDA | Component |
| GO:0005730 | nucleolus | 15469983.24120868. | IDA | Component |
| GO:0005737 | cytoplasm | 16791210. | HDA | Component |
| GO:0005737 | cytoplasm | 15314173.15469983. | IDA | Component |
| GO:0005783 | endoplasmic reticulum | - | IDA | Component |
| GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
| GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
| GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
| GO:0006364 | rRNA processing | 18697920. | IMP | Process |
| GO:0006412 | translation | 12962325. | NAS | Process |
| GO:0006413 | translational initiation | - | TAS | Process |
| GO:0006614 | SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane | - | TAS | Process |
| GO:0008097 | 5S rRNA binding | 21873635. | IBA | Function |
| GO:0008097 | 5S rRNA binding | 18560357. | IDA | Function |
| GO:0010628 | positive regulation of gene expression | 18560357. | IDA | Process |
| GO:0016020 | membrane | 19946888. | HDA | Component |
| GO:0019083 | viral transcription | - | TAS | Process |
| GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 12962325. | HDA | Component |
| GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 21873635. | IBA | Component |
| GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | 18560357. | IPI | Function |
| GO:0032991 | protein-containing complex | 15314173. | IDA | Component |
| GO:0042273 | ribosomal large subunit biogenesis | 18697920. | IMP | Process |
| GO:0045202 | synapse | - | IEA | Component |
| GO:0045727 | positive regulation of translation | 16213212. | IDA | Process |
| GO:0048027 | mRNA 5'-UTR binding | 16213212. | IDA | Function |
| GO:0050821 | protein stabilization | 18560357. | IMP | Process |
| GO:0070062 | extracellular exosome | 20458337. | HDA | Component |
| GO:1901796 | regulation of signal transduction by p53 class mediator | 24120868. | IMP | Process |
| GO:1904667 | negative regulation of ubiquitin protein ligase activity | 18560357. | IDA | Process |
| GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 18809582. | IDA | Component |
| GO:1990948 | ubiquitin ligase inhibitor activity | 18560357. | IDA | Function |
| GO:2000059 | negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process | 18560357. | IDA | Process |
| GO:2000435 | negative regulation of protein neddylation | 18560357. | IDA | Process |