Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
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UCS | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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CESC | |||
KIRP | |||
LUAD | |||
LUSC | |||
PAAD | |||
READ | |||
TGCT | |||
UCS |
Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
MESO | ||
ACC | ||
SKCM | ||
PRAD | ||
KIRP | ||
COAD | ||
PAAD | ||
BLCA | ||
LAML | ||
LIHC | ||
LGG | ||
LUAD | ||
UVM | ||
OV |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
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ENST00000595242 | SCAF1-202 | 463 | - | ENSP00000472276 | 119 (aa) | - | M0R232 |
ENST00000598359 | SCAF1-203 | 662 | - | ENSP00000473210 | 203 (aa) | - | M0R3G4 |
ENST00000360565 | SCAF1-201 | 4306 | XM_005259122 | ENSP00000353769 | 1312 (aa) | XP_005259179 | Q9H7N4 |
ENST00000601038 | SCAF1-204 | 491 | - | ENSP00000472649 | 98 (aa) | - | M0R2L3 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
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ENSG00000126461 | rs7508148 | 19 | 49648885 | ? | Schizophrenia | 29483656 | [1.06-1.1] | 1.08 | EFO_0000692 |
ENSG00000126461 | rs189349094 | 19 | 49642643 | ? | Systolic blood pressure | 30595370 | EFO_0006335 | ||
ENSG00000126461 | rs76387513 | 19 | 49658008 | ? | Mean corpuscular hemoglobin | 30595370 | EFO_0004527 | ||
ENSG00000126461 | rs61743199 | 19 | 49657834 | ? | Heel bone mineral density | 30595370 | EFO_0009270 | ||
ENSG00000126461 | rs189349094 | 19 | 49642643 | ? | Cardiovascular disease | 30595370 | EFO_0000319 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
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ENSG00000126461 | SCAF1 | 100 | 90.909 | ENSMUSG00000038406 | Scaf1 | 100 | 97.674 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
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GO:0003723 | RNA binding | - | IEA | Function |
GO:0005634 | nucleus | - | IEA | Component |
GO:0006366 | transcription by RNA polymerase II | - | IEA | Process |
GO:0006397 | mRNA processing | - | IEA | Process |
GO:0008380 | RNA splicing | - | IEA | Process |
GO:0019904 | protein domain specific binding | - | IEA | Function |
GO:0099122 | RNA polymerase II C-terminal domain binding | 15992770. | IPI | Function |