PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
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28026121 |
Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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Cancer | P-value | Q-value |
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LAML | ||
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LGG | ||
OV |
PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
---|---|---|---|---|---|
23921632 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000532377 | LMO7-221 | 595 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000525373 | LMO7-216 | 672 | - | ENSP00000431896 | 191 (aa) | - | E9PJ10 |
ENST00000497947 | LMO7-213 | 995 | - | ENSP00000431271 | 121 (aa) | - | E9PLU6 |
ENST00000533809 | LMO7-225 | 578 | - | ENSP00000475811 | 99 (aa) | - | U3KQE6 |
ENST00000533305 | LMO7-224 | 720 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000465261 | LMO7-207 | 5580 | XM_017020589 | ENSP00000433352 | 1385 (aa) | XP_016876078 | A0A0A0MTE2 |
ENST00000526202 | LMO7-218 | 4121 | XM_024449354 | ENSP00000431129 | 1275 (aa) | XP_024305122 | E9PMS6 |
ENST00000534657 | LMO7-226 | 589 | - | ENSP00000434943 | 12 (aa) | - | E9PMJ6 |
ENST00000525914 | LMO7-217 | 874 | - | ENSP00000434083 | 292 (aa) | - | H0YDQ3 |
ENST00000533299 | LMO7-223 | 1845 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000467686 | LMO7-209 | 591 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000532785 | LMO7-222 | 599 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000482116 | LMO7-210 | 935 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000465309 | LMO7-208 | 572 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000321797 | LMO7-201 | 5647 | XM_017020574 | ENSP00000317802 | 1398 (aa) | XP_016876063 | E9PMT2 |
ENST00000489941 | LMO7-212 | 597 | - | ENSP00000431636 | 165 (aa) | - | E9PK58 |
ENST00000526371 | LMO7-219 | 650 | - | ENSP00000432269 | 165 (aa) | - | E9PRJ0 |
ENST00000485987 | LMO7-211 | 1087 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000377499 | LMO7-204 | 3472 | - | ENSP00000366719 | 1045 (aa) | - | E9PMP7 |
ENST00000605961 | LMO7-227 | 2039 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000526528 | LMO7-220 | 572 | - | ENSP00000434201 | 141 (aa) | - | E9PRE3 |
ENST00000357063 | LMO7-203 | 8237 | - | ENSP00000349571 | 1668 (aa) | - | J3KP06 |
ENST00000524651 | LMO7-214 | 914 | - | ENSP00000433591 | 305 (aa) | - | H0YDG6 |
ENST00000341547 | LMO7-202 | 7237 | XM_011535095 | ENSP00000342112 | 1349 (aa) | XP_011533397 | Q8WWI1 |
ENST00000525107 | LMO7-215 | 536 | - | ENSP00000435296 | 179 (aa) | - | H0YE95 |
ENST00000447038 | LMO7-206 | 3165 | - | ENSP00000388955 | 1055 (aa) | - | H0Y424 |
ENST00000377534 | LMO7-205 | 4896 | - | ENSP00000366757 | 1631 (aa) | - | F8WD26 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa04520 | Adherens junction | KEGG |
ensgID | Trait | pValue | Pubmed ID |
---|---|---|---|
ENSG00000136153 | Prostatic Neoplasms | 2.5330000E-005 | 18264096 |
ENSG00000136153 | Prostate-Specific Antigen | 6.914e-005 | - |
ENSG00000136153 | Prostate-Specific Antigen | 6.914e-005 | - |
ENSG00000136153 | Prostate-Specific Antigen | 6.914e-005 | - |
ENSG00000136153 | Prostate-Specific Antigen | 5.464e-005 | - |
ENSG00000136153 | Prostate-Specific Antigen | 5.464e-005 | - |
ENSG00000136153 | Waist Circumference | 4.1300000E-005 | - |
ENSG00000136153 | Waist Circumference | 8.6850000E-005 | - |
ENSG00000136153 | Waist Circumference | 1.0000000E-004 | - |
ENSG00000136153 | Astigmatism | 4E-6 | 23761726 |
ENSG00000136153 | Diabetes Mellitus, Type 1 | 6E-11 | 21980299 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000136153 | rs111870938 | 13 | 75680572 | C | Intraocular pressure | 29617998 | [0.074-0.13] unit decrease | 0.102 | EFO_0004695 |
ENSG00000136153 | rs9544020 | 13 | 75679111 | A | Intraocular pressure | 29617998 | [0.071-0.125] unit decrease | 0.098 | EFO_0004695 |
ENSG00000136153 | rs11841001 | 13 | 75674967 | A | Corneal astigmatism | 23761726 | [0.12-0.30] unit increase | 0.208 | HP_0000483 |
ENSG00000136153 | rs9530458 | 13 | 75675139 | T | Glaucoma (primary open-angle) | 29449654 | [1.11-1.19] | 1.148 | EFO_0004190 |
ENSG00000136153 | rs76082815 | 13 | 75821206 | T | Initial pursuit acceleration | 29064472 | EFO_0008434 | ||
ENSG00000136153 | rs76082815 | 13 | 75821206 | ? | Initial pursuit acceleration in psychotic disorders | 29064472 | EFO_0000692|EFO_0008434|EFO_0000289|EFO_0005411 | ||
ENSG00000136153 | rs76082815 | 13 | 75821206 | ? | Initial pursuit acceleration in psychotic disorders | 29064472 | EFO_0000692|EFO_0008434|EFO_0000289|EFO_0005411 | ||
ENSG00000136153 | rs7338461 | 13 | 75671406 | ? | Intraocular pressure | 30054594 | [0.064-0.114] unit increase | 0.0891 | EFO_0004695 |
ENSG00000136153 | rs3736858 | 13 | 75841243 | G | Interleukin-9 levels | 27989323 | [0.08-0.195] SD units increase | 0.1374 | EFO_0008192 |
ENSG00000136153 | rs539514 | 13 | 75752146 | ? | Type 1 diabetes | 21980299 | [NR] | 1.43 | EFO_0001359 |
ENSG00000136153 | rs9544022 | 13 | 75683130 | G | Intraocular pressure | 29785010 | [0.056-0.106] unit decrease | 0.081 | EFO_0004695 |
ENSG00000136153 | rs75502311 | 13 | 75856884 | ? | Obsessive-compulsive disorder | 30456828 | [0.23-0.56] unit increase | 0.397 | EFO_0004242 |
ENSG00000136153 | rs2224797 | 13 | 75636606 | ? | Mean corpuscular hemoglobin | 30595370 | EFO_0004527 | ||
ENSG00000136153 | rs2224797 | 13 | 75636606 | ? | Red blood cell count | 30595370 | EFO_0004305 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000136153 | LMO7 | 100 | 93.056 | ENSMUSG00000033060 | Lmo7 | 100 | 87.686 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | 10531035. | NAS | Component |
GO:0000209 | protein polyubiquitination | - | TAS | Process |
GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 10531035. | NAS | Function |
GO:0005634 | nucleus | 17067998. | IDA | Component |
GO:0005635 | nuclear envelope | 17067998. | IDA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | 17067998. | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
GO:0009986 | cell surface | 17067998. | IDA | Component |
GO:0016324 | apical plasma membrane | - | ISS | Component |
GO:0016567 | protein ubiquitination | 10531035. | NAS | Process |
GO:0023051 | regulation of signaling | - | IEA | Process |
GO:0030155 | regulation of cell adhesion | - | IEA | Process |
GO:0043687 | post-translational protein modification | - | TAS | Process |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 17067998. | IDA | Process |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |