Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCS | |||||||
UCS | |||||||
UCS | |||||||
UCS | |||||||
UVM | |||||||
UVM |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
---|---|---|---|
BLCA | |||
CHOL | |||
GBM | |||
LAML | |||
PRAD | |||
UCEC |
Cancer | P-value | Q-value |
---|---|---|
KIRC | ||
STAD | ||
MESO | ||
SKCM | ||
BRCA | ||
LAML | ||
UCEC | ||
LGG |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
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ENSP00000268489 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 4.6e-13 | 2 | 2 |
ENSP00000493252 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 4.6e-13 | 1 | 2 |
ENSP00000493252 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 4.6e-13 | 2 | 2 |
ENSP00000438926 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 2.9e-10 | 1 | 1 |
ENSP00000268489 | zf-met | PF12874.7 | 2.4e-06 | 1 | 1 |
ENSP00000493252 | zf-met | PF12874.7 | 2.4e-06 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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ENST00000397992 | ZFHX3-203 | 13841 | XM_017023251 | ENSP00000438926 | 2789 (aa) | XP_016878740 | Q15911 |
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ENST00000641077 | ZFHX3-207 | 942 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000641206 | ZFHX3-208 | 17219 | - | ENSP00000493252 | 3703 (aa) | - | Q15911 |
ENST00000358463 | ZFHX3-202 | 1308 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000268489 | ZFHX3-201 | 16064 | XM_005255957 | ENSP00000268489 | 3703 (aa) | XP_005256014 | Q15911 |
ENST00000642085 | ZFHX3-209 | 1603 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000558842 | ZFHX3-204 | 240 | - | - | - (aa) | - | - |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
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ensgID | Trait | pValue | Pubmed ID |
---|---|---|---|
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ENSG00000140836 | Cardiovascular Diseases | 1.7707092227539E-9 | 17903304 |
ENSG00000140836 | Cardiovascular Diseases | 3.1686443324061E-9 | 17903304 |
ENSG00000140836 | Cardiovascular Diseases | 2.61163771674666E-8 | 17903304 |
ENSG00000140836 | Cardiovascular Diseases | 2.39538039477632E-8 | 17903304 |
ENSG00000140836 | Cardiovascular Diseases | 2.3717326436264E-7 | 17903304 |
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ENSG00000140836 | Waist Circumference | 6.2680000E-005 | - |
ENSG00000140836 | Platelet Function Tests | 8.0100000E-006 | - |
ENSG00000140836 | Platelet Function Tests | 1.7762800E-005 | - |
ENSG00000140836 | Platelet Function Tests | 2.0018300E-005 | - |
ENSG00000140836 | Vitamin B 6 | 7.6570000E-005 | - |
ENSG00000140836 | Plaque, Atherosclerotic | 1.8810000E-005 | 21909108 |
ENSG00000140836 | Atrial Fibrillation | 1E-10 | 19597491 |
ENSG00000140836 | Atrial Fibrillation | 5E-10 | 27790247 |
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ENSG00000140836 | Neoplasms | 5E-10 | 27790247 |
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ENSG00000140836 | Atrial Fibrillation | 2E-15 | 19597492 |
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ENSG00000140836 | Hypospadias | 1E-18 | 25108383 |
ENSG00000140836 | Atrial Fibrillation | 3E-11 | 27790247 |
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ENSG00000140836 | Neoplasms | 3E-11 | 27790247 |
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ENSG00000140836 | Body Mass Index | 3E-11 | 27790247 |
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ENSG00000140836 | Mucocutaneous Lymph Node Syndrome | 2E-6 | 19132087 |
ENSG00000140836 | Embolism | 2E-10 | 26708676 |
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ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
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ENSG00000140836 | rs1858800 | 16 | 72990377 | T | Hypospadias | 25108383 | [NR] | 1.36 | EFO_0004209 |
ENSG00000140836 | rs143661751 | 16 | 73688392 | G | Post bronchodilator FEV1/FVC ratio | 26634245 | unit increase | 0.464 | GO_0097366|EFO_0004713 |
ENSG00000140836 | rs427576 | 16 | 73795371 | C | Thiazide-induced adverse metabolic effects in hypertensive patients | 23400010 | [1.5-3.74] mg/dL decrease | 2.62 | EFO_0005202|EFO_0004465 |
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ENSG00000140836 | rs16971384 | 16 | 72897186 | A | LDL cholesterol | 21347282 | [0.041-0.102] unit decrease | 0.0715 | EFO_0004611 |
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ENSG00000140836 | rs16971465 | 16 | 72983162 | C | Schizophrenia | 26198764 | [NR] | 1.08 | EFO_0000692 |
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ENSG00000140836 | rs764255 | 16 | 73679784 | T | Word reading | 23738518 | [0.048-0.106] unit decrease | 0.077 | EFO_0005300 |
ENSG00000140836 | rs2106261 | 16 | 73017721 | T | Atrial fibrillation | 22544366 | [1.17-1.30] | 1.24 | EFO_0000275 |
ENSG00000140836 | rs7191888 | 16 | 73547159 | ? | Multiple sclerosis (severity) | 19010793 | [NR] | EFO_0003885 | |
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ENSG00000140836 | rs7193343 | 16 | 72995261 | T | Atrial fibrillation | 19597491 | [1.14-1.29] | 1.21 | EFO_0000275 |
ENSG00000140836 | rs2106261 | 16 | 73017721 | T | Atrial fibrillation | 19597492 | 1.25 | EFO_0000275 | |
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ENSG00000140836 | rs4788694 | 16 | 73036184 | G | Body mass index | 28892062 | [0.013-0.029] kg/m2 decrease | 0.021 | EFO_0004340 |
ENSG00000140836 | rs756717 | 16 | 72962263 | A | Body mass index | 28892062 | [0.0091-0.0209] kg/m2 decrease | 0.015 | EFO_0004340 |
ENSG00000140836 | rs4404097 | 16 | 72998133 | A | Atrial fibrillation | 29290336 | [1.12-1.24] | 1.18 | EFO_0000275 |
ENSG00000140836 | rs1364064 | 16 | 73428587 | ? | Colonoscopy-negative controls vs population controls | 29228715 | [NR] | 1.393 | EFO_0008460 |
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ENSG00000140836 | rs2106261 | 16 | 73017721 | T | Atrial fibrillation | 28416818 | [1.17-1.37] | 1.2 | EFO_0000275 |
ENSG00000140836 | rs2106261 | 16 | 73017721 | T | Atrial fibrillation | 28416818 | [1.20-1.35] | 1.27 | EFO_0000275 |
ENSG00000140836 | rs2106261 | 16 | 73017721 | T | Early onset atrial fibrillation | 28460022 | [1.83-2.36] | 2.08 | EFO_0000275 |
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Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 84 | 88.186 | ENSAPLG00000002327 | ZFHX3 | 99 | 86.268 | Anas_platyrhynchos |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 97.929 | ENSANAG00000033325 | ZFHX3 | 100 | 97.849 | Aotus_nancymaae |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 94.552 | ENSCLAG00000007000 | ZFHX3 | 100 | 95.535 | Chinchilla_lanigera |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 98.920 | ENSCANG00000034216 | ZFHX3 | 100 | 98.920 | Colobus_angolensis_palliatus |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 98.734 | ENSMFAG00000034225 | ZFHX3 | 100 | 98.734 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 98.653 | ENSMMUG00000021041 | ZFHX3 | 100 | 98.330 | Macaca_mulatta |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 98.653 | ENSMNEG00000030137 | ZFHX3 | 100 | 98.653 | Macaca_nemestrina |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 98.812 | ENSMLEG00000042563 | ZFHX3 | 100 | 98.812 | Mandrillus_leucophaeus |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 65.576 | ENSMAMG00000021509 | zfhx3 | 100 | 62.687 | Mastacembelus_armatus |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 78 | 89.478 | ENSMGAG00000008764 | ZFHX3 | 97 | 89.226 | Meleagris_gallopavo |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 93.152 | ENSMAUG00000000602 | Zfhx3 | 100 | 93.502 | Mesocricetus_auratus |
ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 95.967 | ENSMICG00000003537 | ZFHX3 | 100 | 95.939 | Microcebus_murinus |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 100 | 91.876 | ENSNGAG00000001724 | Zfhx3 | 100 | 92.362 | Nannospalax_galili |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 86 | 91.147 | ENSOANG00000005084 | ZFHX3 | 100 | 90.780 | Ornithorhynchus_anatinus |
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ENSG00000140836 | ZFHX3 | 96 | 67.964 | ENSPKIG00000009598 | zfhx3 | 98 | 63.415 | Paramormyrops_kingsleyae |
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