Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
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OV | |||||||
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PAAD | |||||||
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READ | |||||||
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READ | |||||||
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SARC | |||||||
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UCEC | |||||||
UCEC |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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BLCA | |||
BRCA | |||
CESC | |||
CHOL | |||
ESCA | |||
HNSC | |||
KIRP | |||
LIHC | |||
LUAD | |||
MESO | |||
PRAD | |||
READ | |||
SARC | |||
STAD | |||
TGCT | |||
UCS |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
STAD | ||
SARC | ||
MESO | ||
UCS | ||
HNSC | ||
LUSC | ||
COAD | ||
UCEC | ||
LGG | ||
LUAD |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000413094 | RNase_Zc3h12a | PF11977.8 | 7.4e-65 | 1 | 1 |
ENSP00000278590 | RNase_Zc3h12a | PF11977.8 | 7.8e-65 | 1 | 1 |
ENSP00000431821 | RNase_Zc3h12a | PF11977.8 | 7.8e-65 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000528673 | ZC3H12C-203 | 2931 | XM_017018477 | ENSP00000431821 | 884 (aa) | XP_016873966 | Q9C0D7 |
ENST00000278590 | ZC3H12C-201 | 8807 | - | ENSP00000278590 | 883 (aa) | - | Q9C0D7 |
ENST00000453089 | ZC3H12C-202 | 9542 | XM_005271715 | ENSP00000413094 | 852 (aa) | XP_005271772 | E9PP00 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000149289 | rs746463 | 11 | 110125219 | ? | Exercise treadmill test traits | 17903301 | EFO_0004328 | ||
ENSG00000149289 | rs661171 | 11 | 110145794 | G | Plasma parathyroid hormone levels | 30134803 | [0.12-0.28] unit increase | 0.2 | EFO_0004752 |
ENSG00000149289 | rs10789752 | 11 | 110109220 | T | High density lipoprotein cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.018 | EFO_0004612 |
ENSG00000149289 | rs661171 | 11 | 110145794 | ? | Lipid traits (pleiotropy) (HIPO component 1) | 30289880 | EFO_0004574|EFO_0004530|EFO_0004611|EFO_0004612 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Paralog | Gene Symbol | Coverage | Identiy |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 96 | 52.941 | ENSG00000102053 | ZC3H12B | 99 | 52.941 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.213 | ENSAMEG00000009188 | ZC3H12C | 100 | 93.213 | Ailuropoda_melanoleuca |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 73 | 88.640 | ENSAPLG00000002854 | ZC3H12C | 100 | 88.640 | Anas_platyrhynchos |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 84.579 | ENSACAG00000001031 | ZC3H12C | 97 | 83.959 | Anolis_carolinensis |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 97.418 | ENSANAG00000026999 | ZC3H12C | 100 | 97.398 | Aotus_nancymaae |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.028 | ENSBTAG00000008732 | ZC3H12C | 99 | 92.027 | Bos_taurus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 96.493 | ENSCJAG00000010319 | ZC3H12C | 100 | 96.493 | Callithrix_jacchus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 89.944 | ENSCAFG00000014297 | ZC3H12C | 100 | 89.944 | Canis_familiaris |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 89.801 | ENSCAFG00020006999 | ZC3H12C | 99 | 89.852 | Canis_lupus_dingo |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.497 | ENSCHIG00000021221 | ZC3H12C | 99 | 92.483 | Capra_hircus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 91 | 93.353 | ENSTSYG00000005412 | ZC3H12C | 92 | 93.353 | Carlito_syrichta |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 90.023 | ENSCAPG00000011610 | ZC3H12C | 99 | 89.726 | Cavia_aperea |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 89.906 | ENSCPOG00000032962 | ZC3H12C | 100 | 89.706 | Cavia_porcellus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 97.183 | ENSCCAG00000022395 | ZC3H12C | 100 | 97.183 | Cebus_capucinus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.474 | ENSCATG00000041641 | ZC3H12C | 100 | 98.077 | Cercocebus_atys |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.075 | ENSCLAG00000012577 | ZC3H12C | 100 | 93.075 | Chinchilla_lanigera |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 97.887 | ENSCSAG00000002945 | ZC3H12C | 99 | 97.605 | Chlorocebus_sabaeus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 87.354 | ENSCHOG00000013202 | - | 100 | 87.557 | Choloepus_hoffmanni |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 85.864 | ENSCPBG00000021043 | ZC3H12C | 100 | 85.864 | Chrysemys_picta_bellii |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.122 | ENSCANG00000040994 | ZC3H12C | 100 | 97.851 | Colobus_angolensis_palliatus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.427 | ENSCGRG00001013672 | Zc3h12c | 99 | 93.273 | Cricetulus_griseus_chok1gshd |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.427 | ENSCGRG00000001308 | Zc3h12c | 98 | 92.744 | Cricetulus_griseus_crigri |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 91.803 | ENSDNOG00000013040 | ZC3H12C | 100 | 90.858 | Dasypus_novemcinctus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 90.962 | ENSDORG00000009134 | Zc3h12c | 99 | 90.525 | Dipodomys_ordii |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 73 | 95.680 | ENSETEG00000008027 | ZC3H12C | 100 | 95.680 | Echinops_telfairi |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 94.131 | ENSEASG00005010098 | ZC3H12C | 99 | 94.071 | Equus_asinus_asinus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 94.014 | ENSECAG00000000462 | ZC3H12C | 100 | 94.014 | Equus_caballus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 67 | 91.419 | ENSEEUG00000005709 | - | 100 | 91.419 | Erinaceus_europaeus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 91.549 | ENSFCAG00000010665 | ZC3H12C | 100 | 91.506 | Felis_catus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 84.714 | ENSFALG00000008776 | ZC3H12C | 99 | 84.467 | Ficedula_albicollis |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.779 | ENSFDAG00000017997 | ZC3H12C | 100 | 93.779 | Fukomys_damarensis |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 84.014 | ENSGALG00000017154 | ZC3H12C | 100 | 84.014 | Gallus_gallus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 95 | 84.048 | ENSGAGG00000024154 | ZC3H12C | 86 | 84.394 | Gopherus_agassizii |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 99.434 | ENSGGOG00000010117 | ZC3H12C | 100 | 99.434 | Gorilla_gorilla |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.545 | ENSHGLG00000019021 | ZC3H12C | 99 | 93.387 | Heterocephalus_glaber_female |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.545 | ENSHGLG00100007295 | ZC3H12C | 99 | 93.387 | Heterocephalus_glaber_male |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 95.775 | ENSSTOG00000022143 | ZC3H12C | 100 | 95.776 | Ictidomys_tridecemlineatus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 94.014 | ENSJJAG00000001147 | Zc3h12c | 100 | 93.836 | Jaculus_jaculus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 76.212 | ENSLACG00000009305 | ZC3H12C | 99 | 75.531 | Latimeria_chalumnae |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 74 | 96.332 | ENSLAFG00000016296 | ZC3H12C | 100 | 96.332 | Loxodonta_africana |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.474 | ENSMFAG00000042068 | ZC3H12C | 100 | 98.077 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.474 | ENSMMUG00000048435 | ZC3H12C | 100 | 98.077 | Macaca_mulatta |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.474 | ENSMNEG00000032663 | ZC3H12C | 100 | 98.474 | Macaca_nemestrina |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 98.357 | ENSMLEG00000032083 | ZC3H12C | 100 | 97.964 | Mandrillus_leucophaeus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 83.450 | ENSMGAG00000015143 | ZC3H12C | 100 | 82.957 | Meleagris_gallopavo |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.380 | ENSMAUG00000020412 | Zc3h12c | 99 | 92.132 | Mesocricetus_auratus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 96.362 | ENSMICG00000011455 | ZC3H12C | 100 | 96.362 | Microcebus_murinus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.840 | ENSMOCG00000020090 | Zc3h12c | 99 | 92.694 | Microtus_ochrogaster |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 90.187 | ENSMODG00000014555 | ZC3H12C | 100 | 90.187 | Monodelphis_domestica |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.723 | MGP_CAROLIEiJ_G0032210 | Zc3h12c | 99 | 92.588 | Mus_caroli |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.723 | ENSMUSG00000035164 | Zc3h12c | 99 | 92.588 | Mus_musculus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 91.549 | MGP_PahariEiJ_G0015078 | Zc3h12c | 99 | 91.334 | Mus_pahari |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 92.723 | MGP_SPRETEiJ_G0033350 | Zc3h12c | 99 | 92.588 | Mus_spretus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 87.559 | ENSMPUG00000005888 | ZC3H12C | 97 | 87.785 | Mustela_putorius_furo |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.545 | ENSMLUG00000017189 | ZC3H12C | 100 | 93.379 | Myotis_lucifugus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 93.897 | ENSNGAG00000023957 | Zc3h12c | 99 | 93.836 | Nannospalax_galili |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 99.178 | ENSNLEG00000029829 | ZC3H12C | 100 | 99.095 | Nomascus_leucogenys |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 87.485 | ENSMEUG00000015398 | ZC3H12C | 100 | 86.689 | Notamacropus_eugenii |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 74 | 83.677 | ENSOPRG00000003370 | - | 96 | 83.677 | Ochotona_princeps |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 90.845 | ENSODEG00000011026 | ZC3H12C | 99 | 90.080 | Octodon_degus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 74 | 85.127 | ENSOANG00000006242 | - | 99 | 85.127 | Ornithorhynchus_anatinus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 94.131 | ENSOCUG00000005283 | ZC3H12C | 99 | 93.957 | Oryctolagus_cuniculus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 94.138 | ENSOGAG00000013223 | ZC3H12C | 100 | 93.898 | Otolemur_garnettii |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 87.557 | ENSOARG00000012999 | ZC3H12C | 97 | 92.914 | Ovis_aries |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 99.774 | ENSPPAG00000041914 | ZC3H12C | 100 | 99.774 | Pan_paniscus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 91.315 | ENSPPRG00000006582 | ZC3H12C | 100 | 91.280 | Panthera_pardus |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 87 | 88.735 | ENSPTIG00000009995 | ZC3H12C | 99 | 88.941 | Panthera_tigris_altaica |
ENSG00000149289 | ZC3H12C | 100 | 99.774 | ENSPTRG00000050494 | ZC3H12C | 100 | 99.774 | Pan_troglodytes |
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