Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
STAD | ||
MESO | ||
ACC | ||
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LGG |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000282928 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 2e-20 | 1 | 3 |
ENSP00000282928 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 2e-20 | 2 | 3 |
ENSP00000282928 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 2e-20 | 3 | 3 |
ENSP00000419664 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 1.1e-09 | 1 | 2 |
ENSP00000419664 | zf-C2H2 | PF00096.26 | 1.1e-09 | 2 | 2 |
ENSP00000419664 | zf-met | PF12874.7 | 0.00013 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000282928 | ZIC1-201 | 5241 | - | ENSP00000282928 | 447 (aa) | - | Q15915 |
ENST00000481840 | ZIC1-204 | 418 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000472523 | ZIC1-202 | 567 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000474034 | ZIC1-203 | 1044 | NR_121655 | - | - (aa) | - | - |
ENST00000488404 | ZIC1-205 | 539 | - | ENSP00000419664 | 136 (aa) | - | H7C5D8 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000152977 | rs530580221 | 3 | 147394469 | T | Age at first sexual intercourse | 27089180 | [0.017-0.034] unit increase | 0.0257722 | EFO_0009749 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000152977 | ZIC1 | 89 | 80.165 | ENSACIG00000018732 | zic1 | 93 | 86.280 | Amphilophus_citrinellus |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 70 | 100.000 | ENSCAFG00000032541 | - | 100 | 100.000 | Canis_familiaris |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 100 | 55.670 | ENSEBUG00000002180 | zic1 | 100 | 56.735 | Eptatretus_burgeri |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 100 | 55.670 | ENSEBUG00000006709 | zic1 | 100 | 56.735 | Eptatretus_burgeri |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 89 | 97.521 | ENSFDAG00000013872 | ZIC1 | 100 | 99.265 | Fukomys_damarensis |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 100 | 87.248 | ENSKMAG00000011689 | zic1 | 100 | 86.353 | Kryptolebias_marmoratus |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 92 | 58.553 | ENSOANG00000007365 | - | 90 | 69.333 | Ornithorhynchus_anatinus |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 89 | 81.818 | ENSORLG00020012199 | zic1 | 92 | 82.500 | Oryzias_latipes_hni |
ENSG00000152977 | ZIC1 | 89 | 95.868 | ENSSHAG00000015025 | ZIC1 | 100 | 96.133 | Sarcophilus_harrisii |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000977 | RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding | 21873635. | IBA | Function |
GO:0000978 | RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding | - | IEA | Function |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 21873635. | IBA | Function |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | - | ISA | Function |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | 19274049. | NAS | Function |
GO:0001228 | DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific | - | IEA | Function |
GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | - | ISS | Function |
GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 8542595. | TAS | Function |
GO:0005634 | nucleus | 21873635. | IBA | Component |
GO:0005634 | nucleus | 8542595. | IDA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | - | IEA | Component |
GO:0007389 | pattern specification process | - | ISS | Process |
GO:0007417 | central nervous system development | 21873635. | IBA | Process |
GO:0007420 | brain development | 8542595. | IDA | Process |
GO:0007628 | adult walking behavior | - | IEA | Process |
GO:0008589 | regulation of smoothened signaling pathway | - | ISS | Process |
GO:0021510 | spinal cord development | - | IEA | Process |
GO:0030154 | cell differentiation | - | IEA | Process |
GO:0042307 | positive regulation of protein import into nucleus | - | ISS | Process |
GO:0042472 | inner ear morphogenesis | - | ISS | Process |
GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-templated | - | ISS | Process |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | - | IEA | Process |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |