Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
ACC | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BRCA | |||||||
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BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
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CESC | |||||||
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CHOL | |||||||
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ESCA | |||||||
GBM | |||||||
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HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
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KIRC | |||||||
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OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
PAAD | |||||||
PAAD | |||||||
PRAD | |||||||
READ | |||||||
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READ | |||||||
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SARC | |||||||
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UCEC | |||||||
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UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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ACC | |||
CESC | |||
DLBC | |||
KIRC | |||
LAML | |||
LGG | |||
LIHC | |||
PAAD | |||
TGCT | |||
THCA | |||
UCEC | |||
UCS |
Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
SARC | ||
MESO | ||
SKCM | ||
LUSC | ||
BRCA | ||
ESCA | ||
COAD | ||
LAML | ||
LIHC | ||
CHOL | ||
LUAD |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000497119 | ZYX-210 | 560 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000436448 | ZYX-204 | 632 | - | ENSP00000411230 | 176 (aa) | - | H7C3D3 |
ENST00000322764 | ZYX-201 | 2493 | XM_017012587 | ENSP00000324422 | 572 (aa) | XP_016868076 | Q15942 |
ENST00000446634 | ZYX-205 | 926 | - | ENSP00000403714 | 171 (aa) | - | C9JJK5 |
ENST00000457235 | ZYX-207 | 703 | - | ENSP00000400537 | 164 (aa) | - | C9IZ41 |
ENST00000477373 | ZYX-209 | 504 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000449630 | ZYX-206 | 533 | - | ENSP00000413467 | 177 (aa) | - | H7C3R3 |
ENST00000468083 | ZYX-208 | 1146 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000354434 | ZYX-202 | 2050 | XM_011516569 | ENSP00000346417 | 540 (aa) | - | H0Y2Y8 |
ENST00000392910 | ZYX-203 | 2123 | - | ENSP00000376642 | 415 (aa) | - | Q15942 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa04510 | Focal adhesion | KEGG |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000159840 | rs11772895 | 7 | 143384849 | C | White blood cell count (basophil) | 27863252 | [0.015-0.031] unit increase | 0.02311239 | EFO_0005090 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000159840 | ZYX | 91 | 46.835 | ENSG00000087077 | TRIP6 | 91 | 40.609 | Homo_sapiens |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0001725 | stress fiber | 18297730.24036928. | IDA | Component |
GO:0003723 | RNA binding | 22658674. | HDA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 10831611.22665060.23840749.25416956.26871637. | IPI | Function |
GO:0005634 | nucleus | 24036928. | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0005913 | cell-cell adherens junction | 8940160. | IDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 12417594.18297730. | IDA | Component |
GO:0007160 | cell-matrix adhesion | 24036928. | IC | Process |
GO:0007179 | transforming growth factor beta receptor signaling pathway | 24036928. | IMP | Process |
GO:0007229 | integrin-mediated signaling pathway | 24036928. | IMP | Process |
GO:0007267 | cell-cell signaling | 8940160. | TAS | Process |
GO:0016032 | viral process | - | IEA | Process |
GO:0043149 | stress fiber assembly | 24036928. | IMP | Process |
GO:0045335 | phagocytic vesicle | - | IEA | Component |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |
GO:0050727 | regulation of inflammatory response | - | IEA | Process |
GO:0071346 | cellular response to interferon-gamma | - | IEA | Process |