Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
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CESC | ||
READ | ||
KICH | ||
UCEC | ||
GBM | ||
LIHC | ||
LGG |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
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ENST00000484447 | USP24-205 | 614 | - | ENSP00000489026 | 150 (aa) | - | A0A0U1RQI9 |
ENST00000294383 | USP24-201 | 10549 | XM_005270690 | ENSP00000294383 | 2620 (aa) | XP_005270747 | Q9UPU5 |
ENST00000512504 | USP24-206 | 568 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000472566 | USP24-202 | 731 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000480962 | USP24-203 | 406 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000482197 | USP24-204 | 600 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000634589 | USP24-207 | 370 | - | ENSP00000489531 | 34 (aa) | - | A0A0U1RRH2 |
ensgID | Trait | pValue | Pubmed ID |
---|---|---|---|
ENSG00000162402 | Cholesterol, LDL | 3.069e-005 | 19060910 |
ENSG00000162402 | Personality | 5.319e-005 | - |
ENSG00000162402 | Cholesterol | 6E-73 | 25961943 |
ENSG00000162402 | Paliperidone Palmitate | 8E-6 | 27846195 |
ENSG00000162402 | Schizophrenia | 8E-6 | 27846195 |
ENSG00000162402 | Bronchial Provocation Tests | 5E-7 | 25514360 |
ENSG00000162402 | Pulmonary Disease, Chronic Obstructive | 5E-7 | 25514360 |
ENSG00000162402 | Bronchial Provocation Tests | 9E-8 | 25514360 |
ENSG00000162402 | Pulmonary Disease, Chronic Obstructive | 9E-8 | 25514360 |
ENSG00000162402 | Lipoproteins | 5E-56 | 27005778 |
ENSG00000162402 | Metabolism | 5E-56 | 27005778 |
ENSG00000162402 | Lipids | 2E-17 | 23726366 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000162402 | rs113353280 | 1 | 55180186 | A | Response to paliperidone in schizophrenia (positive Marder score) | 27846195 | [NR] unit decrease | 5.8417 | EFO_0000692|EFO_0007925|EFO_0007927 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | A | Metabolite levels (lipoprotein measures) | 27005778 | [0.44-0.56] unit decrease | 0.5 | EFO_0004732|EFO_0005664 |
ENSG00000162402 | rs17111652 | 1 | 55124792 | T | Airway responsiveness in chronic obstructive pulmonary disease | 25514360 | [NR] unit decrease | 0.234 | EFO_0006897|EFO_0000341 |
ENSG00000162402 | rs17111652 | 1 | 55124792 | T | Airway responsiveness in chronic obstructive pulmonary disease | 25514360 | [NR] unit decrease | 0.071 | EFO_0006897|EFO_0000341 |
ENSG00000162402 | rs17111684 | 1 | 55159875 | A | LDL cholesterol | 23726366 | [NR] unit decrease | 9.01 | EFO_0004529 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | G | Blood protein levels | 30072576 | [0.85-1.29] unit increase | 1.069 | EFO_0007937 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | G | Low density lipoprotein cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.394 | EFO_0004611 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | G | Low density lipoprotein cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.388 | EFO_0004611 |
ENSG00000162402 | rs287227 | 1 | 55190402 | G | Low density lipoprotein cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.077 | EFO_0004611 |
ENSG00000162402 | rs287227 | 1 | 55190402 | G | Low density lipoprotein cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.071 | EFO_0004611 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | G | Total cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.339 | EFO_0004574 |
ENSG00000162402 | rs191448950 | 1 | 55119171 | G | Total cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.338 | EFO_0004574 |
ENSG00000162402 | rs287227 | 1 | 55190402 | G | Total cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.072 | EFO_0004574 |
ENSG00000162402 | rs287227 | 1 | 55190402 | G | Total cholesterol levels | 29507422 | unit increase | 0.067 | EFO_0004574 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000162402 | USP24 | 100 | 97.748 | ENSMUSG00000028514 | Usp24 | 100 | 97.748 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0004197 | cysteine-type endopeptidase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0004843 | thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | 21873635. | IBA | Component |
GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | - | IEA | Process |
GO:0016579 | protein deubiquitination | 21873635. | IBA | Process |
GO:0016579 | protein deubiquitination | - | TAS | Process |
GO:0036459 | thiol-dependent ubiquitinyl hydrolase activity | - | TAS | Function |