Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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UCEC |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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KIRC | |||
LGG |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
SARC | ||
MESO | ||
ACC | ||
UCS | ||
SKCM | ||
PRAD | ||
KIRP | ||
PAAD | ||
PCPG | ||
READ | ||
KICH | ||
UCEC | ||
LIHC |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000260810 | TOPBP1-201 | 5378 | XM_011512357 | ENSP00000260810 | 1522 (aa) | XP_011510659 | Q92547 |
ENST00000642236 | TOPBP1-210 | 6152 | XM_005247076 | ENSP00000493612 | 1517 (aa) | XP_005247133 | A0A2R8YD63 |
ENST00000513818 | TOPBP1-208 | 898 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000511439 | TOPBP1-207 | 1142 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000503338 | TOPBP1-202 | 618 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000509162 | TOPBP1-206 | 811 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000503464 | TOPBP1-203 | 525 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000572787 | TOPBP1-209 | 402 | - | ENSP00000458790 | 50 (aa) | - | I3L1F2 |
ENST00000505804 | TOPBP1-204 | 472 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000506779 | TOPBP1-205 | 536 | - | - | - (aa) | - | - |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa03440 | Homologous recombination | KEGG |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000794 | condensed nuclear chromosome | - | IEA | Component |
GO:0000922 | spindle pole | - | IEA | Component |
GO:0001673 | male germ cell nucleus | - | IEA | Component |
GO:0003677 | DNA binding | - | IEA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 12773567.17006541.17887956.17913746.18923429.20080954.21659603. | IPI | Function |
GO:0005634 | nucleus | - | IDA | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
GO:0005694 | chromosome | 21659603. | IDA | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | - | IEA | Component |
GO:0005815 | microtubule organizing center | - | IEA | Component |
GO:0006259 | DNA metabolic process | 9461304. | TAS | Process |
GO:0006260 | DNA replication | - | TAS | Process |
GO:0006281 | DNA repair | 12773567. | NAS | Process |
GO:0006974 | cellular response to DNA damage stimulus | 12773567. | IDA | Process |
GO:0008022 | protein C-terminus binding | 9461304. | TAS | Function |
GO:0010212 | response to ionizing radiation | 12773567. | IDA | Process |
GO:0015629 | actin cytoskeleton | - | IDA | Component |
GO:0016604 | nuclear body | - | IDA | Component |
GO:0016605 | PML body | 12773567. | IDA | Component |
GO:0033314 | mitotic DNA replication checkpoint | 21873635. | IBA | Process |
GO:0042802 | identical protein binding | 17006541. | IPI | Function |
GO:1901796 | regulation of signal transduction by p53 class mediator | - | TAS | Process |