Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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CESC | |||
HNSC | |||
KICH | |||
KIRP | |||
LIHC | |||
LUAD | |||
MESO | |||
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READ |
Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
STAD | ||
ACC | ||
HNSC | ||
SKCM | ||
KIRP | ||
PAAD | ||
PCPG | ||
KICH | ||
DLBC |
PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
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24928548 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
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ENST00000561248 | COPS2-208 | 575 | - | ENSP00000453412 | 183 (aa) | - | H0YM03 |
ENST00000560240 | COPS2-207 | 514 | - | ENSP00000453546 | 55 (aa) | - | H0YMC2 |
ENST00000542928 | COPS2-203 | 1580 | - | ENSP00000443664 | 379 (aa) | - | B4DIH5 |
ENST00000299259 | COPS2-201 | 2036 | - | ENSP00000299259 | 450 (aa) | - | P61201 |
ENST00000388901 | COPS2-202 | 6628 | - | ENSP00000373553 | 443 (aa) | - | P61201 |
ENST00000559016 | COPS2-206 | 570 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000558545 | COPS2-204 | 668 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000558843 | COPS2-205 | 803 | - | ENSP00000452944 | 263 (aa) | - | H0YKU5 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000166200 | rs79234094 | 15 | 49117330 | A | Lung function (FEV1/FVC) | 30804560 | [0.022-0.032] unit increase | 0.0268 | EFO_0004713 |
ENSG00000166200 | rs79234094 | 15 | 49117330 | A | Peak expiratory flow | 30804560 | [0.015-0.027] unit increase | 0.0209 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
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ENSG00000166200 | COPS2 | 100 | 100.000 | ENSMUSG00000027206 | Cops2 | 100 | 100.000 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000122 | negative regulation of transcription by RNA polymerase II | - | IEA | Process |
GO:0000338 | protein deneddylation | 19141280. | IDA | Process |
GO:0000715 | nucleotide-excision repair, DNA damage recognition | - | TAS | Process |
GO:0001833 | inner cell mass cell proliferation | - | IEA | Process |
GO:0003714 | transcription corepressor activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 17438371.20399188.21911577.23441852.24421388.25043011. | IPI | Function |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | TAS | Component |
GO:0005737 | cytoplasm | 9535219. | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0006283 | transcription-coupled nucleotide-excision repair | - | TAS | Process |
GO:0006366 | transcription by RNA polymerase II | 7776974. | TAS | Process |
GO:0006468 | protein phosphorylation | 9535219. | IDA | Process |
GO:0007165 | signal transduction | 9535219. | NAS | Process |
GO:0008180 | COP9 signalosome | 21873635. | IBA | Component |
GO:0008180 | COP9 signalosome | 9535219.18850735. | IDA | Component |
GO:0030182 | neuron differentiation | - | IEA | Process |
GO:0035914 | skeletal muscle cell differentiation | - | IEA | Process |
GO:0043687 | post-translational protein modification | - | TAS | Process |
GO:0045892 | negative regulation of transcription, DNA-templated | 21873635. | IBA | Process |
GO:1903507 | negative regulation of nucleic acid-templated transcription | - | ISS | Process |