Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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READ | |||||||
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UCS | |||||||
UCS | |||||||
UCS | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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THCA |
Cancer | P-value | Q-value |
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KIRC | ||
STAD | ||
MESO | ||
LUSC | ||
KIRP | ||
PAAD | ||
LAML | ||
LGG | ||
CHOL | ||
UVM |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000308012 | RRM_5 | PF13893.6 | 1.6e-12 | 1 | 2 |
ENSP00000308012 | RRM_5 | PF13893.6 | 1.6e-12 | 2 | 2 |
ENSP00000362197 | RRM_5 | PF13893.6 | 9e-06 | 1 | 2 |
ENSP00000362197 | RRM_5 | PF13893.6 | 9e-06 | 2 | 2 |
ENSP00000308012 | RRM_1 | PF00076.22 | 8.5e-77 | 1 | 4 |
ENSP00000308012 | RRM_1 | PF00076.22 | 8.5e-77 | 2 | 4 |
ENSP00000308012 | RRM_1 | PF00076.22 | 8.5e-77 | 3 | 4 |
ENSP00000308012 | RRM_1 | PF00076.22 | 8.5e-77 | 4 | 4 |
ENSP00000362197 | RRM_1 | PF00076.22 | 4.9e-42 | 1 | 2 |
ENSP00000362197 | RRM_1 | PF00076.22 | 4.9e-42 | 2 | 2 |
PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
---|---|---|---|---|---|
23275553 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000312600 | PABPC5-201 | 3221 | - | ENSP00000308012 | 382 (aa) | - | Q96DU9 |
ENST00000373105 | PABPC5-202 | 1262 | - | ENSP00000362197 | 218 (aa) | - | Q5JQF3 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Paralog | Gene Symbol | Coverage | Identiy |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000174740 | PABPC5 | 92 | 33.803 | ENSG00000151923 | TIAL1 | 98 | 34.783 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 74 | 30.508 | ENSG00000180098 | TRNAU1AP | 58 | 30.409 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 74 | 30.952 | ENSG00000135486 | HNRNPA1 | 74 | 30.952 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 93 | 59.694 | ENSG00000186288 | PABPC1L2A | 98 | 59.375 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 96 | 31.356 | ENSG00000179950 | PUF60 | 63 | 31.447 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 59.155 | ENSG00000151846 | PABPC3 | 58 | 62.360 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 98 | 64.690 | ENSG00000070756 | PABPC1 | 99 | 74.766 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 64.319 | ENSG00000090621 | PABPC4 | 99 | 72.973 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 96 | 59.504 | ENSG00000101104 | PABPC1L | 95 | 57.235 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 81 | 35.135 | ENSG00000101489 | CELF4 | 51 | 35.135 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 97 | 35.802 | ENSG00000107105 | ELAVL2 | 89 | 35.802 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 59.624 | ENSG00000254535 | PABPC4L | 98 | 61.798 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 93 | 59.694 | ENSG00000184388 | PABPC1L2B | 98 | 59.375 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 78 | 34.524 | ENSG00000122566 | HNRNPA2B1 | 62 | 37.500 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 93 | 40.769 | ENSG00000143368 | SF3B4 | 72 | 40.152 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 93 | 33.333 | ENSG00000116001 | TIA1 | 97 | 30.201 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 87 | 30.939 | ENSG00000147140 | NONO | 70 | 30.939 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 69 | 35.616 | ENSG00000159409 | CELF3 | 53 | 35.616 |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 80 | 37.349 | ENSG00000104177 | MYEF2 | 66 | 37.805 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.375 | ENSAMEG00000020114 | PABPC5 | 100 | 97.375 | Ailuropoda_melanoleuca |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 100.000 | ENSANAG00000005063 | PABPC5 | 100 | 100.000 | Aotus_nancymaae |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.850 | ENSBTAG00000019942 | PABPC5 | 99 | 96.850 | Bos_taurus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.476 | ENSCJAG00000003665 | PABPC5 | 100 | 99.476 | Callithrix_jacchus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.850 | ENSCAFG00000017452 | PABPC5 | 99 | 96.850 | Canis_familiaris |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.850 | ENSCHIG00000019004 | PABPC5 | 99 | 96.850 | Capra_hircus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.900 | ENSTSYG00000036351 | PABPC5 | 99 | 97.900 | Carlito_syrichta |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 87.958 | ENSCAPG00000010714 | PABPC5 | 99 | 88.421 | Cavia_aperea |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 94.488 | ENSCPOG00000002555 | PABPC5 | 99 | 94.488 | Cavia_porcellus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 100.000 | ENSCCAG00000032154 | PABPC5 | 100 | 100.000 | Cebus_capucinus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSCATG00000043083 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Cercocebus_atys |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 95.801 | ENSCLAG00000000647 | PABPC5 | 99 | 95.801 | Chinchilla_lanigera |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSCSAG00000000065 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Chlorocebus_sabaeus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSCANG00000011473 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Colobus_angolensis_palliatus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 94.226 | ENSCGRG00000018699 | Pabpc5 | 99 | 94.226 | Cricetulus_griseus_crigri |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 91.584 | ENSETEG00000011832 | PABPC5 | 99 | 78.796 | Echinops_telfairi |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.638 | ENSEASG00005014396 | PABPC5 | 99 | 97.638 | Equus_asinus_asinus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.638 | ENSECAG00000003452 | PABPC5 | 99 | 97.638 | Equus_caballus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.113 | ENSFCAG00000004998 | PABPC5 | 99 | 97.113 | Felis_catus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.325 | ENSFDAG00000000126 | PABPC5 | 99 | 96.325 | Fukomys_damarensis |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 100.000 | ENSGGOG00000007622 | PABPC5 | 100 | 100.000 | Gorilla_gorilla |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 96.330 | ENSJJAG00000011960 | Pabpc5 | 100 | 96.330 | Jaculus_jaculus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSMFAG00000024561 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSMMUG00000011562 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Macaca_mulatta |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSMNEG00000037604 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Macaca_nemestrina |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSMLEG00000028318 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Mandrillus_leucophaeus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.588 | ENSMICG00000041706 | PABPC5 | 99 | 96.588 | Microcebus_murinus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 95.538 | ENSMOCG00000001554 | Pabpc5 | 99 | 95.538 | Microtus_ochrogaster |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 94.987 | MGP_CAROLIEiJ_G0033367 | Pabpc5 | 99 | 94.987 | Mus_caroli |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 95.515 | ENSMUSG00000034732 | Pabpc5 | 99 | 95.515 | Mus_musculus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 95.801 | MGP_PahariEiJ_G0031908 | Pabpc5 | 99 | 95.801 | Mus_pahari |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 95.515 | MGP_SPRETEiJ_G0034533 | Pabpc5 | 99 | 95.515 | Mus_spretus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.588 | ENSMPUG00000018465 | PABPC5 | 99 | 96.588 | Mustela_putorius_furo |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.063 | ENSMLUG00000008244 | PABPC5 | 99 | 96.063 | Myotis_lucifugus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 95.413 | ENSNGAG00000004371 | Pabpc5 | 100 | 95.413 | Nannospalax_galili |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 100.000 | ENSNLEG00000035086 | PABPC5 | 100 | 100.000 | Nomascus_leucogenys |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 98 | 97.285 | ENSOPRG00000000856 | PABPC5 | 100 | 97.285 | Ochotona_princeps |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.900 | ENSOCUG00000010919 | PABPC5 | 99 | 97.900 | Oryctolagus_cuniculus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 96.850 | ENSOGAG00000006882 | PABPC5 | 99 | 96.850 | Otolemur_garnettii |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.113 | ENSOARG00000010260 | PABPC5 | 99 | 97.113 | Ovis_aries |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 99.738 | ENSPPAG00000007378 | PABPC5 | 100 | 99.738 | Pan_paniscus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.113 | ENSPPRG00000010742 | PABPC5 | 99 | 97.113 | Panthera_pardus |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 99 | 97.113 | ENSPTIG00000001480 | PABPC5 | 99 | 97.113 | Panthera_tigris_altaica |
ENSG00000174740 | PABPC5 | 100 | 100.000 | ENSPTRG00000022078 | PABPC5 | 100 | 100.000 | Pan_troglodytes |
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