Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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UCEC |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
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MESO | ||
ACC | ||
HNSC | ||
KIRP | ||
PAAD | ||
KICH | ||
LIHC | ||
LUAD |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000526496 | CKAP5-205 | 582 | - | ENSP00000436769 | 151 (aa) | - | E9PQH5 |
ENST00000525248 | CKAP5-203 | 698 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000525896 | CKAP5-204 | 832 | - | ENSP00000434523 | 203 (aa) | - | H0YDX5 |
ENST00000533413 | CKAP5-212 | 3084 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000526876 | CKAP5-206 | 570 | - | ENSP00000436052 | 190 (aa) | - | H0YEK7 |
ENST00000528593 | CKAP5-209 | 366 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000527333 | CKAP5-208 | 498 | - | ENSP00000431509 | 166 (aa) | - | H0YCF6 |
ENST00000532321 | CKAP5-211 | 586 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000529230 | CKAP5-210 | 7121 | - | ENSP00000432768 | 2032 (aa) | - | Q14008 |
ENST00000312055 | CKAP5-201 | 6532 | - | ENSP00000310227 | 1972 (aa) | - | Q14008 |
ENST00000354558 | CKAP5-202 | 6428 | - | ENSP00000346566 | 1972 (aa) | - | Q14008 |
ENST00000526943 | CKAP5-207 | 563 | - | - | - (aa) | - | - |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000175216 | rs1007738 | 11 | 46827809 | A | Bone mineral density (hip) | 19079262 | [0.05-0.11] s.d. decrease | 0.08 | EFO_0003923 |
ENSG00000175216 | rs61884327 | 11 | 46745340 | T | Total body bone mineral density | 29304378 | unit decrease | 0.0801 | EFO_0003923 |
ENSG00000175216 | rs10838622 | 11 | 46834985 | T | Total body bone mineral density | 29304378 | unit increase | 0.0491 | EFO_0003923 |
ENSG00000175216 | rs61884328 | 11 | 46761885 | T | Total body bone mineral density (age over 60) | 29304378 | unit decrease | 0.1063 | EFO_0003923 |
ENSG00000175216 | rs4534535 | 11 | 46767141 | T | Pulse pressure | 30578418 | [0.12-0.23] mmHg decrease | 0.1739 | EFO_0005763 |
ENSG00000175216 | rs11038990 | 11 | 46783211 | ? | Alzheimer's disease (late onset) | 30820047 | [1.05-1.13] | 1.09 | EFO_1001870 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000175216 | CKAP5 | 96 | 62.069 | FBgn0027948 | msps | 89 | 46.196 | Drosophila_melanogaster |
ENSG00000175216 | CKAP5 | 100 | 98.013 | ENSMUSG00000040549 | Ckap5 | 100 | 94.980 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000086 | G2/M transition of mitotic cell cycle | - | TAS | Process |
GO:0000776 | kinetochore | 21873635. | IBA | Component |
GO:0000776 | kinetochore | 25596274. | IDA | Component |
GO:0000777 | condensed chromosome kinetochore | - | IEA | Component |
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GO:0000922 | spindle pole | 21646404. | IDA | Component |
GO:0000930 | gamma-tubulin complex | 14718566. | IDA | Component |
GO:0005515 | protein binding | 11903063.14603251.17474147.20360068.21297582.26496610. | IPI | Function |
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GO:0005813 | centrosome | 21873635. | IBA | Component |
GO:0005813 | centrosome | 14718566.21399614.21646404. | IDA | Component |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0005886 | plasma membrane | - | IDA | Component |
GO:0007019 | microtubule depolymerization | 26323690. | TAS | Process |
GO:0007051 | spindle organization | 21873635. | IBA | Process |
GO:0007051 | spindle organization | 14718566. | IMP | Process |
GO:0007098 | centrosome cycle | 14718566. | IMP | Process |
GO:0010389 | regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle | - | TAS | Process |
GO:0015630 | microtubule cytoskeleton | 15703215. | ISS | Component |
GO:0016020 | membrane | 19946888. | HDA | Component |
GO:0030951 | establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity | 21873635. | IBA | Process |
GO:0030951 | establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity | 14718566. | IMP | Process |
GO:0032991 | protein-containing complex | 18468998. | IDA | Component |
GO:0035371 | microtubule plus-end | 21873635. | IBA | Component |
GO:0035371 | microtubule plus-end | 21646404. | IDA | Component |
GO:0045296 | cadherin binding | 25468996. | HDA | Function |
GO:0046785 | microtubule polymerization | 21873635. | IBA | Process |
GO:0046785 | microtubule polymerization | 26323690. | TAS | Process |
GO:0050658 | RNA transport | 15703215. | ISS | Process |
GO:0051010 | microtubule plus-end binding | 21873635. | IBA | Function |
GO:0051298 | centrosome duplication | 21873635. | IBA | Process |
GO:0051301 | cell division | - | IEA | Process |
GO:0097711 | ciliary basal body-plasma membrane docking | - | TAS | Process |