Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | Type | Freq | Q-value |
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LGG | |||
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SARC | |||
SKCM | |||
TGCT | |||
THYM |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
SARC | ||
MESO | ||
ACC | ||
SKCM | ||
KIRP | ||
READ | ||
KICH | ||
GBM | ||
LIHC | ||
LGG | ||
CHOL | ||
LUAD | ||
UVM |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000638947 | SETD2-209 | 1984 | - | ENSP00000491413 | 591 (aa) | - | A0A1W2PPX9 |
ENST00000409792 | SETD2-202 | 8142 | XM_011533632 | ENSP00000386759 | 2564 (aa) | XP_011531934 | Q9BYW2 |
ENST00000492397 | SETD2-208 | 746 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000484689 | SETD2-207 | 561 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000330022 | SETD2-201 | 8172 | - | ENSP00000332415 | 1365 (aa) | - | H7BXT4 |
ENST00000412450 | SETD2-203 | 4231 | - | ENSP00000416401 | 1340 (aa) | - | C9JG86 |
ENST00000479832 | SETD2-206 | 794 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000431180 | SETD2-204 | 7555 | - | ENSP00000388349 | 1290 (aa) | - | H7BZ93 |
ENST00000445387 | SETD2-205 | 7075 | - | ENSP00000411901 | 1675 (aa) | - | H7C3H4 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa00310 | Lysine degradation | KEGG |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000181555 | rs13063578 | 3 | 47046347 | A | Monocyte count | 27863252 | [0.019-0.033] unit increase | 0.02587866 | EFO_0005091 |
ENSG00000181555 | rs151074357 | 3 | 47034978 | C | Post bronchodilator FEV1/FVC ratio | 26634245 | unit increase | 0.24 | GO_0097366|EFO_0004713 |
ENSG00000181555 | rs2290547 | 3 | 47019693 | A | HDL cholesterol | 24097068 | [NR] unit decrease | 0.03 | EFO_0004612 |
ENSG00000181555 | rs17784127 | 3 | 47020210 | T | Highest math class taken (MTAG) | 30038396 | [0.007-0.0136] unit increase | 0.0103 | EFO_0004875 |
ENSG00000181555 | rs543811905 | 3 | 47029484 | CA | Granulocyte percentage of myeloid white cells | 27863252 | [0.031-0.05] unit increase | 0.04058472 | EFO_0007997 |
ENSG00000181555 | rs13063578 | 3 | 47046347 | A | Lymphocyte counts | 27863252 | [0.048-0.062] unit increase | 0.0547414 | EFO_0004587 |
ENSG00000181555 | rs13063578 | 3 | 47046347 | A | Lymphocyte percentage of white cells | 27863252 | [0.024-0.039] unit increase | 0.03160705 | EFO_0007993 |
ENSG00000181555 | rs13063578 | 3 | 47046347 | A | White blood cell count (basophil) | 27863252 | [0.014-0.028] unit increase | 0.02122998 | EFO_0005090 |
ENSG00000181555 | rs543811905 | 3 | 47029484 | CA | Platelet distribution width | 27863252 | [0.036-0.055] unit increase | 0.04532362 | EFO_0007984 |
ENSG00000181555 | rs13063578 | 3 | 47046347 | A | White blood cell count | 27863252 | [0.026-0.04] unit increase | 0.032872 | EFO_0004308 |
ENSG00000181555 | rs543811905 | 3 | 47029484 | CA | Monocyte percentage of white cells | 27863252 | [0.021-0.04] unit decrease | 0.0304442 | EFO_0007989 |
ENSG00000181555 | rs111675602 | 3 | 47118447 | C | Macrophage inflammatory protein 1b levels | 27989323 | [0.2-0.31] SD units decrease | 0.2548 | EFO_0008219 |
ENSG00000181555 | rs2290547 | 3 | 47019693 | A | HDL cholesterol levels | 28334899 | [0.021-0.039] unit decrease (EA Beta values) | 0.0297 | EFO_0004612 |
ENSG00000181555 | rs12631730 | 3 | 47088413 | ? | Reaction time | 29844566 | [0.0049-0.0118] unit increase | 0.0083757 | EFO_0008393 |
ENSG00000181555 | rs114151323 | 3 | 47142565 | ? | White blood cell count |