Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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ACC | |||||||
BLCA | |||||||
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BRCA | |||||||
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KIRP | |||||||
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LUSC | |||||||
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MESO | |||||||
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PCPG | |||||||
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UCEC | |||||||
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UCEC | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
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BLCA | |||
DLBC | |||
ESCA | |||
PAAD | |||
READ | |||
UCEC | |||
UCS |
Cancer | P-value | Q-value |
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THYM | ||
KIRC | ||
SARC | ||
MESO | ||
HNSC | ||
SKCM | ||
BRCA | ||
KIRP | ||
BLCA | ||
CESC | ||
UCEC | ||
GBM | ||
LIHC | ||
LGG | ||
LUAD | ||
OV |
Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000408697 | MMR_HSR1 | PF01926.23 | 1.1e-05 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000418860 | NUGGC-202 | 352 | - | ENSP00000388515 | 76 (aa) | - | C9JSP2 |
ENST00000413272 | NUGGC-201 | 3887 | XM_011544523 | ENSP00000408697 | 796 (aa) | XP_011542825 | Q68CJ6 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000189233 | rs116501061 | 8 | 28075934 | ? | Cold sores | 28928442 | [0.65-1.36] unit decrease | 1.0041 | EFO_0008402 |
ENSG00000189233 | rs6983473 | 8 | 28048371 | A | Cardiac Troponin-T levels | 23247143 | [0.02-0.06] ug/L decrease | 0.04 | EFO_0005043 |
ENSG00000189233 | rs146167206 | 8 | 28058664 | C | Monocyte chemoattractant protein-3 levels | 27989323 | [0.45-1.05] SD units decrease | 0.7464 | EFO_0008054 |
ENSG00000189233 | rs4732812 | 8 | 28065871 | ? | Suicidal ideation | 20877300 | [NR] | 2.56 | EFO_0004320 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000189233 | NUGGC | 84 | 30.277 | ENSAPEG00000007405 | - | 79 | 30.277 | Amphiprion_percula |
ENSG00000189233 | NUGGC | 61 | 31.936 | ENSAPEG00000007463 | - | 73 | 31.936 | Amphiprion_percula |
ENSG00000189233 | NUGGC | 83 | 31.157 | ENSACLG00000027743 | - | 78 | 31.306 | Astatotilapia_calliptera |
ENSG00000189233 | NUGGC | 83 | 30.493 | ENSACLG00000027763 | - | 83 | 30.493 | Astatotilapia_calliptera |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 84.925 | ENSBTAG00000011321 | NUGGC | 100 | 84.925 | Bos_taurus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 92.462 | ENSCJAG00000015456 | NUGGC | 100 | 92.462 | Callithrix_jacchus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 85.461 | ENSCAFG00000008347 | NUGGC | 100 | 85.954 | Canis_familiaris |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 85.535 | ENSCHIG00000016874 | NUGGC | 100 | 85.535 | Capra_hircus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 97 | 81.701 | ENSCAPG00000010505 | NUGGC | 99 | 81.701 | Cavia_aperea |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 81.658 | ENSCPOG00000003741 | NUGGC | 100 | 81.658 | Cavia_porcellus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 97.613 | ENSCATG00000011556 | NUGGC | 100 | 97.613 | Cercocebus_atys |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 81.156 | ENSCGRG00001024841 | Nuggc | 100 | 81.156 | Cricetulus_griseus_chok1gshd |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 81.156 | ENSCGRG00000012434 | Nuggc | 100 | 81.156 | Cricetulus_griseus_crigri |
ENSG00000189233 | NUGGC | 97 | 87.953 | ENSEASG00005016323 | NUGGC | 99 | 87.953 | Equus_asinus_asinus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 88.161 | ENSECAG00000014074 | NUGGC | 100 | 88.161 | Equus_caballus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 87.626 | ENSFCAG00000002892 | NUGGC | 99 | 87.626 | Felis_catus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 97 | 85.677 | ENSSTOG00000000498 | NUGGC | 98 | 85.677 | Ictidomys_tridecemlineatus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 97.111 | ENSMFAG00000043857 | NUGGC | 100 | 97.111 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 96.859 | ENSMMUG00000001040 | NUGGC | 100 | 96.859 | Macaca_mulatta |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 96.985 | ENSMNEG00000045452 | NUGGC | 100 | 96.985 | Macaca_nemestrina |
ENSG00000189233 | NUGGC | 78 | 30.414 | ENSMZEG00005026592 | - | 88 | 30.573 | Maylandia_zebra |
ENSG00000189233 | NUGGC | 83 | 30.435 | ENSMZEG00005023384 | - | 77 | 30.435 | Maylandia_zebra |
ENSG00000189233 | NUGGC | 78 | 30.573 | ENSMZEG00005004202 | - | 81 | 30.573 | Maylandia_zebra |
ENSG00000189233 | NUGGC | 79 | 30.094 | ENSMZEG00005023437 | - | 89 | 30.346 | Maylandia_zebra |
ENSG00000189233 | NUGGC | 83 | 30.539 | ENSMZEG00005023374 | - | 83 | 30.539 | Maylandia_zebra |
ENSG00000189233 | NUGGC | 88 | 81.013 | ENSMAUG00000014486 | Nuggc | 100 | 81.013 | Mesocricetus_auratus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 98 | 88.318 | ENSMICG00000030884 | NUGGC | 98 | 88.318 | Microcebus_murinus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 78.894 | MGP_CAROLIEiJ_G0019426 | Nuggc | 100 | 78.894 | Mus_caroli |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 78.392 | ENSMUSG00000061356 | Nuggc | 100 | 78.392 | Mus_musculus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 98 | 86.744 | ENSMPUG00000000959 | NUGGC | 98 | 86.744 | Mustela_putorius_furo |
ENSG00000189233 | NUGGC | 100 | 81.533 | ENSNGAG00000022052 | Nuggc | 100 | 81.533 | Nannospalax_galili |
ENSG00000189233 | NUGGC | 78 | 30.794 | ENSONIG00000015367 | - | 100 | 30.794 | Oreochromis_niloticus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 77 | 30.635 | ENSONIG00000005156 | - | 100 | 31.111 | Oreochromis_niloticus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 77 | 31.051 | ENSONIG00000017112 | - | 95 | 31.100 | Oreochromis_niloticus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 81.566 | ENSOCUG00000000032 | NUGGC | 99 | 81.566 | Oryctolagus_cuniculus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 98 | 85.328 | ENSOGAG00000000229 | NUGGC | 99 | 85.328 | Otolemur_garnettii |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 85.876 | ENSOARG00000014887 | NUGGC | 99 | 85.876 | Ovis_aries |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 87.170 | ENSPPRG00000012192 | NUGGC | 100 | 87.170 | Panthera_pardus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 87.296 | ENSPTIG00000008187 | NUGGC | 100 | 87.296 | Panthera_tigris_altaica |
ENSG00000189233 | NUGGC | 65 | 30.451 | ENSPREG00000007347 | - | 88 | 30.075 | Poecilia_reticulata |
ENSG00000189233 | NUGGC | 83 | 30.493 | ENSPNYG00000002532 | - | 83 | 30.493 | Pundamilia_nyererei |
ENSG00000189233 | NUGGC | 91 | 96.250 | ENSRBIG00000043902 | NUGGC | 100 | 96.250 | Rhinopithecus_bieti |
ENSG00000189233 | NUGGC | 96 | 92.580 | ENSSBOG00000028930 | NUGGC | 100 | 92.580 | Saimiri_boliviensis_boliviensis |
ENSG00000189233 | NUGGC | 53 | 30.269 | ENSSDUG00000010293 | - | 69 | 30.269 | Seriola_dumerili |
ENSG00000189233 | NUGGC | 77 | 31.289 | ENSSPAG00000014020 | - | 77 | 31.289 | Stegastes_partitus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 84.906 | ENSTTRG00000015905 | NUGGC | 99 | 84.906 | Tursiops_truncatus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 87.737 | ENSUAMG00000013467 | NUGGC | 99 | 87.737 | Ursus_americanus |
ENSG00000189233 | NUGGC | 99 | 84.956 | ENSVVUG00000003454 | NUGGC | 99 | 84.956 | Vulpes_vulpes |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0003924 | GTPase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0003924 | GTPase activity | 19734146. | IDA | Function |
GO:0005525 | GTP binding | - | IEA | Function |
GO:0016607 | nuclear speck | - | IEA | Component |
GO:0033262 | regulation of nuclear cell cycle DNA replication | 19734146. | IMP | Process |
GO:0043066 | negative regulation of apoptotic process | 19734146. | IMP | Process |
GO:0071222 | cellular response to lipopolysaccharide | 19734146. | IDA | Process |