EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000001285 (Gene tree)
Gene ID: 100560820
Gene Symbol: URB2
Alias: KIAA0133|NET10|NPA2
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28485 bases
Position: chr1:222338190-222366674
Accession: 100560820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000001258	Urb2	PF10441.9	8.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000001291	URB2-201	4622	XM_008124390	ENSACAP00000001258	1537 (aa)	XP_008122597	G1K9C1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.683	ENSG00000135763	URB2	99	69.048	Homo_sapiens
ENSACAG00000001285	URB2	89	36.724	ENSAPOG00000000608	urb2	95	36.792	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.327	ENSAMEG00000009206	URB2	99	48.456	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000001285	URB2	99	60.123	ENSAOCG00000019961	urb2	96	60.123	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000001285	URB2	99	60.123	ENSAPEG00000005263	urb2	96	60.123	Amphiprion_percula
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.824	ENSATEG00000020930	urb2	99	36.824	Anabas_testudineus
ENSACAG00000001285	URB2	97	57.256	ENSAPLG00000002998	URB2	100	57.256	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.677	ENSANAG00000033963	URB2	100	48.677	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000001285	URB2	89	36.141	ENSACLG00000009254	urb2	95	36.130	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000001285	URB2	100	37.540	ENSAMXG00000003474	urb2	100	37.619	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000001285	URB2	99	46.813	ENSBTAG00000010180	URB2	99	46.813	Bos_taurus
ENSACAG00000001285	URB2	95	64.789	ENSCJAG00000010968	URB2	100	49.035	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.460	ENSCAFG00000012118	URB2	100	47.460	Canis_familiaris
ENSACAG00000001285	URB2	94	46.291	ENSCAFG00020027217	URB2	99	46.291	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000001285	URB2	99	46.748	ENSCHIG00000014513	URB2	99	46.748	Capra_hircus
ENSACAG00000001285	URB2	99	47.650	ENSTSYG00000006924	URB2	99	47.714	Carlito_syrichta
ENSACAG00000001285	URB2	64	55.183	ENSCPOG00000020777	-	100	55.183	Cavia_porcellus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.939	ENSCCAG00000023932	URB2	100	48.939	Cebus_capucinus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.649	ENSCATG00000043366	URB2	100	48.649	Cercocebus_atys
ENSACAG00000001285	URB2	100	46.903	ENSCLAG00000006268	URB2	100	46.813	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.619	ENSCSAG00000010599	URB2	100	48.619	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000001285	URB2	68	52.349	ENSCHOG00000010163	URB2	70	52.349	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000001285	URB2	100	63.964	ENSCPBG00000006191	URB2	100	63.964	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.234	ENSCANG00000023711	URB2	100	48.234	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.283	ENSCGRG00001009591	Urb2	100	47.283	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.283	ENSCGRG00000011259	Urb2	100	47.283	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000001285	URB2	96	38.641	ENSCSEG00000000299	urb2	99	38.641	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.170	ENSCVAG00000011011	urb2	99	36.170	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000001285	URB2	99	40.393	ENSDARG00000003217	urb2	99	66.019	Danio_rerio
ENSACAG00000001285	URB2	97	41.196	ENSDNOG00000043064	URB2	99	41.700	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.365	ENSDORG00000014975	Urb2	100	47.365	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000001285	URB2	95	46.971	ENSETEG00000002869	URB2	95	46.971	Echinops_telfairi
ENSACAG00000001285	URB2	99	49.225	ENSEASG00005012060	URB2	99	49.289	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000001285	URB2	93	62.676	ENSECAG00000012338	URB2	99	62.676	Equus_caballus
ENSACAG00000001285	URB2	92	59.155	ENSEEUG00000002669	URB2	92	59.155	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000001285	URB2	99	42.156	ENSELUG00000014647	urb2	99	42.438	Esox_lucius
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.201	ENSFCAG00000007662	URB2	100	48.329	Felis_catus
ENSACAG00000001285	URB2	100	56.043	ENSFALG00000003385	URB2	100	56.043	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.070	ENSFDAG00000021079	URB2	100	47.070	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.232	ENSFHEG00000010357	urb2	99	36.743	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000001285	URB2	99	38.159	ENSGMOG00000012459	urb2	100	38.476	Gadus_morhua
ENSACAG00000001285	URB2	100	58.767	ENSGALG00000011101	URB2	100	58.767	Gallus_gallus
ENSACAG00000001285	URB2	99	39.541	ENSGACG00000016179	urb2	99	39.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000001285	URB2	100	63.707	ENSGAGG00000021879	URB2	100	63.707	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.491	ENSGGOG00000025643	URB2	100	48.491	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000001285	URB2	99	55.556	ENSHBUG00000018469	urb2	96	55.556	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000001285	URB2	97	46.362	ENSHGLG00000016561	URB2	99	46.362	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000001285	URB2	100	46.040	ENSHGLG00100001838	URB2	100	45.887	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000001285	URB2	99	37.563	ENSIPUG00000020315	urb2	99	37.563	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.263	ENSSTOG00000025323	URB2	100	48.263	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.938	ENSJJAG00000011998	Urb2	100	47.874	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.439	ENSKMAG00000020129	urb2	99	36.617	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000001285	URB2	100	50.737	ENSLACG00000002038	URB2	100	50.737	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000001285	URB2	100	43.350	ENSLOCG00000015462	urb2	100	43.350	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000001285	URB2	99	49.035	ENSLAFG00000012484	URB2	100	49.035	Loxodonta_africana
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.584	ENSMFAG00000039905	URB2	100	48.584	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.584	ENSMMUG00000009509	URB2	100	48.584	Macaca_mulatta
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.713	ENSMNEG00000038762	URB2	100	48.713	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.362	ENSMLEG00000043252	URB2	100	48.362	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000001285	URB2	99	35.890	ENSMAMG00000020365	urb2	99	35.958	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000001285	URB2	99	56.173	ENSMZEG00005011027	urb2	96	56.173	Maylandia_zebra
ENSACAG00000001285	URB2	94	54.397	ENSMGAG00000012073	URB2	100	54.397	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000001285	URB2	95	61.972	ENSMAUG00000017980	Urb2	100	51.977	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.395	ENSMICG00000033302	URB2	99	48.524	Microcebus_murinus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.028	ENSMOCG00000020369	Urb2	100	48.028	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000001285	URB2	99	37.089	ENSMALG00000006529	urb2	99	37.089	Monopterus_albus
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.188	ENSMUSG00000031976	Urb2	100	47.188	Mus_musculus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.325	ENSMPUG00000012438	URB2	100	48.325	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.477	ENSNGAG00000016524	Urb2	100	47.477	Nannospalax_galili
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.426	ENSNLEG00000014450	URB2	100	48.426	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000001285	URB2	91	52.915	ENSMEUG00000016434	URB2	94	52.915	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000001285	URB2	92	47.567	ENSOPRG00000009906	URB2	92	47.567	Ochotona_princeps
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.477	ENSODEG00000005593	URB2	100	47.477	Octodon_degus
ENSACAG00000001285	URB2	99	39.194	ENSONIG00000017078	urb2	99	39.377	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000001285	URB2	100	43.492	ENSOANG00000013732	URB2	100	43.492	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.191	ENSOCUG00000010700	URB2	99	48.191	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.577	ENSORLG00000010915	urb2	99	36.757	Oryzias_latipes
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.517	ENSORLG00020003361	urb2	99	36.697	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.905	ENSORLG00015001534	urb2	99	37.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000001285	URB2	99	35.860	ENSOMEG00000010076	urb2	99	35.925	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000001285	URB2	99	47.142	ENSOGAG00000003021	URB2	99	47.142	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000001285	URB2	99	46.748	ENSOARG00000003102	URB2	99	46.748	Ovis_aries
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.619	ENSPPAG00000040629	URB2	100	48.619	Pan_paniscus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.003	ENSPPRG00000012767	URB2	100	48.131	Panthera_pardus
ENSACAG00000001285	URB2	95	56.061	ENSPTIG00000012577	URB2	100	56.061	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.555	ENSPTRG00000002092	URB2	100	48.555	Pan_troglodytes
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.013	ENSPANG00000002245	URB2	100	47.013	Papio_anubis
ENSACAG00000001285	URB2	100	42.430	ENSPKIG00000005787	urb2	100	42.494	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000001285	URB2	100	62.837	ENSPSIG00000002690	URB2	100	62.837	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000001285	URB2	96	47.333	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	47.333	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000001285	URB2	100	50.032	ENSPCIG00000030071	URB2	100	50.032	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000001285	URB2	99	37.942	ENSPFOG00000014330	urb2	99	38.005	Poecilia_formosa
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.826	ENSPLAG00000014654	urb2	99	36.881	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.701	ENSPMEG00000012356	urb2	99	37.030	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000001285	URB2	99	36.464	ENSPREG00000010268	urb2	99	36.464	Poecilia_reticulata
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.551	ENSPPYG00000000123	URB2	99	48.616	Pongo_abelii
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.842	ENSPCOG00000023537	URB2	99	48.970	Propithecus_coquereli
ENSACAG00000001285	URB2	100	42.774	ENSPVAG00000002108	URB2	100	42.968	Pteropus_vampyrus
ENSACAG00000001285	URB2	89	36.364	ENSPNYG00000016840	urb2	95	36.345	Pundamilia_nyererei
ENSACAG00000001285	URB2	100	39.392	ENSPNAG00000013684	urb2	100	39.490	Pygocentrus_nattereri
ENSACAG00000001285	URB2	100	46.964	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	46.964	Rattus_norvegicus
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.491	ENSRBIG00000037937	URB2	100	48.491	Rhinopithecus_bieti
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.426	ENSRROG00000039854	URB2	100	48.426	Rhinopithecus_roxellana
ENSACAG00000001285	URB2	100	48.520	ENSSBOG00000023055	URB2	100	48.520	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACAG00000001285	URB2	100	50.419	ENSSHAG00000014735	URB2	100	50.419	Sarcophilus_harrisii
ENSACAG00000001285	URB2	98	40.690	ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.690	Scleropages_formosus
ENSACAG00000001285	URB2	89	36.624	ENSSMAG00000004984	urb2	95	36.624	Scophthalmus_maximus
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ENSACAG00000001285	URB2	100	61.647	ENSSPUG00000018549	URB2	100	61.647	Sphenodon_punctatus
ENSACAG00000001285	URB2	99	37.604	ENSSPAG00000013632	urb2	99	37.626	Stegastes_partitus
ENSACAG00000001285	URB2	99	47.972	ENSSSCG00000010186	URB2	99	47.972	Sus_scrofa
ENSACAG00000001285	URB2	100	56.811	ENSTGUG00000009990	URB2	100	56.811	Taeniopygia_guttata
ENSACAG00000001285	URB2	99	35.920	ENSTRUG00000008173	urb2	99	35.798	Takifugu_rubripes
ENSACAG00000001285	URB2	92	47.182	ENSTNIG00000017689	urb2	99	38.613	Tetraodon_nigroviridis
ENSACAG00000001285	URB2	97	58.846	ENSTTRG00000014864	URB2	96	58.846	Tursiops_truncatus
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.741	ENSUAMG00000015022	URB2	99	48.870	Ursus_americanus
ENSACAG00000001285	URB2	99	48.547	ENSUMAG00000004728	URB2	99	48.677	Ursus_maritimus
ENSACAG00000001285	URB2	63	60.993	ENSVPAG00000001750	-	62	60.993	Vicugna_pacos
ENSACAG00000001285	URB2	100	47.395	ENSVVUG00000006747	URB2	100	47.395	Vulpes_vulpes
ENSACAG00000001285	URB2	100	44.588	ENSXETG00000023331	urb2	100	44.588	Xenopus_tropicalis
ENSACAG00000001285	URB2	99	37.446	ENSXMAG00000015059	urb2	99	37.446	Xiphophorus_maculatus