EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACAG00000002423 (Gene tree)
Gene ID: 100551588
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 120177 bases
Position: chr2:50825323-50945499
Accession: 100551588
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000002825	ResIII	PF04851.15	1.2e-08	1	1
ENSACAP00000002825	BRK	PF07533.16	9.8e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000002895	SMARCA2-201	9618	XM_008103323	ENSACAP00000002825	1560 (aa)	XP_008101530	G1KBB1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.765	ENSG00000080503	SMARCA2	100	95.973	Homo_sapiens
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.674	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.665	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	90	85.424	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	93.432	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.356	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.275	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.323	ENSAOCG00000009647	-	97	79.627	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.611	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	79.665	Amphiprion_percula
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	80.522	ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.862	Anabas_testudineus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	89	90.078	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	89.753	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.682	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	90.318	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	80.737	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.481	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	81.486	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	82.152	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.147	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	90.915	Bos_taurus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.670	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	90.304	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.659	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	91.171	Canis_familiaris
ENSACAG00000002423	SMARCA2	75	93.734	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	93.219	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.467	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	90.979	Capra_hircus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	87.268	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	90.090	Carlito_syrichta
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	86.906	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	87.080	Cavia_aperea
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.547	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	90.134	Cavia_porcellus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.752	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	90.388	Cebus_capucinus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.000	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	90.376	Cercocebus_atys
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.581	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	89.962	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000002423	SMARCA2	94	90.791	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	91.107	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	85	86.026	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	86.026	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	93.248	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	93.439	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.987	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	90.625	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	84.015	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	84.251	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	76.206	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	94	77.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	84	78.167	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	77.152	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	81.962	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.403	Danio_rerio
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.487	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	90.006	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.313	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	90.140	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	94	70.348	ENSEBUG00000011442	-	93	70.494	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000002423	SMARCA2	85	62.310	ENSEBUG00000002449	-	94	64.228	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.531	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	91.235	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	67	93.056	ENSEEUG00000015540	-	68	93.056	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	92	80.816	ENSELUG00000010318	smarca2	95	79.464	Esox_lucius
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.211	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	90.723	Felis_catus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.994	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	93.347	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	88.396	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	87.718	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.585	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.279	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	98	77.117	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.917	Gadus_morhua
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.803	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.930	Gallus_gallus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	95	75.050	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	91	75.466	Gambusia_affinis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	78.790	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.599	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	93.376	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	93.439	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	78	94.286	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	85	92.727	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.775	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.807	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	88.471	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	89.153	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.757	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	90.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000002423	SMARCA2	89	73.845	ENSHCOG00000015348	-	95	72.231	Hippocampus_comes
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	81.278	ENSIPUG00000011060	smarca2	96	81.574	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.587	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	90.355	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.504	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	90.140	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	78.585	ENSKMAG00000015844	-	98	78.931	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	98	83.131	ENSLOCG00000011499	smarca2	98	83.237	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.377	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	89.514	Loxodonta_africana
ENSACAG00000002423	SMARCA2	81	94.637	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	90.583	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.121	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	90.758	Macaca_mulatta
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.815	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	90.522	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000002423	SMARCA2	81	94.758	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	89.686	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.752	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.127	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	80.113	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.155	Maylandia_zebra
ENSACAG00000002423	SMARCA2	76	76.361	ENSMGAG00000005160	-	100	76.096	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.211	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	90.851	Microcebus_murinus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.510	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	89.962	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	77.685	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	95	77.076	Mola_mola
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.171	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	92.362	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	80.116	ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.517	Monopterus_albus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	84	92.618	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	88.875	Mus_caroli
ENSACAG00000002423	SMARCA2	84	92.824	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	96.000	Mus_musculus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.051	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	89.029	Mus_pahari
ENSACAG00000002423	SMARCA2	84	92.672	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	96.970	Mus_spretus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	81	93.058	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	93.214	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	84.915	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	85.352	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	88.917	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	88.896	Nannospalax_galili
ENSACAG00000002423	SMARCA2	87	71.263	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	82.090	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000002423	SMARCA2	81	93.829	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	89.430	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	84.041	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	84.167	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	84.845	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	84.795	Ochotona_princeps
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	88.557	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	89.194	Octodon_degus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	79.634	ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	79.948	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	50	91.667	ENSOANG00000008299	-	95	95.155	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.595	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	89.331	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.261	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	79.449	Oryzias_latipes
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.373	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	79.561	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	80.025	ENSOMEG00000009736	-	97	80.287	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	87.641	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.403	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.024	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	89.213	Ovis_aries
ENSACAG00000002423	SMARCA2	94	94.712	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	93.412	Pan_paniscus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.275	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	90.787	Panthera_pardus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	90.413	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	90.603	Pan_troglodytes
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	84.733	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	84.898	Papio_anubis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	83.631	ENSPKIG00000018469	-	100	83.439	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	93.071	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	93.198	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	98	74.036	ENSPMGG00000013696	-	96	75.116	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.571	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	88.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	94	73.003	ENSPMAG00000005337	-	94	72.793	Petromyzon_marinus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	91.980	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	92.171	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	78.951	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.871	Poecilia_formosa
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	78.455	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.022	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	78.316	ENSPMEG00000001815	-	97	78.680	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	78.266	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	78.884	Poecilia_reticulata
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.739	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	90.216	Pongo_abelii
ENSACAG00000002423	SMARCA2	79	78.246	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	78.246	Procavia_capensis
ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.243	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	88.811	Propithecus_coquereli
ENSACAG00000002423	SMARCA2	91	90.595	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	90.916	Pteropus_vampyrus
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