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Description

Ensembl ID: ENSACAG00000002762 (Gene tree)
Gene ID: 100552215
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23433 bases
Position: chrGL343338.1:26845-50277
Accession: 100552215
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000002743	RRM_1	PF00076.22	1.9e-34	1	2
ENSACAP00000002743	RRM_1	PF00076.22	1.9e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000002812	MSI1-201	1110	XM_003225983	ENSACAP00000002743	361 (aa)	XP_003226031	H9G6R4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
acs03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACAG00000002762	MSI1	52	41.799	ENSACAG00000012234	-	50	41.799
ENSACAG00000002762	MSI1	50	42.473	ENSACAG00000007169	-	68	38.956
ENSACAG00000002762	MSI1	81	84.324	ENSACAG00000005452	MSI2	88	59.437
ENSACAG00000002762	MSI1	52	44.974	ENSACAG00000010416	HNRNPDL	79	38.281
ENSACAG00000002762	MSI1	50	44.149	ENSACAG00000010342	HNRNPD	90	41.026

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSG00000135097	MSI1	100	96.419	Homo_sapiens
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	85.042	ENSAPOG00000023458	-	100	85.319	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	79.003	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	79.003	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000002762	MSI1	91	83.232	ENSACIG00000017754	-	78	83.232	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	78.824	ENSAOCG00000009031	-	95	79.118	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.425	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000002762	MSI1	100	85.042	ENSAPEG00000006857	-	84	85.042	Amphiprion_percula
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.425	Amphiprion_percula
ENSACAG00000002762	MSI1	100	78.846	ENSATEG00000023779	-	100	78.846	Anabas_testudineus
ENSACAG00000002762	MSI1	99	86.280	ENSATEG00000017059	MSI1	95	86.280	Anabas_testudineus
ENSACAG00000002762	MSI1	82	91.973	ENSANAG00000027901	-	92	91.973	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSANAG00000027151	MSI1	100	96.419	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000002762	MSI1	99	86.726	ENSACLG00000000117	-	100	85.841	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSACLG00000011230	MSI1	100	84.254	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000002762	MSI1	99	84.242	ENSAMXG00000038960	msi1	76	84.242	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	97.067	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	97.067	Bos_taurus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	96.419	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.143	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	96.143	Canis_familiaris
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.785	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	96.785	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000002762	MSI1	100	91.081	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	91.081	Capra_hircus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.942	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	96.942	Carlito_syrichta
ENSACAG00000002762	MSI1	100	87.220	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	87.220	Cavia_aperea
ENSACAG00000002762	MSI1	99	94.413	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	97.076	Cavia_porcellus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	96.419	Cebus_capucinus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSCATG00000030019	MSI1	100	96.419	Cercocebus_atys
ENSACAG00000002762	MSI1	100	93.388	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	97.076	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000002762	MSI1	75	94.245	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	94.245	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.568	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.568	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.951	ENSCANG00000040651	MSI1	100	96.951	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	96.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.960	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	96.960	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000002762	MSI1	99	79.646	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	78.761	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000002762	MSI1	100	83.934	ENSCSEG00000008352	-	100	83.934	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000002762	MSI1	100	83.425	ENSCSEG00000005834	-	100	82.597	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000002762	MSI1	100	85.319	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.488	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000002762	MSI1	63	68.122	ENSCVAG00000017463	-	89	66.812	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000002762	MSI1	80	83.700	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.379	Danio_rerio
ENSACAG00000002762	MSI1	99	81.595	ENSDARG00000010710	msi1	100	84.889	Danio_rerio
ENSACAG00000002762	MSI1	100	89.297	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.297	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000002762	MSI1	92	96.108	ENSDORG00000005610	Msi1	99	92.394	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000002762	MSI1	94	92.683	ENSETEG00000004756	MSI1	100	92.683	Echinops_telfairi
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSEASG00005004736	MSI1	100	96.419	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSECAG00000017526	MSI1	100	96.419	Equus_caballus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	81.667	ENSELUG00000023219	MSI1	92	81.667	Esox_lucius
ENSACAG00000002762	MSI1	99	82.301	ENSELUG00000023280	-	100	82.006	Esox_lucius
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	96.419	Felis_catus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.764	ENSFALG00000007574	MSI1	100	96.764	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.646	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	96.646	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSFHEG00000003560	-	100	83.425	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	85.596	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	85.596	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	83.380	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	83.102	Gadus_morhua
ENSACAG00000002762	MSI1	100	76.731	ENSGMOG00000017838	-	100	76.731	Gadus_morhua
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.679	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.990	Gallus_gallus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	85.882	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.000	Gambusia_affinis
ENSACAG00000002762	MSI1	100	66.209	ENSGAFG00000005860	-	100	65.385	Gambusia_affinis
ENSACAG00000002762	MSI1	96	82.709	ENSGACG00000008674	-	100	80.716	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.211	ENSGACG00000012679	MSI1	100	84.488	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.291	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.291	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.815	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	96.815	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	84.254	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	ENSHBUG00000011841	-	100	84.211	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.143	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	96.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.646	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	96.646	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000002762	MSI1	100	79.452	ENSHCOG00000012067	-	100	78.630	Hippocampus_comes
ENSACAG00000002762	MSI1	99	81.416	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.531	Hippocampus_comes
ENSACAG00000002762	MSI1	100	83.102	ENSIPUG00000001976	msi1	100	83.102	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.785	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	96.785	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	96.419	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	80.992	ENSJJAG00000010643	-	100	80.716	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000002762	MSI1	99	83.481	ENSKMAG00000019877	-	100	82.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.488	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.934	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000002762	MSI1	96	86.957	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	85.042	Labrus_bergylta
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSLBEG00000001375	-	100	83.425	Labrus_bergylta
ENSACAG00000002762	MSI1	94	88.012	ENSLACG00000018287	MSI1	100	88.012	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000002762	MSI1	91	86.405	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	86.405	Loxodonta_africana
ENSACAG00000002762	MSI1	94	97.076	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	97.076	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000002762	MSI1	94	97.076	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	95.714	Macaca_mulatta
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	96.419	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.951	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	96.951	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000002762	MSI1	96	86.455	ENSMAMG00000018426	-	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.211	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.657	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	84.254	Maylandia_zebra
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	ENSMZEG00005000340	-	100	84.211	Maylandia_zebra
ENSACAG00000002762	MSI1	67	100.000	ENSMGAG00000016518	-	100	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000002762	MSI1	67	98.765	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	98.765	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	ENSMICG00000033181	MSI1	100	96.419	Microcebus_murinus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.143	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	96.143	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000002762	MSI1	97	76.218	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	76.218	Mola_mola
ENSACAG00000002762	MSI1	99	82.067	ENSMMOG00000012265	-	99	80.000	Mola_mola
ENSACAG00000002762	MSI1	91	66.566	ENSMODG00000003189	-	100	66.566	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	ENSMALG00000017889	MSI1	100	84.211	Monopterus_albus
ENSACAG00000002762	MSI1	99	85.546	ENSMALG00000001426	-	100	84.661	Monopterus_albus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.868	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	95.868	Mus_caroli
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.868	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	95.868	Mus_musculus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.592	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	95.592	Mus_pahari
ENSACAG00000002762	MSI1	100	95.868	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	95.868	Mus_spretus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.785	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	96.785	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000002762	MSI1	94	87.798	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	87.798	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.960	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	96.960	Nannospalax_galili
ENSACAG00000002762	MSI1	88	78.824	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	78.824	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	ENSNBRG00000000841	-	100	84.211	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000002762	MSI1	90	86.585	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	86.585	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000002762	MSI1	94	76.829	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	76.829	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000002762	MSI1	91	89.524	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	89.524	Ochotona_princeps
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.951	ENSODEG00000006328	MSI1	100	96.951	Octodon_degus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.765	ENSONIG00000011182	MSI1	100	84.211	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.066	ENSONIG00000019452	-	100	84.066	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.785	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	96.785	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000002762	MSI1	100	85.319	ENSORLG00000019978	-	100	85.596	Oryzias_latipes
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