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Description

Ensembl ID: ENSACAG00000003176 (Gene tree)
Gene ID: 100554133
Gene Symbol: PRPF3
Alias: Prp3|RP18|SNRNP90|hPrp3
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33847 bases
Position: chrGL343802.1:26349-60195
Accession: 100554133
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000003159	PRP3	PF08572.10	1.7e-79	1	1
ENSACAP00000003159	PWI	PF01480.17	5e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000003240	PRPF3-201	4063	XM_003229089	ENSACAP00000003159	687 (aa)	XP_008121238	H9G791

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
acs03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSG00000117360	PRPF3	100	92.576	Homo_sapiens
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.159	ENSAPOG00000015584	prpf3	99	72.443	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	92.431	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.831	ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.845	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.549	ENSAOCG00000011449	prpf3	99	72.585	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.307	ENSATEG00000023583	prpf3	99	70.687	Anabas_testudineus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	92.722	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	92.576	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.950	ENSACLG00000020127	prpf3	99	71.388	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	73.529	ENSAMXG00000007306	prpf3	99	72.893	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	92.576	Bos_taurus
ENSACAG00000003176	PRPF3	79	39.383	WBGene00010844	prp-3	95	36.115	Caenorhabditis_elegans
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	92.576	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	92.576	Canis_familiaris
ENSACAG00000003176	PRPF3	80	92.196	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	91.107	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	92.576	Capra_hircus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	92.285	Carlito_syrichta
ENSACAG00000003176	PRPF3	93	77.344	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	77.812	Cavia_aperea
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	92.285	Cavia_porcellus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	92.576	Cebus_capucinus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	78.324	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	78.035	Cercocebus_atys
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	92.431	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000003176	PRPF3	76	95.307	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	95.307	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	93.304	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	93.013	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000003176	PRPF3	61	58.810	ENSCING00000003312	-	99	58.333	Ciona_intestinalis
ENSACAG00000003176	PRPF3	83	54.007	ENSCSAVG00000008720	-	94	54.301	Ciona_savignyi
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.140	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	91.849	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	92.576	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	92.576	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.090	ENSCSEG00000002532	prpf3	99	71.348	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.316	ENSCVAG00000009318	prpf3	99	71.897	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	73.617	ENSDARG00000086425	prpf3	99	72.908	Danio_rerio
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	83.843	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	86.026	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000003176	PRPF3	93	92.320	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	91.850	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000003176	PRPF3	81	53.004	FBgn0036915	Prp3	99	52.708	Drosophila_melanogaster
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.285	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	91.994	Echinops_telfairi
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	62.857	ENSEBUG00000011680	prpf3	99	62.347	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	92.431	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	92.576	Equus_caballus
ENSACAG00000003176	PRPF3	85	93.617	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	93.617	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	65.625	ENSELUG00000013624	prpf3	99	65.434	Esox_lucius
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	92.576	Felis_catus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.285	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	91.994	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.675	ENSFHEG00000021746	prpf3	99	72.439	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.328	ENSGMOG00000008535	prpf3	99	70.863	Gadus_morhua
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	92.576	Gallus_gallus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.612	ENSGAFG00000012671	prpf3	99	71.327	Gambusia_affinis
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.186	ENSGACG00000011792	prpf3	99	71.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	93.159	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	92.210	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000003176	PRPF3	85	94.239	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	92.330	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	73.094	ENSHBUG00000003493	prpf3	99	71.530	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.431	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	92.140	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	65.648	ENSHGLG00000016033	-	100	65.357	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.431	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	92.140	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	66.424	ENSHGLG00100008951	-	100	65.066	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	68.028	ENSHCOG00000014058	prpf3	99	67.660	Hippocampus_comes
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	73.647	ENSIPUG00000000902	PRPF3	99	73.647	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	92.576	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.733	ENSKMAG00000001390	prpf3	99	71.449	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	70.588	ENSLBEG00000026310	prpf3	99	71.186	Labrus_bergylta
ENSACAG00000003176	PRPF3	93	81.094	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	80.938	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	92.576	Loxodonta_africana
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	92.576	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000003176	PRPF3	90	92.395	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	92.058	Macaca_mulatta
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	92.576	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000003176	PRPF3	85	93.827	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	92.330	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000003176	PRPF3	99	63.196	ENSMLEG00000041065	-	98	62.573	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.469	ENSMAMG00000014968	prpf3	99	71.189	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.469	ENSMZEG00005015970	prpf3	99	71.509	Maylandia_zebra
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	92.576	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	92.285	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	93.013	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	92.722	Microcebus_murinus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	92.576	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	66.901	ENSMMOG00000016131	prpf3	99	67.090	Mola_mola
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.431	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	92.140	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	70.839	ENSMALG00000007257	prpf3	99	70.839	Monopterus_albus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	92.285	Mus_caroli
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	92.285	Mus_musculus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	92.285	Mus_pahari
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	92.285	Mus_spretus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	90.684	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	90.262	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.587	ENSMLUG00000004646	-	100	92.297	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	92.576	Nannospalax_galili
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.409	ENSNBRG00000003462	prpf3	99	69.876	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000003176	PRPF3	90	92.395	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	92.058	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000003176	PRPF3	83	93.013	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	90.393	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.576	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	92.140	Ochotona_princeps
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.285	ENSODEG00000011363	-	100	91.994	Octodon_degus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	69.164	ENSODEG00000014412	-	100	68.300	Octodon_degus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.469	ENSONIG00000006394	prpf3	99	71.509	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	64.121	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	63.545	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	92.576	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.624	ENSORLG00000010330	prpf3	99	71.755	Oryzias_latipes
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.624	ENSORLG00020009054	prpf3	99	71.755	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.340	ENSORLG00015015016	prpf3	99	71.469	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	72.624	ENSOMEG00000000940	prpf3	99	72.199	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	87.500	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	87.209	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	92.576	Ovis_aries
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	92.431	Pan_paniscus
ENSACAG00000003176	PRPF3	99	71.239	ENSPPAG00000043769	-	99	70.649	Pan_paniscus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	92.576	Panthera_pardus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	92.576	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000003176	PRPF3	99	70.354	ENSPTRG00000047819	-	99	69.764	Pan_troglodytes
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	92.576	Pan_troglodytes
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.722	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	92.431	Papio_anubis
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	74.538	ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.217	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	93.450	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	93.013	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	65.899	ENSPMGG00000007776	prpf3	99	65.899	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	92.576	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000003176	PRPF3	63	72.210	ENSPMAG00000005588	prpf3	97	71.754	Petromyzon_marinus
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