EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000007637 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 69889 bases
Position: chr6:64260190-64330078
Accession: 100560069
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000007670	GTP_EFTU	PF00009.27	3.7e-45	1	1
ENSACAP00000007670	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.6e-13	1	1
ENSACAP00000007670	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000007834	EFTUD2-201	5508	XM_003222610	ENSACAP00000007670	972 (aa)	XP_003222658	G1KH37

Gene Model

Click here to download ENSACAG00000007637's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACAG00000007637's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACAG00000007637	EFTUD2	87	38.673	ENSACAG00000012275	EEF2	99	38.673

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.078	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	97.634	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	88.272	ENSACIG00000009096	eftud2	100	87.860	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	87	88.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.078	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.667	Amphiprion_percula
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.181	ENSATEG00000000457	eftud2	100	91.770	Anabas_testudineus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.737	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.358	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.198	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.198	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	97.428	Bos_taurus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	99	70.041	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.737	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	97.634	Canis_familiaris
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	97.634	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.428	Capra_hircus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.325	Carlito_syrichta
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	96.914	Cavia_aperea
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	96.914	Cavia_porcellus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	97.737	Cebus_capucinus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.737	Cercocebus_atys
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.811	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	96.811	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.737	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	91	85.248	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	98	85.311	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.148	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	99	78.615	ENSCSAVG00000004985	-	99	80.189	Ciona_savignyi
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	97.737	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.325	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	97.325	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.947	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.975	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.564	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.844	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.750	Danio_rerio
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.325	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.222	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	74.974	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSACAG00000007637	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSACAG00000007637	EFTUD2	74	94.030	ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	97.634	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.531	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	97.531	Equus_caballus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.741	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.535	Esox_lucius
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.531	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.531	Felis_catus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.251	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.251	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.222	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.872	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.461	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.049	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.358	Gadus_morhua
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.251	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	Gallus_gallus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.461	Gambusia_affinis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.255	ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.844	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	97.737	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.255	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	96.914	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	96.914	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.638	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.638	Hippocampus_comes
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.049	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.564	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.078	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.628	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	96	97.756	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.756	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.152	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	95	91.262	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.650	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.872	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.222	Loxodonta_africana
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	97.737	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	97.737	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	97.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.181	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	91.770	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.358	Maylandia_zebra
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.255	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.255	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	97.325	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	97.737	Microcebus_murinus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	92	79.888	ENSMOCG00000017653	-	90	79.888	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	ENSMOCG00000009039	-	100	97.428	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000007637	EFTUD2	87	93.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.765	Mola_mola
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.840	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	97.840	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000007637	EFTUD2	87	92.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.000	Monopterus_albus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.119	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.119	Mus_caroli
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.119	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.119	Mus_musculus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.119	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.119	Mus_pahari
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.119	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.119	Mus_spretus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	97.352	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	97.352	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	97.634	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.325	Nannospalax_galili
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.255	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	95.855	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	95.855	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	94.033	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.033	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.300	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.300	Ochotona_princeps
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.708	ENSODEG00000018041	-	100	96.708	Octodon_degus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	93	78.448	ENSODEG00000003385	-	100	78.448	Octodon_degus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.358	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.634	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.255	Oryzias_latipes
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.152	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00015002611	eftud2	99	93.341	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	95.473	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	95.473	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	97.428	Ovis_aries
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	97.737	Pan_paniscus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	97.634	Panthera_pardus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	97.634	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.737	Pan_troglodytes
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	97.737	Papio_anubis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	93	96.803	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.803	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	84.053	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	83.848	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	97.325	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	97.737	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.461	Poecilia_formosa
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.461	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.461	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.296	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.296	Pongo_abelii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	93.519	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.519	Procavia_capensis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.737	Propithecus_coquereli
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	93.004	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.004	Pteropus_vampyrus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.255	Pundamilia_nyererei
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.872	Pygocentrus_nattereri
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.222	Rattus_norvegicus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	97.634	Rhinopithecus_bieti
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.634	Rhinopithecus_roxellana
ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	33.794	YKL173W	SNU114	91	34.567	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.737	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	97.974	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	97.974	Sarcophilus_harrisii
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.255	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.049	Scleropages_formosus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.255	Scophthalmus_maximus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.872	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.461	Seriola_dumerili
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.975	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.564	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.095	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.095	Sorex_araneus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.148	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	98.148	Sphenodon_punctatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.975	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.564	Stegastes_partitus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.428	Sus_scrofa
ENSACAG00000007637	EFTUD2	84	97.689	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.689	Taeniopygia_guttata
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.947	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.535	Takifugu_rubripes
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	86.475	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	85.963	Tetraodon_nigroviridis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.181	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.181	Tupaia_belangeri
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.095	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.095	Tursiops_truncatus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.509	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.509	Ursus_americanus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	97.634	Ursus_maritimus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.634	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	97.634	Vulpes_vulpes
ENSACAG00000007637	EFTUD2	97	95.096	ENSXETG00000003394	eftud2	98	96.179	Xenopus_tropicalis
ENSACAG00000007637	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.461	Xiphophorus_maculatus