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Description

Ensembl ID: ENSACAG00000008249 (Gene tree)
Gene ID: 100562618
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: FLJ14936|Prp38
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4840 bases
Position: chr4:114575187-114580026
Accession: 100562618
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000008100	PRP38	PF03371.15	2.3e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000008272	PRPF38A-201	1358	XM_003220308	ENSACAP00000008100	312 (aa)	XP_003220356	G1KHK2

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
acs03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSG00000134748	PRPF38A	100	95.833	Homo_sapiens
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	81.470	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	100	95.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	86.878	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.641	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	81.470	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	81.470	Amphiprion_percula
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	87.330	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	80.511	Anabas_testudineus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	79	96.356	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	96.356	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSANAG00000027839	PRPF38A	100	95.833	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	64.241	ENSANAG00000029204	-	100	59.177	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	87.330	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	80.831	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	80.511	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	80.511	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	100	95.833	Bos_taurus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	63	63.077	WBGene00008380	prp-38	68	60.731	Caenorhabditis_elegans
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	95.833	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	95.833	Canis_familiaris
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	95.833	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	95.833	Capra_hircus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	86	94.052	ENSTSYG00000031994	-	95	94.052	Carlito_syrichta
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSTSYG00000009868	-	100	95.833	Carlito_syrichta
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	100	95.833	Cavia_porcellus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	94.872	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	94.872	Cebus_capucinus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	62.179	ENSCATG00000044190	-	100	60.897	Cercocebus_atys
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCATG00000032296	PRPF38A	100	95.833	Cercocebus_atys
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	100	95.833	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000008249	PRPF38A	78	95.833	ENSCHOG00000008388	PRPF38A	77	95.833	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	97.115	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	100	97.115	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000008249	PRPF38A	70	70.507	ENSCSAVG00000009580	-	78	65.678	Ciona_savignyi
ENSACAG00000008249	PRPF38A	74	94.805	ENSCANG00000032608	PRPF38A	77	94.805	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	74	79.654	ENSCGRG00001002557	-	78	79.654	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.513	ENSCGRG00001018502	-	100	95.513	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.513	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	95.513	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	86.878	ENSCSEG00000001269	prpf38a	79	86.147	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	80.831	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	80.831	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	80.831	Danio_rerio
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	100	95.833	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	84	79.848	ENSDORG00000025371	-	78	84.141	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000008249	PRPF38A	84	79.848	ENSDORG00000023691	-	78	84.141	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	82.692	ENSDORG00000023857	-	100	97.917	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000008249	PRPF38A	65	72.277	FBgn0050342	Prp38	57	73.404	Drosophila_melanogaster
ENSACAG00000008249	PRPF38A	76	79.832	ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	79.828	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSEASG00005014427	PRPF38A	100	95.833	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.833	ENSECAG00000022628	PRPF38A	100	95.833	Equus_caballus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	85.973	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	79.872	Esox_lucius
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ENSACAG00000008249	PRPF38A	99	83.280	ENSFALG00000003612	-	77	87.879	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000008249	PRPF38A	87	95.203	ENSFALG00000005598	-	100	95.203	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	95.513	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	100	95.513	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000008249	PRPF38A	84	79.167	ENSFHEG00000014317	prpf38a	78	87.446	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000008249	PRPF38A	53	93.976	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	93.976	Gadus_morhua
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ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	88.235	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	80.831	Gambusia_affinis
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ENSACAG00000008249	PRPF38A	87	68.635	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	90.426	Hippocampus_comes
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ENSACAG00000008249	PRPF38A	87	94.834	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	94.485	Macaca_mulatta
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