EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000009346 (Gene tree)
Gene ID: 100556348
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9985 bases
Position: chrGL343562.1:152393-162377
Accession: 100556348
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000009179	RRM_1	PF00076.22	1.8e-17	1	2
ENSACAP00000009179	RRM_1	PF00076.22	1.8e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000009372	HTATSF1-201	1688	XM_008121489	ENSACAP00000009179	395 (aa)	XP_008119696	H9GF42

Gene Model

Click here to download ENSACAG00000009346's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACAG00000009346's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000009346	HTATSF1	82	70.988	ENSG00000102241	HTATSF1	75	68.750	Homo_sapiens
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.500	ENSAPOG00000009823	htatsf1	79	64.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	60.100	ENSACIG00000020459	htatsf1	77	65.143	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.293	ENSAOCG00000020994	htatsf1	81	60.053	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.088	ENSAPEG00000016432	htatsf1	81	60.847	Amphiprion_percula
ENSACAG00000009346	HTATSF1	86	66.189	ENSATEG00000008903	htatsf1	83	63.859	Anabas_testudineus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.812	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	93	70.573	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.852	ENSACLG00000008096	htatsf1	86	59.848	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	58.578	ENSAMXG00000008387	htatsf1	82	61.155	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	83	37.982	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	35.965	Caenorhabditis_elegans
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	74.046	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	93	74.219	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000009346	HTATSF1	75	52.805	ENSCING00000005914	-	61	52.805	Ciona_intestinalis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	68	54.945	ENSCSAVG00000000371	-	58	53.846	Ciona_savignyi
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.374	ENSCVAG00000014070	htatsf1	86	59.241	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.951	ENSDARG00000056649	htatsf1	77	65.341	Danio_rerio
ENSACAG00000009346	HTATSF1	85	42.179	FBgn0037081	barc	61	44.152	Drosophila_melanogaster
ENSACAG00000009346	HTATSF1	87	55.616	ENSEBUG00000001534	htatsf1	74	56.131	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	56.618	ENSELUG00000005486	htatsf1	78	59.391	Esox_lucius
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	69.773	ENSFALG00000003728	HTATSF1	85	70.103	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.500	ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	60.102	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	76	65.347	ENSGMOG00000016444	htatsf1	85	65.347	Gadus_morhua
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.558	ENSGALG00000006410	HTATSF1	85	70.649	Gallus_gallus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.955	ENSGAFG00000003041	htatsf1	84	59.079	Gambusia_affinis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	59.801	ENSGACG00000020459	htatsf1	79	63.277	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.852	ENSHBUG00000004392	htatsf1	86	59.848	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	58.438	ENSHCOG00000009056	htatsf1	80	63.873	Hippocampus_comes
ENSACAG00000009346	HTATSF1	87	65.306	ENSIPUG00000017828	htatsf1	73	65.306	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.199	ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	62.432	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	59.398	ENSLBEG00000001154	htatsf1	72	66.869	Labrus_bergylta
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	65.482	ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	65.274	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000009346	HTATSF1	82	43.881	ENSLOCG00000015118	htatsf1	69	43.413	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	88	63.611	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.215	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.852	ENSMZEG00005000485	htatsf1	86	59.848	Maylandia_zebra
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.051	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	89	70.130	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000009346	HTATSF1	93	60.051	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	60.051	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.601	ENSMMOG00000011013	htatsf1	75	65.672	Mola_mola
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	68.462	ENSMODG00000014087	-	83	69.211	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.500	ENSMALG00000019977	htatsf1	83	60.533	Monopterus_albus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.099	ENSNBRG00000003818	htatsf1	86	60.101	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000009346	HTATSF1	92	69.505	ENSMEUG00000004133	-	84	69.505	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.314	ENSONIG00000008638	htatsf1	86	60.000	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	71.139	ENSOANG00000011674	-	92	71.354	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.901	ENSORLG00000002356	htatsf1	78	64.972	Oryzias_latipes
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.697	ENSORLG00020017818	htatsf1	75	64.972	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.100	ENSORLG00015002268	htatsf1	77	65.517	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	61.634	ENSOMEG00000007564	htatsf1	79	64.706	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	63.291	ENSPKIG00000024852	htatsf1	82	64.785	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000009346	HTATSF1	86	77.193	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	94	77.477	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	59.506	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	58.883	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	93	68.478	ENSPCIG00000030173	-	83	68.478	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	63.131	ENSPCIG00000018896	-	80	65.041	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.352	ENSPFOG00000007871	htatsf1	78	61.789	Poecilia_formosa
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.603	ENSPLAG00000007532	htatsf1	81	61.247	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.850	ENSPMEG00000000352	htatsf1	81	62.331	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.601	ENSPREG00000007811	htatsf1	77	65.598	Poecilia_reticulata
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.852	ENSPNYG00000016693	htatsf1	86	59.848	Pundamilia_nyererei
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	60.095	ENSPNAG00000006166	htatsf1	87	59.268	Pygocentrus_nattereri
ENSACAG00000009346	HTATSF1	54	33.186	YNL286W	-	76	34.529	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACAG00000009346	HTATSF1	91	69.638	ENSSHAG00000018908	-	78	69.638	Sarcophilus_harrisii
ENSACAG00000009346	HTATSF1	83	72.477	ENSSHAG00000006440	-	83	72.477	Sarcophilus_harrisii
ENSACAG00000009346	HTATSF1	93	64.946	ENSSFOG00015012002	htatsf1	75	64.946	Scleropages_formosus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.950	ENSSMAG00000002970	htatsf1	72	68.196	Scophthalmus_maximus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	78	65.823	ENSSDUG00000020002	htatsf1	74	65.385	Seriola_dumerili
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.000	ENSSLDG00000016880	htatsf1	78	63.429	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	74.747	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	84	75.065	Sphenodon_punctatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	58.065	ENSSPAG00000000732	htatsf1	81	60.533	Stegastes_partitus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	82	70.062	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	50	66.102	Sus_scrofa
ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.277	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	83	71.240	Taeniopygia_guttata
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.945	ENSTRUG00000013383	htatsf1	87	61.399	Takifugu_rubripes
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.448	ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	61.299	Tetraodon_nigroviridis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	86	62.963	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	50	68.543	Tursiops_truncatus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	65.672	ENSXETG00000019749	htatsf1	62	73.556	Xenopus_tropicalis
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	54.009	ENSXCOG00000006912	htatsf1	81	62.849	Xiphophorus_couchianus
ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	61.069	ENSXMAG00000000490	htatsf1	80	63.158	Xiphophorus_maculatus