EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000009599 (Gene tree)
Gene ID: 100557078
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33606 bases
Position: chr2:16274254-16307859
Accession: 100557078
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000009496	IBN_N	PF03810.19	2.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000009693	TNPO1-201	2708	XM_003216263	ENSACAP00000009496	890 (aa)	XP_003216311	G1KJ76

Gene Model

Click here to download ENSACAG00000009599's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACAG00000009599's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	87.486	ENSACAG00000003576	TNPO2	99	87.486

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSG00000083312	TNPO1	100	96.891	Homo_sapiens
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.045	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	95.880	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.880	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.411	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.411	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.157	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.157	Amphiprion_percula
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.933	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.933	Anabas_testudineus
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.348	ENSAPLG00000009619	-	99	93.348	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	86.404	ENSANAG00000025351	-	99	86.404	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	63.193	ENSANAG00000027118	-	99	63.304	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	ENSANAG00000022453	-	99	96.292	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.825	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	96.854	Bos_taurus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	96.404	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.616	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.616	Canis_familiaris
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.933	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	93.933	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.966	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	96.966	Capra_hircus
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	92.881	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.322	Carlito_syrichta
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.292	Cebus_capucinus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	96.742	Cercocebus_atys
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.292	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	96.742	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000009599	TNPO1	94	84.625	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.625	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.876	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.876	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	96.742	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	96.629	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.725	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	96.725	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.697	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.697	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.146	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.154	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.817	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	90.817	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000009599	TNPO1	93	96.867	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.864	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	58.014	FBgn0035693	CG8219	99	57.675	Drosophila_melanogaster
ENSACAG00000009599	TNPO1	86	98.502	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.502	Echinops_telfairi
ENSACAG00000009599	TNPO1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	96.742	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	96.629	Equus_caballus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	86.819	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	Esox_lucius
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	96.742	Felis_catus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.539	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.539	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	96.404	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.490	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.482	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.482	Gadus_morhua
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	97.640	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.640	Gallus_gallus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.809	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.809	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.764	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.764	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	80.605	ENSGGOG00000022535	-	98	80.605	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	96.742	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.371	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.517	ENSHGLG00000000970	-	99	96.517	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.495	ENSHGLG00100017090	-	99	96.495	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000009599	TNPO1	97	75.814	ENSHGLG00100000963	-	99	75.233	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.854	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.596	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000009599	TNPO1	91	90.382	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.382	Labrus_bergylta
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	95.730	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.730	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	97	96.305	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.305	Loxodonta_africana
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	96.742	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	96.629	Macaca_mulatta
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	96.742	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	96.742	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.157	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	96.629	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.809	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.809	Microcebus_murinus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.629	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.686	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.686	Mola_mola
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.584	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.584	Monopterus_albus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.274	Mus_caroli
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.026	Mus_musculus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.150	Mus_pahari
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	96.778	Mus_spretus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	96.629	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.275	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.275	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	96.629	Nannospalax_galili
ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.282	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.282	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	96.742	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000009599	TNPO1	90	91.054	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.054	Ochotona_princeps
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.292	Octodon_degus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.634	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000009599	TNPO1	92	98.171	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.171	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	90.771	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	90.771	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.774	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.774	Oryzias_latipes
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.574	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.799	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	93.461	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.461	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	96.742	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.854	Ovis_aries
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	96.742	Pan_paniscus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	96.742	Panthera_pardus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	96.742	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	96.742	Pan_troglodytes
ENSACAG00000009599	TNPO1	94	84.807	ENSPTRG00000047731	-	100	84.807	Pan_troglodytes
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	96.742	Papio_anubis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.112	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.539	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	98.539	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.797	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.725	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.725	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.090	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.169	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.169	Poecilia_formosa
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.169	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.371	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.274	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	Poecilia_reticulata
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	96.629	Pongo_abelii
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	96.742	Propithecus_coquereli
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	96.742	Pteropus_vampyrus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.154	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.154	Pundamilia_nyererei
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.937	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.386	Pygocentrus_nattereri
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.854	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	96.854	Rattus_norvegicus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	96.742	Rhinopithecus_bieti
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	96.742	Rhinopithecus_roxellana
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.404	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	96.404	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACAG00000009599	TNPO1	97	97.338	ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	97.338	Sarcophilus_harrisii
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.276	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.276	Scleropages_formosus
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	93.575	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.575	Scophthalmus_maximus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.045	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	94.045	Seriola_dumerili
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.045	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	94.045	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	97.753	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	97.753	Sphenodon_punctatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	94.157	Stegastes_partitus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	96.742	Sus_scrofa
ENSACAG00000009599	TNPO1	99	96.317	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	96.317	Taeniopygia_guttata
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.596	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.596	Takifugu_rubripes
ENSACAG00000009599	TNPO1	69	89.286	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.286	Tetraodon_nigroviridis
ENSACAG00000009599	TNPO1	87	98.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	Tupaia_belangeri
ENSACAG00000009599	TNPO1	96	93.099	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.099	Tursiops_truncatus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	96.742	Ursus_maritimus
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.697	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	92.697	Vicugna_pacos
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	96.742	Vulpes_vulpes
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	95.281	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.281	Xenopus_tropicalis
ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.042	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	Xiphophorus_maculatus