EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000015441 (Gene tree)
Gene ID: 100559671
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24257 bases
Position: chrLGb:1835711-1859967
Accession: 100559671
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000015272	ResIII	PF04851.15	5.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000015581	SBNO1-201	5050	XM_003222771	ENSACAP00000015272	1550 (aa)	XP_003222819	H9GMG0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.278	ENSG00000139697	SBNO1	100	87.278	Homo_sapiens
ENSACAG00000015441	SBNO1	74	81.282	ENSAPOG00000003196	sbno1	96	82.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.101	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	87.243	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.738	ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.350	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.435	ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.036	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.435	ENSAPEG00000006069	sbno1	97	75.036	Amphiprion_percula
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.947	ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.107	Anabas_testudineus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	90.683	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	90.683	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.746	ENSANAG00000029958	-	99	93.440	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.437	ENSACLG00000024913	sbno1	98	75.982	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	78.132	ENSAMXG00000019473	sbno1	98	78.720	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.994	ENSBTAG00000020505	SBNO1	98	89.822	Bos_taurus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.074	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	87.074	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.305	ENSCAFG00000007503	SBNO1	98	92.843	Canis_familiaris
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.913	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	91.219	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.153	ENSCHIG00000008382	SBNO1	98	93.974	Capra_hircus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	89.942	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	90.306	Carlito_syrichta
ENSACAG00000015441	SBNO1	86	89.395	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	93.548	Cavia_aperea
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.885	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	93.548	Cavia_porcellus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	84.996	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	85.101	Cebus_capucinus
ENSACAG00000015441	SBNO1	86	89.129	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	94.245	Cercocebus_atys
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.065	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	93.728	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000015441	SBNO1	75	92.660	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	92.660	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	83.112	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	83.112	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000015441	SBNO1	89	92.893	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	92.826	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	82.670	ENSCANG00000042688	-	100	82.599	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	92.806	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	92.473	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	92.806	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	92.473	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	73.422	ENSCSEG00000011919	sbno1	98	74.129	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.873	ENSCVAG00000007038	sbno1	98	75.129	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	77.454	ENSDARG00000099080	sbno1	98	77.874	Danio_rerio
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.833	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	88.033	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	77.762	ENSDORG00000015261	Sbno1	84	91.081	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000015441	SBNO1	82	84.639	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.639	Echinops_telfairi
ENSACAG00000015441	SBNO1	66	63.188	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.137	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000015441	SBNO1	86	89.470	ENSECAG00000006127	SBNO1	98	89.537	Equus_caballus
ENSACAG00000015441	SBNO1	72	91.209	ENSEEUG00000003793	SBNO1	80	91.209	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	78.020	ENSELUG00000002886	sbno1	98	78.255	Esox_lucius
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.562	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	87.562	Felis_catus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	90.754	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	90.825	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	90.200	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	85.989	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.396	ENSFHEG00000007360	sbno1	98	75.715	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000015441	SBNO1	85	77.744	ENSGMOG00000018229	sbno1	98	77.846	Gadus_morhua
ENSACAG00000015441	SBNO1	78	90.580	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	90.660	Gallus_gallus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	76.432	ENSGAFG00000003960	sbno1	97	76.635	Gambusia_affinis
ENSACAG00000015441	SBNO1	85	77.494	ENSGACG00000015633	sbno1	98	77.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	92.471	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	96.085	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.245	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	93.907	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	69.594	ENSHBUG00000011910	sbno1	98	70.266	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.203	ENSHGLG00000014165	-	100	87.358	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000015441	SBNO1	80	84.980	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	78.163	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.074	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.885	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	93.548	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.429	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	89.247	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	76.194	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	75.880	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.842	ENSLBEG00000007623	sbno1	98	74.929	Labrus_bergylta
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.858	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	81.651	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.831	ENSLOCG00000005725	sbno1	98	80.536	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.293	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	86.506	Loxodonta_africana
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.099	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	90.071	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.099	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	90.071	Macaca_mulatta
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.245	ENSMLEG00000033260	SBNO1	100	93.907	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.947	ENSMAMG00000005473	sbno1	98	75.269	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	91.239	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	91.311	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.192	ENSMICG00000006573	-	99	90.248	Microcebus_murinus
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.165	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	92.832	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	72.629	ENSMMOG00000008691	sbno1	97	72.987	Mola_mola
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	88.699	ENSMODG00000012470	SBNO1	99	88.364	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.403	ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.520	Monopterus_albus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.762	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	96.053	Mus_caroli
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.771	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	96.053	Mus_musculus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.957	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	96.053	Mus_pahari
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.700	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	96.053	Mus_spretus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.642	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	87.642	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.287	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	87.287	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000015441	SBNO1	81	94.510	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	94.141	Nannospalax_galili
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.164	ENSNBRG00000019189	sbno1	98	75.704	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.006	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	88.304	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000015441	SBNO1	54	83.333	ENSMEUG00000008768	-	93	84.713	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	85.593	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	85.522	Ochotona_princeps
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.705	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	93.369	Octodon_degus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.526	ENSONIG00000015348	sbno1	98	74.911	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000015441	SBNO1	87	86.715	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	87.730	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	73.980	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.147	Oryzias_latipes
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.173	ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.499	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.173	ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.499	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.399	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	75.287	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.074	ENSOARG00000004404	SBNO1	98	87.482	Ovis_aries
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.424	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	94.086	Pan_paniscus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.562	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	87.562	Panthera_pardus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.544	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	87.687	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.245	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	93.907	Pan_troglodytes
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.245	ENSPANG00000011640	SBNO1	100	93.907	Papio_anubis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.249	ENSPKIG00000001441	sbno1	98	79.263	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	93.061	ENSPSIG00000009572	-	100	93.280	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000015441	SBNO1	81	86.308	ENSPSIG00000009256	-	100	86.462	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	92.806	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	92.473	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	90.445	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	90.889	Phascolarctos_cinereus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.158	ENSPFOG00000005069	sbno1	98	75.339	Poecilia_formosa
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.018	ENSPLAG00000015015	sbno1	98	75.410	Poecilia_latipinna
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.105	ENSPMEG00000021212	sbno1	98	75.285	Poecilia_mexicana
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.754	ENSPREG00000017746	sbno1	98	74.929	Poecilia_reticulata
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	87.136	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	87.136	Pongo_abelii
ENSACAG00000015441	SBNO1	78	79.167	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	79.082	Procavia_capensis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	89.431	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	94.364	Propithecus_coquereli
ENSACAG00000015441	SBNO1	77	94.444	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	94.444	Pteropus_vampyrus
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.341	ENSPNYG00000004291	sbno1	98	74.728	Pundamilia_nyererei
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	77.426	ENSPNAG00000015622	sbno1	98	77.826	Pygocentrus_nattereri
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.705	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	93.537	Rattus_norvegicus
ENSACAG00000015441	SBNO1	84	94.245	ENSRROG00000034230	SBNO1	100	93.907	Rhinopithecus_roxellana
ENSACAG00000015441	SBNO1	86	84.914	ENSSBOG00000015422	SBNO1	98	84.978	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACAG00000015441	SBNO1	88	80.029	ENSSFOG00015019025	sbno1	98	80.681	Scleropages_formosus
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