EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACAG00000027867 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 246 bases
Position: chrGL343399.1:415396-415641
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000018362	zf-nanos	PF05741.13	1.9e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000025677	-	246	-	ENSACAP00000018362	81 (aa)	-	H9GQR7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025093	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023855	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026478	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026679	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000025729	-	58	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000026334	-	58	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	51.282	ENSACAG00000026819	-	59	51.282
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025505	-	58	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000027983	-	58	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000022675	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025044	-	58	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024972	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023391	-	55	50.000
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ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024364	-	55	50.000
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ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000027440	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000022322	-	58	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000022321	-	59	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025655	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000027995	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026914	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024218	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000024003	-	59	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000027568	-	56	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000017474	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000024434	-	58	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000024432	-	61	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000014502	-	59	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000022207	-	61	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000021948	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023823	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000005197	-	56	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024568	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026350	-	56	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000027728	-	55	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025452	-	56	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026757	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025556	-	54	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000027212	-	55	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000028048	-	59	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000025632	-	59	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023774	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024504	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023803	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025307	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023428	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000025260	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023813	-	58	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026317	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000023650	-	55	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000022861	-	57	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000027265	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	84	56.522	ENSACAG00000011358	-	87	56.522
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000022088	-	58	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000023519	-	59	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024274	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	48.718	ENSACAG00000026660	-	56	48.718
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000024639	-	55	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000026716	-	58	50.000
ENSACAG00000027867	-	96	50.000	ENSACAG00000022918	-	55	50.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSG00000188425	NANOS2	55	49.351	Homo_sapiens
ENSACAG00000027867	-	75	95.082	ENSG00000188613	NANOS1	99	79.518	Homo_sapiens
ENSACAG00000027867	-	75	95.082	ENSAMEG00000020160	-	73	87.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000027867	-	100	42.683	ENSACIG00000007105	nanos2	54	42.683	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000027867	-	72	56.897	ENSACLG00000027005	nanos2	50	56.897	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSBTAG00000047505	NANOS2	55	48.052	Bos_taurus
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCJAG00000012141	NANOS2	54	48.052	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000027867	-	74	98.333	ENSCAFG00000025549	-	64	81.481	Canis_familiaris
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSCAFG00000024541	NANOS2	55	46.753	Canis_familiaris
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSCAFG00020001772	NANOS2	55	46.753	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCHIG00000012637	NANOS2	55	48.052	Capra_hircus
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSTSYG00000028873	NANOS2	55	45.455	Carlito_syrichta
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCAPG00000016771	NANOS2	58	48.052	Cavia_aperea
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCPOG00000014969	NANOS2	58	48.052	Cavia_porcellus
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSCATG00000018951	NANOS2	55	49.351	Cercocebus_atys
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCLAG00000001832	NANOS2	58	48.052	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSCSAG00000019629	NANOS2	55	49.351	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSCHOG00000001937	NANOS2	55	46.753	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCPBG00000023819	NANOS3	54	48.052	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000027867	-	99	82.927	ENSCPBG00000002172	NANOS1	67	82.927	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSCANG00000012014	NANOS2	55	48.052	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSCGRG00001013726	Nanos2	58	45.455	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSCGRG00000019170	Nanos2	58	45.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSDNOG00000044718	NANOS2	55	46.753	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000027867	-	70	77.193	ENSEBUG00000002646	-	64	68.116	Eptatretus_burgeri
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSEASG00005014235	NANOS2	55	45.455	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSECAG00000006033	NANOS2	55	45.455	Equus_caballus
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSEEUG00000009930	NANOS2	55	48.052	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSFCAG00000027661	NANOS2	55	48.052	Felis_catus
ENSACAG00000027867	-	69	48.214	ENSFALG00000006160	NANOS3	69	46.552	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSFDAG00000016342	NANOS2	57	48.052	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000027867	-	96	56.410	ENSGMOG00000020465	nanos1	85	56.410	Gadus_morhua
ENSACAG00000027867	-	73	50.847	ENSGMOG00000016541	nanos3	58	50.847	Gadus_morhua
ENSACAG00000027867	-	72	70.690	ENSGMOG00000015980	-	51	70.690	Gadus_morhua
ENSACAG00000027867	-	96	62.821	ENSGACG00000016692	-	85	62.821	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000027867	-	72	74.138	ENSGACG00000004930	-	53	74.138	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSGGOG00000013447	NANOS2	55	49.351	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSSTOG00000021724	NANOS2	58	46.753	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000027867	-	94	43.421	ENSLACG00000013286	NANOS3	52	43.421	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSLAFG00000014090	NANOS2	54	46.753	Loxodonta_africana
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSMFAG00000017215	NANOS2	55	49.351	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSMMUG00000008103	NANOS2	55	49.351	Macaca_mulatta
ENSACAG00000027867	-	75	95.082	ENSMMUG00000048654	NANOS1	99	79.518	Macaca_mulatta
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSMNEG00000004633	NANOS2	55	49.351	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSMLEG00000001810	NANOS2	55	49.351	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSMOCG00000001985	Nanos2	58	46.753	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000027867	-	94	44.737	ENSMODG00000023964	-	58	44.737	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000027867	-	86	45.714	ENSMALG00000006299	nanos2	53	45.714	Monopterus_albus
ENSACAG00000027867	-	95	50.649	MGP_CAROLIEiJ_G0029263	Nanos2	56	50.649	Mus_caroli
ENSACAG00000027867	-	95	50.649	ENSMUSG00000051965	Nanos2	56	50.649	Mus_musculus
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	MGP_PahariEiJ_G0021123	Nanos2	56	48.052	Mus_pahari
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	MGP_SPRETEiJ_G0030347	Nanos2	56	49.351	Mus_spretus
ENSACAG00000027867	-	95	46.753	ENSMPUG00000019371	NANOS2	55	46.753	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000027867	-	75	96.721	ENSMLUG00000026243	-	73	96.721	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000027867	-	98	46.835	ENSNBRG00000018838	NANOS2	64	46.835	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000027867	-	94	48.684	ENSOPRG00000010043	NANOS2	54	48.052	Ochotona_princeps
ENSACAG00000027867	-	90	47.945	ENSOANG00000013042	-	52	47.945	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000027867	-	94	47.368	ENSOCUG00000023755	NANOS2	55	46.753	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000027867	-	95	45.455	ENSOGAG00000032290	NANOS2	55	45.455	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000027867	-	75	96.721	ENSOARG00000000575	-	67	80.952	Ovis_aries
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSOARG00000011467	NANOS2	55	48.052	Ovis_aries
ENSACAG00000027867	-	95	49.351	ENSPPAG00000020568	NANOS2	55	49.351	Pan_paniscus
ENSACAG00000027867	-	95	48.052	ENSPPRG00000015211	NANOS2	55	48.052	Panthera_pardus
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ENSACAG00000027867	-	100	44.444	ENSXETG00000014552	NANOS2	57	44.444	Xenopus_tropicalis