EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSACAG00000029174 (Gene tree)
Gene ID: 100556413
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Anolis_carolinensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16482 bases
Position: chrGL343488.1:539056-555537
Accession: 100556413
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACAP00000022570	PAZ	PF02170.22	7.3e-29	1	1
ENSACAP00000022570	Piwi	PF02171.17	6.6e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACAT00000029987	AGO1-201	3247	XM_008120670	ENSACAP00000022570	782 (aa)	XP_008118877	R4GB99

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACAG00000029174	AGO1	100	85.077	ENSACAG00000017275	AGO4	92	85.077
ENSACAG00000029174	AGO1	100	84.566	ENSACAG00000000167	AGO2	90	84.566
ENSACAG00000029174	AGO1	100	85.461	ENSACAG00000003385	AGO3	92	85.461

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSG00000092847	AGO1	100	99.872	Homo_sapiens
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSAPOG00000024299	ago1	96	97.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSAMEG00000000504	AGO1	91	99.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACAG00000029174	AGO1	90	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSAOCG00000017727	ago1	91	97.059	Amphiprion_ocellaris
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSAPEG00000004458	ago1	92	97.059	Amphiprion_percula
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSATEG00000008523	ago1	91	97.059	Anabas_testudineus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	93.384	ENSAPLG00000010440	AGO1	90	93.384	Anas_platyrhynchos
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSANAG00000037711	AGO1	91	99.872	Aotus_nancymaae
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSACLG00000000890	ago1	100	92.092	Astatotilapia_calliptera
ENSACAG00000029174	AGO1	88	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	ENSBTAG00000012253	AGO1	91	99.744	Bos_taurus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCJAG00000032023	AGO1	91	99.872	Callithrix_jacchus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCAFG00000003443	AGO1	91	99.872	Canis_familiaris
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.872	Canis_lupus_dingo
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.361	ENSCHIG00000011848	-	92	98.475	Capra_hircus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	78.645	ENSTSYG00000032426	-	99	79.429	Carlito_syrichta
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSTSYG00000009767	-	92	99.872	Carlito_syrichta
ENSACAG00000029174	AGO1	77	99.180	ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	Cavia_aperea
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCPOG00000011568	AGO1	91	99.872	Cavia_porcellus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCCAG00000011823	AGO1	91	99.872	Cebus_capucinus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.872	Cercocebus_atys
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCLAG00000011507	AGO1	92	99.872	Chinchilla_lanigera
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCSAG00000001091	AGO1	91	99.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSACAG00000029174	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSACAG00000029174	AGO1	100	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	91	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCANG00000039798	AGO1	91	99.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCGRG00001022708	Ago1	91	99.872	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSCGRG00000010386	Ago1	92	99.872	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACAG00000029174	AGO1	100	95.232	ENSCSEG00000001051	ago1	92	95.232	Cynoglossus_semilaevis
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.059	Cyprinodon_variegatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.187	ENSDARG00000092644	ago1	91	97.187	Danio_rerio
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.872	Dasypus_novemcinctus
ENSACAG00000029174	AGO1	92	99.007	ENSDORG00000008494	Ago1	92	99.007	Dipodomys_ordii
ENSACAG00000029174	AGO1	83	92.415	ENSETEG00000007626	AGO1	90	92.415	Echinops_telfairi
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSEASG00005012086	AGO1	91	99.872	Equus_asinus_asinus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSECAG00000024353	AGO1	91	99.872	Equus_caballus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	91.432	ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.432	Erinaceus_europaeus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.931	Esox_lucius
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSFCAG00000000746	AGO1	91	99.872	Felis_catus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSFDAG00000017210	AGO1	91	99.872	Fukomys_damarensis
ENSACAG00000029174	AGO1	96	97.326	ENSFHEG00000017927	ago1	90	97.326	Fundulus_heteroclitus
ENSACAG00000029174	AGO1	96	84.513	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.513	Gadus_morhua
ENSACAG00000029174	AGO1	100	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	91	100.000	Gallus_gallus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.059	Gambusia_affinis
ENSACAG00000029174	AGO1	96	97.071	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	Gasterosteus_aculeatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	100.000	ENSGAGG00000012893	-	100	100.000	Gopherus_agassizii
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSGGOG00000003316	AGO1	91	99.872	Gorilla_gorilla
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSHBUG00000010459	ago1	100	92.092	Haplochromis_burtoni
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSHGLG00000011540	AGO1	91	99.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSHGLG00100005568	AGO1	91	99.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSHCOG00000005708	ago1	92	97.059	Hippocampus_comes
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.803	ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.720	Ictalurus_punctatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSSTOG00000010857	AGO1	91	99.872	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSJJAG00000019449	Ago1	91	99.872	Jaculus_jaculus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSKMAG00000019464	ago1	91	97.059	Kryptolebias_marmoratus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSLBEG00000007694	ago1	97	94.032	Labrus_bergylta
ENSACAG00000029174	AGO1	100	93.367	ENSLACG00000017009	AGO1	92	93.367	Latimeria_chalumnae
ENSACAG00000029174	AGO1	100	94.373	ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.373	Lepisosteus_oculatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSLAFG00000010835	AGO1	92	99.872	Loxodonta_africana
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMFAG00000002846	AGO1	91	99.872	Macaca_fascicularis
ENSACAG00000029174	AGO1	100	94.885	ENSMMUG00000006251	AGO1	93	94.757	Macaca_mulatta
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.872	Macaca_nemestrina
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMLEG00000038388	AGO1	91	99.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSMAMG00000008381	ago1	99	95.349	Mastacembelus_armatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSMZEG00005007996	ago1	100	92.092	Maylandia_zebra
ENSACAG00000029174	AGO1	100	94.170	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	94.170	Meleagris_gallopavo
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMAUG00000015189	Ago1	91	99.872	Mesocricetus_auratus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMICG00000016147	AGO1	91	99.872	Microcebus_murinus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	ENSMOCG00000000537	Ago1	91	99.744	Microtus_ochrogaster
ENSACAG00000029174	AGO1	86	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMODG00000023335	AGO1	91	99.872	Monodelphis_domestica
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSMALG00000011057	ago1	93	96.675	Monopterus_albus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	Mus_caroli
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.458	Mus_musculus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.458	Mus_pahari
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.458	Mus_spretus
ENSACAG00000029174	AGO1	92	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSACAG00000029174	AGO1	58	99.341	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	99.341	Myotis_lucifugus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSNGAG00000017448	Ago1	92	99.872	Nannospalax_galili
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.931	Neolamprologus_brichardi
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSNLEG00000011181	AGO1	91	99.872	Nomascus_leucogenys
ENSACAG00000029174	AGO1	91	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSACAG00000029174	AGO1	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	Ochotona_princeps
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSODEG00000005321	AGO1	91	99.872	Octodon_degus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.931	ENSONIG00000016345	ago1	92	96.931	Oreochromis_niloticus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	90.404	ENSOANG00000002080	AGO1	91	91.465	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	ENSOCUG00000023116	AGO1	91	99.744	Oryctolagus_cuniculus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSORLG00000014965	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSORLG00020018253	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes_hni
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSORLG00015003287	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes_hsok
ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	ENSOMEG00000020528	ago1	91	97.059	Oryzias_melastigma
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSOGAG00000010279	AGO1	91	99.872	Otolemur_garnettii
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.744	ENSOARG00000019591	AGO1	91	99.744	Ovis_aries
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPPAG00000034838	AGO1	91	99.872	Pan_paniscus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPPRG00000006475	AGO1	91	99.872	Panthera_pardus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.616	ENSPTIG00000020991	AGO1	91	99.616	Panthera_tigris_altaica
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPTRG00000000528	AGO1	91	99.872	Pan_troglodytes
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPANG00000009060	AGO1	91	99.872	Papio_anubis
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.107	ENSPSIG00000017482	AGO1	93	99.107	Pelodiscus_sinensis
ENSACAG00000029174	AGO1	88	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPEMG00000023313	Ago1	91	99.872	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSACAG00000029174	AGO1	53	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	Procavia_capensis
ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	99.872	Propithecus_coquereli
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