EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000000270 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4415 bases
Position: chrCCOE01001360.1:93934-98348
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000000361	RRM_1	PF00076.22	3.2e-13	1	1
ENSACIP00000000353	RRM_1	PF00076.22	4.2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000000380	-	786	-	ENSACIP00000000361	261 (aa)	-	-
ENSACIT00000000372	-	897	-	ENSACIP00000000353	298 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000000270	-	88	49.455	ENSACIG00000007143	-	75	54.911
ENSACIG00000000270	-	99	76.103	ENSACIG00000016568	-	92	78.656
ENSACIG00000000270	-	81	51.402	ENSACIG00000024288	raly	81	52.511

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSG00000184672	RALYL	93	78.481	Homo_sapiens
ENSACIG00000000270	-	99	93.537	ENSAPOG00000006963	hnrnpc	96	93.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000000270	-	99	93.197	ENSAOCG00000003896	-	96	93.624	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000270	-	99	68.121	ENSAOCG00000021616	-	79	83.784	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000270	-	83	84.932	ENSAPEG00000019962	-	82	83.784	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000270	-	99	93.197	ENSAPEG00000001489	-	96	93.624	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000270	-	83	86.301	ENSATEG00000018006	-	80	88.584	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000270	-	100	94.966	ENSATEG00000011734	-	100	93.960	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000270	-	95	45.724	ENSAPLG00000015574	RALYL	76	54.425	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000000270	-	95	45.875	ENSACAG00000028464	RALYL	75	54.077	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000000270	-	95	50.174	ENSANAG00000023383	RALYL	74	55.405	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000270	-	100	95.318	ENSACLG00000000995	-	96	95.318	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000270	-	100	94.983	ENSACLG00000013636	-	89	94.983	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000270	-	83	84.018	ENSACLG00000005707	-	86	82.879	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000270	-	74	79.793	ENSAMXG00000042946	hnrnpc	99	74.872	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000000270	-	83	87.963	ENSAMXG00000034915	zgc:55733	87	77.953	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000000270	-	95	50.174	ENSCJAG00000000402	RALYL	74	56.502	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000270	-	95	47.157	ENSCPOG00000012314	RALYL	74	55.844	Cavia_porcellus
ENSACIG00000000270	-	95	50.871	ENSCCAG00000025003	RALYL	77	78.481	Cebus_capucinus
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSCATG00000042145	RALYL	74	56.951	Cercocebus_atys
ENSACIG00000000270	-	95	46.823	ENSCLAG00000005228	RALYL	75	55.365	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000000270	-	80	52.632	ENSCHOG00000013228	RALYL	75	51.502	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSCANG00000039144	RALYL	74	56.951	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000000270	-	95	46.358	ENSCGRG00001009241	Ralyl	75	54.936	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000000270	-	83	82.273	ENSCSEG00000021349	-	79	78.764	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000000270	-	83	81.651	ENSCSEG00000019769	-	77	79.295	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000000270	-	82	88.940	ENSCVAG00000016981	-	78	81.538	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000000270	-	92	76.000	ENSCVAG00000002797	-	92	73.455	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000000270	-	92	80.220	ENSDARG00000103845	zgc:55733	91	80.709	Danio_rerio
ENSACIG00000000270	-	84	80.543	ENSDARG00000053810	hnrnpc	80	77.907	Danio_rerio
ENSACIG00000000270	-	94	47.826	ENSDORG00000003721	Ralyl	75	54.936	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000000270	-	63	56.250	ENSETEG00000014028	RALYL	83	59.394	Echinops_telfairi
ENSACIG00000000270	-	82	46.460	ENSEBUG00000012363	hnrnpc	66	46.083	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000000270	-	93	42.958	ENSEBUG00000006049	RALYL	74	48.113	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000000270	-	95	47.176	ENSEEUG00000007202	RALYL	76	55.172	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000000270	-	83	83.621	ENSELUG00000007714	-	90	77.528	Esox_lucius
ENSACIG00000000270	-	95	78.824	ENSELUG00000004132	-	88	81.679	Esox_lucius
ENSACIG00000000270	-	80	57.143	ENSFALG00000008647	RALYL	97	57.407	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000000270	-	90	88.519	ENSFHEG00000003605	-	90	87.956	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000000270	-	83	82.979	ENSFHEG00000007278	-	94	70.096	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000000270	-	80	57.674	ENSGALG00000036938	RALYL	75	54.425	Gallus_gallus
ENSACIG00000000270	-	99	85.763	ENSGAFG00000020486	-	89	88.321	Gambusia_affinis
ENSACIG00000000270	-	99	74.497	ENSGAFG00000020992	-	84	82.479	Gambusia_affinis
ENSACIG00000000270	-	84	75.000	ENSGACG00000018932	-	88	72.273	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000000270	-	89	81.716	ENSGACG00000017772	-	97	82.283	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSGGOG00000000841	RALYL	74	56.951	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000000270	-	99	75.241	ENSHBUG00000010527	-	81	82.375	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000000270	-	100	95.652	ENSHBUG00000018342	-	96	95.652	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000000270	-	95	46.488	ENSHGLG00000004866	RALYL	75	54.936	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000000270	-	95	46.488	ENSHGLG00100017480	RALYL	75	54.936	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000000270	-	82	84.348	ENSHCOG00000012333	hnrnpc	87	80.443	Hippocampus_comes
ENSACIG00000000270	-	99	75.191	ENSIPUG00000008666	zgc:55733	94	82.326	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000000270	-	93	77.143	ENSIPUG00000011271	hnrnpc	98	81.498	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000000270	-	95	47.351	ENSSTOG00000012583	RALYL	76	54.506	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000000270	-	91	92.620	ENSKMAG00000011170	-	89	92.674	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000000270	-	82	84.722	ENSKMAG00000018265	-	80	81.081	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000000270	-	100	82.353	ENSLBEG00000024418	-	100	80.392	Labrus_bergylta
ENSACIG00000000270	-	83	84.018	ENSLBEG00000006193	-	80	82.625	Labrus_bergylta
ENSACIG00000000270	-	99	86.441	ENSLBEG00000006979	-	99	84.694	Labrus_bergylta
ENSACIG00000000270	-	86	72.075	ENSLOCG00000002560	hnrnpc	89	70.611	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSMNEG00000033288	RALYL	74	56.951	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSMLEG00000038284	RALYL	74	56.951	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000000270	-	82	86.697	ENSMAMG00000008033	-	89	82.375	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000000270	-	99	93.537	ENSMAMG00000012236	-	96	93.624	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000000270	-	99	74.920	ENSMZEG00005024249	-	81	82.879	Maylandia_zebra
ENSACIG00000000270	-	100	95.318	ENSMZEG00005020460	-	96	95.318	Maylandia_zebra
ENSACIG00000000270	-	95	46.358	ENSMAUG00000015149	Ralyl	75	54.936	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000000270	-	95	48.789	ENSMICG00000005558	RALYL	80	78.481	Microcebus_murinus
ENSACIG00000000270	-	95	46.358	ENSMOCG00000017371	Ralyl	75	54.936	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000000270	-	86	90.234	ENSMMOG00000021465	-	89	92.188	Mola_mola
ENSACIG00000000270	-	99	77.220	ENSMMOG00000019520	-	84	85.909	Mola_mola
ENSACIG00000000270	-	86	82.353	ENSMALG00000007520	-	91	84.249	Monopterus_albus
ENSACIG00000000270	-	83	87.097	ENSMALG00000014623	-	81	84.047	Monopterus_albus
ENSACIG00000000270	-	95	46.026	ENSMUSG00000039717	Ralyl	93	77.215	Mus_musculus
ENSACIG00000000270	-	95	47.667	ENSMPUG00000010724	RALYL	75	54.077	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000000270	-	95	46.358	ENSNGAG00000013375	Ralyl	75	54.936	Nannospalax_galili
ENSACIG00000000270	-	99	76.000	ENSNBRG00000015676	-	87	80.242	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000000270	-	100	96.321	ENSNBRG00000004912	-	99	96.321	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSNLEG00000002702	RALYL	71	55.856	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000000270	-	68	50.256	ENSOPRG00000013650	-	98	49.254	Ochotona_princeps
ENSACIG00000000270	-	95	47.157	ENSODEG00000001012	RALYL	75	54.936	Octodon_degus
ENSACIG00000000270	-	99	75.241	ENSONIG00000018350	-	81	82.375	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000000270	-	100	95.066	ENSONIG00000007859	-	97	95.066	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000000270	-	99	78.571	ENSORLG00000009999	-	83	82.353	Oryzias_latipes
ENSACIG00000000270	-	84	79.468	ENSORLG00000003144	-	79	80.524	Oryzias_latipes
ENSACIG00000000270	-	99	78.231	ENSORLG00020018228	hnrnpc	83	81.961	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000000270	-	84	79.468	ENSORLG00015009460	-	79	80.524	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000000270	-	99	78.571	ENSORLG00015019755	-	83	82.353	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000000270	-	84	83.665	ENSOMEG00000020488	-	83	83.529	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000000270	-	82	85.253	ENSOMEG00000022665	-	80	83.077	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSPPAG00000038705	RALYL	74	56.951	Pan_paniscus
ENSACIG00000000270	-	95	49.481	ENSPPRG00000018612	RALYL	74	57.848	Panthera_pardus
ENSACIG00000000270	-	95	49.481	ENSPTIG00000020331	RALYL	74	57.848	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSPTRG00000020381	RALYL	74	56.951	Pan_troglodytes
ENSACIG00000000270	-	95	50.523	ENSPANG00000029305	RALYL	74	56.951	Papio_anubis
ENSACIG00000000270	-	92	79.787	ENSPKIG00000008592	-	88	80.142	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000000270	-	92	78.648	ENSPKIG00000022837	-	88	81.851	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000000270	-	82	52.586	ENSPSIG00000011135	RALYL	75	54.506	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000000270	-	100	81.509	ENSPMGG00000013144	-	90	82.278	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000000270	-	99	62.835	ENSPMGG00000017774	-	90	66.516	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000000270	-	95	46.358	ENSPEMG00000016447	Ralyl	75	54.936	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000000270	-	80	53.247	ENSPMAG00000002407	RALYL	97	51.982	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000000270	-	98	72.168	ENSPFOG00000002643	-	81	80.228	Poecilia_formosa
ENSACIG00000000270	-	99	87.162	ENSPFOG00000001583	-	89	90.182	Poecilia_formosa
ENSACIG00000000270	-	82	83.333	ENSPLAG00000000061	-	79	81.467	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000000270	-	99	86.102	ENSPLAG00000015305	-	89	89.051	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000000270	-	99	87.458	ENSPMEG00000004802	-	89	90.146	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000000270	-	82	82.870	ENSPMEG00000016524	-	79	83.012	Poecilia_mexicana
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ENSACIG00000000270	-	93	91.367	ENSPNYG00000020293	-	87	95.703	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000000270	-	99	74.910	ENSPNYG00000003747	-	86	82.375	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000000270	-	83	84.332	ENSPNAG00000015686	hnrnpc	86	78.906	Pygocentrus_nattereri
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