EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000000286 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 56262 bases
Position: chrCCOE01006632.1:19841-76102
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000000308	zf-met	PF12874.7	9e-13	1	3
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Transcripts

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ENSACIT00000000326	-	849	-	ENSACIP00000000308	282 (aa)	-	-

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Paralogs

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ENSACIG00000000286	-	72	56.281	ENSACIG00000022293	-	93	56.281
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ENSACIG00000000286	-	82	44.853	ENSACIG00000020938	zbtb47b	69	44.853
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ENSACIG00000000286	-	66	41.667	ENSACIG00000018641	snai2	51	41.667
ENSACIG00000000286	-	70	45.349	ENSACIG00000002180	-	98	45.349
ENSACIG00000000286	-	68	49.727	ENSACIG00000018404	-	77	49.727
ENSACIG00000000286	-	71	42.000	ENSACIG00000008886	znf1164	85	42.000
ENSACIG00000000286	-	72	53.988	ENSACIG00000009755	-	73	53.988
ENSACIG00000000286	-	90	63.265	ENSACIG00000018022	-	99	43.986
ENSACIG00000000286	-	91	54.438	ENSACIG00000006172	-	99	55.233
ENSACIG00000000286	-	62	42.169	ENSACIG00000006377	-	57	45.038
ENSACIG00000000286	-	83	53.333	ENSACIG00000004626	-	88	53.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSACIG00000000286	-	73	50.000	ENSAMEG00000003802	-	100	44.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000286	-	65	48.052	ENSAOCG00000024256	-	87	48.052	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000286	-	72	42.373	ENSAOCG00000015987	-	66	42.373	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000286	-	76	47.748	ENSAOCG00000012823	-	54	47.748	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000286	-	70	53.731	ENSAPEG00000005378	-	98	53.731	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000286	-	90	53.896	ENSAPEG00000005566	-	84	53.896	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000286	-	76	38.739	ENSAPEG00000018271	-	64	38.739	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000286	-	92	46.226	ENSATEG00000011221	-	65	46.226	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000286	-	86	55.280	ENSATEG00000008771	-	76	55.280	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000286	-	84	47.872	ENSACLG00000028002	-	91	47.872	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	87	55.932	ENSACLG00000017849	-	91	49.367	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	68	45.270	ENSACLG00000019094	-	78	45.270	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	85	49.153	ENSACLG00000015816	-	92	49.153	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	90	50.595	ENSACLG00000022439	-	98	50.595	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	69	42.056	ENSACLG00000004663	-	73	42.056	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	70	50.595	ENSACLG00000003332	-	97	50.595	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	91	62.722	ENSACLG00000011237	-	99	61.932	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000286	-	68	42.857	ENSACLG00000013033	-	81	41.667	Astatotilapia_calliptera
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