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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000000406 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prdm5
Alias: un-named hi61|unm hi61
Full Name: PR domain containing 5
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44569 bases
Position: chrCCOE01001181.1:1018569-1063137
Accession: ZDB-GENE-040708-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	1	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	2	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	3	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	4	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	5	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	6	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	7	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	8	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	9	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	10	11
ENSACIP00000000485	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-63	11	11
ENSACIP00000000485	zf-met	PF12874.7	3.5e-23	1	3
ENSACIP00000000485	zf-met	PF12874.7	3.5e-23	2	3
ENSACIP00000000485	zf-met	PF12874.7	3.5e-23	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000000509	-	1728	-	ENSACIP00000000485	575 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000000406	prdm5	75	41.709	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	82	41.709
ENSACIG00000000406	prdm5	75	35.000	ENSACIG00000001767	zbtb41	64	32.331
ENSACIG00000000406	prdm5	68	37.681	ENSACIG00000012604	scrt2	52	37.681
ENSACIG00000000406	prdm5	87	43.662	ENSACIG00000022625	-	85	37.868
ENSACIG00000000406	prdm5	91	42.105	ENSACIG00000019578	prdm12b	71	40.449
ENSACIG00000000406	prdm5	79	37.624	ENSACIG00000016117	-	90	37.624
ENSACIG00000000406	prdm5	70	35.593	ENSACIG00000018404	-	87	35.593
ENSACIG00000000406	prdm5	70	30.028	ENSACIG00000014233	znf407	66	30.028
ENSACIG00000000406	prdm5	68	36.774	ENSACIG00000017166	-	60	36.774
ENSACIG00000000406	prdm5	75	38.571	ENSACIG00000002180	-	99	38.571
ENSACIG00000000406	prdm5	84	40.000	ENSACIG00000010647	-	100	41.667
ENSACIG00000000406	prdm5	70	36.631	ENSACIG00000017644	-	88	36.631
ENSACIG00000000406	prdm5	83	44.379	ENSACIG00000017647	-	89	38.075
ENSACIG00000000406	prdm5	79	44.809	ENSACIG00000022658	-	94	42.292
ENSACIG00000000406	prdm5	79	43.066	ENSACIG00000018022	-	57	43.066
ENSACIG00000000406	prdm5	77	45.562	ENSACIG00000000311	-	60	45.562
ENSACIG00000000406	prdm5	59	36.765	ENSACIG00000006586	-	52	36.765
ENSACIG00000000406	prdm5	80	45.399	ENSACIG00000009755	-	90	45.087
ENSACIG00000000406	prdm5	82	33.495	ENSACIG00000023313	-	88	35.862
ENSACIG00000000406	prdm5	70	40.625	ENSACIG00000007882	-	84	40.625
ENSACIG00000000406	prdm5	86	42.056	ENSACIG00000003556	-	71	42.056
ENSACIG00000000406	prdm5	82	31.973	ENSACIG00000014282	znf526	85	30.686
ENSACIG00000000406	prdm5	77	40.845	ENSACIG00000013163	-	90	40.845
ENSACIG00000000406	prdm5	52	51.613	ENSACIG00000010660	-	97	51.613
ENSACIG00000000406	prdm5	80	43.537	ENSACIG00000007464	-	51	43.537
ENSACIG00000000406	prdm5	82	35.000	ENSACIG00000023212	-	78	36.585
ENSACIG00000000406	prdm5	62	44.872	ENSACIG00000007034	-	74	44.872
ENSACIG00000000406	prdm5	75	41.304	ENSACIG00000015835	-	73	53.535
ENSACIG00000000406	prdm5	83	37.349	ENSACIG00000019534	-	78	37.349
ENSACIG00000000406	prdm5	78	40.000	ENSACIG00000019815	-	83	37.209
ENSACIG00000000406	prdm5	95	33.333	ENSACIG00000022698	prdm14	54	31.953
ENSACIG00000000406	prdm5	70	42.012	ENSACIG00000009780	-	73	42.012
ENSACIG00000000406	prdm5	81	35.185	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	90	35.156
ENSACIG00000000406	prdm5	79	45.263	ENSACIG00000016944	-	78	45.263
ENSACIG00000000406	prdm5	75	37.615	ENSACIG00000013470	-	65	37.615
ENSACIG00000000406	prdm5	89	38.944	ENSACIG00000004041	-	99	39.286
ENSACIG00000000406	prdm5	86	44.348	ENSACIG00000018952	-	54	41.600
ENSACIG00000000406	prdm5	76	38.793	ENSACIG00000007855	-	91	38.793
ENSACIG00000000406	prdm5	71	43.182	ENSACIG00000001860	-	67	43.182
ENSACIG00000000406	prdm5	87	46.667	ENSACIG00000014123	znf236	66	41.593
ENSACIG00000000406	prdm5	71	33.158	ENSACIG00000012263	znf319b	90	31.127
ENSACIG00000000406	prdm5	71	35.319	ENSACIG00000009128	-	84	35.319
ENSACIG00000000406	prdm5	77	35.079	ENSACIG00000012636	ZNF319	90	35.079
ENSACIG00000000406	prdm5	72	35.341	ENSACIG00000001369	-	84	35.341
ENSACIG00000000406	prdm5	76	37.903	ENSACIG00000023794	-	70	37.903
ENSACIG00000000406	prdm5	85	30.673	ENSACIG00000013750	-	78	30.848
ENSACIG00000000406	prdm5	86	43.023	ENSACIG00000004666	-	99	39.196
ENSACIG00000000406	prdm5	77	41.991	ENSACIG00000010637	-	57	39.768
ENSACIG00000000406	prdm5	81	44.242	ENSACIG00000017013	-	54	44.242
ENSACIG00000000406	prdm5	75	35.714	ENSACIG00000020938	zbtb47b	67	35.714
ENSACIG00000000406	prdm5	75	45.133	ENSACIG00000006228	-	64	45.133
ENSACIG00000000406	prdm5	73	41.860	ENSACIG00000003720	-	66	41.860
ENSACIG00000000406	prdm5	73	32.766	ENSACIG00000015411	-	78	30.337
ENSACIG00000000406	prdm5	88	43.000	ENSACIG00000019447	-	67	43.000
ENSACIG00000000406	prdm5	74	41.463	ENSACIG00000002190	gfi1b	58	41.463
ENSACIG00000000406	prdm5	75	36.404	ENSACIG00000021986	-	93	36.111
ENSACIG00000000406	prdm5	76	32.011	ENSACIG00000013149	-	82	32.011
ENSACIG00000000406	prdm5	81	39.370	ENSACIG00000011153	-	72	46.269
ENSACIG00000000406	prdm5	75	38.235	ENSACIG00000017653	-	96	38.235
ENSACIG00000000406	prdm5	74	35.458	ENSACIG00000020982	znf710b	51	32.390
ENSACIG00000000406	prdm5	77	40.876	ENSACIG00000018641	snai2	54	40.876
ENSACIG00000000406	prdm5	73	32.515	ENSACIG00000016779	patz1	66	31.636
ENSACIG00000000406	prdm5	54	46.087	ENSACIG00000018059	-	50	46.087
ENSACIG00000000406	prdm5	82	37.045	ENSACIG00000022293	-	92	37.045
ENSACIG00000000406	prdm5	76	30.286	ENSACIG00000023049	znf646	99	32.743
ENSACIG00000000406	prdm5	86	37.853	ENSACIG00000013604	-	99	37.313
ENSACIG00000000406	prdm5	75	44.105	ENSACIG00000018440	-	96	44.105
ENSACIG00000000406	prdm5	81	43.030	ENSACIG00000003754	-	86	43.030
ENSACIG00000000406	prdm5	75	40.964	ENSACIG00000012084	-	94	40.796
ENSACIG00000000406	prdm5	75	39.227	ENSACIG00000017892	-	82	39.227
ENSACIG00000000406	prdm5	60	42.262	ENSACIG00000023162	-	67	42.771
ENSACIG00000000406	prdm5	73	38.650	ENSACIG00000007096	-	91	38.650
ENSACIG00000000406	prdm5	87	41.053	ENSACIG00000016182	-	81	41.830
ENSACIG00000000406	prdm5	86	42.105	ENSACIG00000006172	-	95	41.850
ENSACIG00000000406	prdm5	72	45.455	ENSACIG00000004641	-	50	45.455
ENSACIG00000000406	prdm5	78	37.582	ENSACIG00000017683	-	78	34.630
ENSACIG00000000406	prdm5	87	38.462	ENSACIG00000008448	-	71	38.462
ENSACIG00000000406	prdm5	82	35.484	ENSACIG00000003515	-	92	41.270
ENSACIG00000000406	prdm5	79	36.986	ENSACIG00000002944	-	91	36.986
ENSACIG00000000406	prdm5	83	41.277	ENSACIG00000009717	-	86	39.153
ENSACIG00000000406	prdm5	80	39.597	ENSACIG00000008886	znf1164	81	39.597
ENSACIG00000000406	prdm5	75	37.903	ENSACIG00000006377	-	61	37.903
ENSACIG00000000406	prdm5	86	39.823	ENSACIG00000024444	-	70	39.823
ENSACIG00000000406	prdm5	68	34.553	ENSACIG00000022330	-	83	34.553
ENSACIG00000000406	prdm5	93	42.105	ENSACIG00000005193	-	69	42.105
ENSACIG00000000406	prdm5	58	44.118	ENSACIG00000011318	snai1a	65	44.118
ENSACIG00000000406	prdm5	89	36.688	ENSACIG00000011541	-	67	38.214
ENSACIG00000000406	prdm5	75	40.972	ENSACIG00000016133	-	55	40.972
ENSACIG00000000406	prdm5	63	39.841	ENSACIG00000010966	-	50	40.323
ENSACIG00000000406	prdm5	86	33.796	ENSACIG00000015429	-	77	44.286
ENSACIG00000000406	prdm5	81	37.688	ENSACIG00000013508	ZNF384	50	36.916
ENSACIG00000000406	prdm5	80	42.473	ENSACIG00000022738	-	94	40.331
ENSACIG00000000406	prdm5	86	41.667	ENSACIG00000019102	-	55	41.667
ENSACIG00000000406	prdm5	75	39.698	ENSACIG00000006806	-	58	39.698
ENSACIG00000000406	prdm5	68	42.593	ENSACIG00000017298	sall4	55	42.593
ENSACIG00000000406	prdm5	75	38.068	ENSACIG00000006755	-	75	38.068
ENSACIG00000000406	prdm5	75	36.396	ENSACIG00000004626	-	85	36.042
ENSACIG00000000406	prdm5	80	43.750	ENSACIG00000000286	-	73	43.750
ENSACIG00000000406	prdm5	86	38.065	ENSACIG00000019710	-	74	38.065
ENSACIG00000000406	prdm5	73	35.374	ENSACIG00000009443	-	57	34.667
ENSACIG00000000406	prdm5	58	39.623	ENSACIG00000013946	-	52	38.679
ENSACIG00000000406	prdm5	92	38.961	ENSACIG00000017050	-	97	37.615
ENSACIG00000000406	prdm5	71	45.000	ENSACIG00000011515	-	66	45.000
ENSACIG00000000406	prdm5	75	33.636	ENSACIG00000007000	-	60	33.935
ENSACIG00000000406	prdm5	81	45.109	ENSACIG00000019791	-	93	45.109
ENSACIG00000000406	prdm5	79	33.465	ENSACIG00000019804	-	83	33.465
ENSACIG00000000406	prdm5	84	37.500	ENSACIG00000013613	scrt1b	59	37.500
ENSACIG00000000406	prdm5	83	34.859	ENSACIG00000010739	-	78	34.859
ENSACIG00000000406	prdm5	86	36.462	ENSACIG00000004745	-	91	41.520
ENSACIG00000000406	prdm5	68	37.037	ENSACIG00000001296	-	55	37.037

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000000406	prdm5	100	79.667	ENSG00000138738	PRDM5	100	79.000	Homo_sapiens
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.254	ENSAPOG00000023220	prdm5	100	95.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000000406	prdm5	91	72.695	ENSAMEG00000003050	PRDM5	98	72.518	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.770	ENSAOCG00000014806	prdm5	100	95.770	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000406	prdm5	100	85.294	ENSAPEG00000016846	prdm5	100	86.765	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.932	ENSATEG00000013829	prdm5	100	95.932	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000406	prdm5	95	78.773	ENSAPLG00000013828	PRDM5	100	80.100	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000000406	prdm5	100	76.070	ENSACAG00000012999	PRDM5	100	76.387	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000000406	prdm5	100	89.333	ENSANAG00000027411	PRDM5	100	89.333	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000406	prdm5	100	97.114	ENSACLG00000017996	prdm5	100	97.114	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000000406	prdm5	54	95.556	ENSOANG00000006197	-	100	95.556	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000000406	prdm5	99	79.261	ENSOANG00000015109	PRDM5	97	78.850	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000000406	prdm5	91	69.081	ENSOCUG00000013454	PRDM5	96	69.611	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000000406	prdm5	100	96.944	ENSPNYG00000012194	prdm5	100	96.944	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000000406	prdm5	100	91.582	ENSPNAG00000026181	prdm5	100	92.088	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000000406	prdm5	93	80.306	ENSPNAG00000023191	-	100	80.985	Pygocentrus_nattereri
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ENSACIG00000000406	prdm5	100	89.333	ENSRBIG00000041307	PRDM5	100	89.333	Rhinopithecus_bieti
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ENSACIG00000000406	prdm5	91	74.739	ENSSHAG00000003250	PRDM5	98	75.574	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000000406	prdm5	100	84.768	ENSSFOG00015020478	prdm5	100	84.768	Scleropages_formosus
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.763	ENSSMAG00000018844	prdm5	100	95.763	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.593	ENSSDUG00000020397	prdm5	100	95.593	Seriola_dumerili
ENSACIG00000000406	prdm5	100	95.593	ENSSLDG00000013353	prdm5	100	95.593	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000000406	prdm5	87	89.744	ENSSARG00000014129	-	63	89.744	Sorex_araneus
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ENSACIG00000000406	prdm5	100	91.452	ENSSPAG00000013866	prdm5	100	91.452	Stegastes_partitus
ENSACIG00000000406	prdm5	100	79.000	ENSSSCG00000009101	PRDM5	100	79.000	Sus_scrofa
ENSACIG00000000406	prdm5	95	80.833	ENSTGUG00000001920	PRDM5	100	80.167	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000000406	prdm5	100	91.906	ENSTRUG00000013850	prdm5	100	92.580	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000000406	prdm5	100	73.366	ENSTNIG00000005901	prdm5	100	73.920	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000000406	prdm5	95	67.114	ENSTBEG00000015386	PRDM5	86	67.114	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000000406	prdm5	100	74.010	ENSTTRG00000010996	PRDM5	100	74.010	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000000406	prdm5	94	87.607	ENSUAMG00000009994	PRDM5	76	87.607	Ursus_americanus
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ENSACIG00000000406	prdm5	97	65.742	ENSVPAG00000007435	PRDM5	100	65.416	Vicugna_pacos
ENSACIG00000000406	prdm5	91	76.325	ENSVVUG00000013192	PRDM5	96	75.972	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000000406	prdm5	100	77.215	ENSXETG00000002101	prdm5	100	77.057	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000000406	prdm5	100	96.441	ENSXCOG00000008567	prdm5	100	96.441	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000000406	prdm5	100	96.441	ENSXMAG00000013825	prdm5	100	96.441	Xiphophorus_maculatus