EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000000602 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl7
Alias: bb02h10|mg:bb02h10|wu:fa93c11
Full Name: ribosomal protein L7
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5857 bases
Position: chrCCOE01000449.1:3613375-3619231
Accession: ZDB-GENE-030131-8654
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000000782	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	2e-28	1	1
ENSACIP00000000834	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	3.5e-28	1	1
ENSACIP00000000915	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	3.5e-28	1	1
ENSACIP00000000720	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	3.6e-28	1	1
ENSACIP00000000909	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	3.5e-27	1	1
ENSACIP00000000927	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	6.4e-18	1	1
ENSACIP00000000927	Ribosomal_L30	PF00327.20	1.1e-23	1	1
ENSACIP00000000834	Ribosomal_L30	PF00327.20	1.4e-23	1	1
ENSACIP00000000915	Ribosomal_L30	PF00327.20	1.4e-23	1	1
ENSACIP00000000720	Ribosomal_L30	PF00327.20	1.5e-23	1	1
ENSACIP00000000782	Ribosomal_L30	PF00327.20	1.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000000958	-	738	-	ENSACIP00000000915	245 (aa)	-	-
ENSACIT00000000750	-	741	-	ENSACIP00000000720	246 (aa)	-	-
ENSACIT00000000952	-	348	-	ENSACIP00000000909	115 (aa)	-	-
ENSACIT00000000874	-	738	-	ENSACIP00000000834	245 (aa)	-	-
ENSACIT00000000819	-	834	-	ENSACIP00000000782	277 (aa)	-	-
ENSACIT00000000971	-	630	-	ENSACIP00000000927	209 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000000602	rpl7	100	50.403	ENSACIG00000010957	rpl7l1	100	50.403

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSG00000147604	RPL7	99	87.440	Homo_sapiens
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.964	ENSG00000146223	RPL7L1	98	46.429	Homo_sapiens
ENSACIG00000000602	rpl7	99	50.962	ENSAPOG00000006262	rpl7l1	100	49.393	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSAPOG00000002965	rpl7	100	92.653	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSAMEG00000001821	-	94	81.070	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000602	rpl7	67	81.295	ENSAMEG00000001370	-	97	63.235	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSAMEG00000002828	-	91	78.423	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000602	rpl7	100	47.581	ENSAMEG00000012791	RPL7L1	100	47.581	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000000602	rpl7	99	50.000	ENSAOCG00000013813	rpl7l1	100	48.583	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSAOCG00000013452	rpl7	100	92.245	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSAPEG00000021581	RPL7	100	92.308	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSAPEG00000022091	rpl7	100	92.308	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000602	rpl7	99	50.000	ENSAPEG00000004499	rpl7l1	100	48.583	Amphiprion_percula
ENSACIG00000000602	rpl7	99	51.923	ENSATEG00000014469	rpl7l1	99	51.020	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSATEG00000013417	rpl7	100	91.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	50.410	ENSAPLG00000013503	RPL7L1	94	50.410	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000000602	rpl7	99	84.951	ENSAPLG00000005601	-	100	83.740	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000000602	rpl7	98	49.793	ENSACAG00000029623	RPL7L1	97	49.793	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000000602	rpl7	98	92.105	ENSACAG00000014396	RPL7	93	84.774	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000000602	rpl7	99	43.033	ENSANAG00000024327	-	99	43.033	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	96	89.474	ENSANAG00000032525	-	84	72.199	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	80	70.060	ENSANAG00000034346	-	88	64.593	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	97	94.737	ENSANAG00000023865	-	98	81.481	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	81	46.471	ENSANAG00000033475	-	95	45.413	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	100	43.902	ENSANAG00000037180	-	100	43.902	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	99	80.193	ENSANAG00000028144	-	99	80.193	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	98	92.105	ENSANAG00000023767	-	94	68.443	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.559	ENSANAG00000024167	-	96	46.559	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	94	94.737	ENSANAG00000036501	-	97	79.253	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	86	44.811	ENSANAG00000037202	-	90	44.811	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	100	39.431	ENSANAG00000021742	-	99	38.247	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	99	77.778	ENSANAG00000035228	-	100	72.222	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000000602	rpl7	100	97.391	ENSACLG00000024449	rpl7	100	97.391	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000602	rpl7	100	51.613	ENSACLG00000017975	rpl7l1	87	51.613	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000000602	rpl7	100	50.403	ENSAMXG00000042591	rpl7l1	100	50.403	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000000602	rpl7	94	94.737	ENSAMXG00000008499	rpl7	95	84.583	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000000602	rpl7	63	50.382	ENSBTAG00000054190	-	85	50.382	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.154	ENSBTAG00000018478	RPL7L1	99	47.521	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	92.105	ENSBTAG00000020550	-	98	80.658	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	97	94.737	ENSBTAG00000019994	-	97	77.593	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	89.474	ENSBTAG00000005395	-	100	76.829	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSBTAG00000020139	RPL7	98	82.305	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	96	92.105	ENSBTAG00000006397	-	96	71.600	Bos_taurus
ENSACIG00000000602	rpl7	95	70.270	WBGene00004418	rpl-7	98	61.411	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSCJAG00000016367	-	99	75.510	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	92.105	ENSCJAG00000035175	-	100	80.383	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.559	ENSCJAG00000004637	-	98	45.238	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.534	ENSCJAG00000022076	-	94	43.529	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCJAG00000045387	-	99	81.224	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.939	ENSCJAG00000023295	-	88	44.939	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	94.737	ENSCJAG00000045886	-	98	82.573	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	97	92.105	ENSCJAG00000039031	-	100	81.070	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCJAG00000048312	-	97	81.893	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCJAG00000007686	-	98	88.614	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	89.474	ENSCAFG00000012624	-	99	78.689	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	76	70.440	ENSCAFG00000031677	-	83	70.440	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	98	41.250	ENSCAFG00000012801	-	98	41.494	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCAFG00000008021	RPL7	98	81.481	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	99	73.430	ENSCAFG00000001592	-	99	68.465	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	82	53.000	ENSCAFG00000003536	-	98	51.471	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	92	73.958	ENSCAFG00000009806	-	99	64.082	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	99	77.295	ENSCAFG00000017323	-	100	71.429	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	100	47.177	ENSCAFG00000001728	-	100	47.177	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	98	75.610	ENSCAFG00000013319	-	98	72.199	Canis_familiaris
ENSACIG00000000602	rpl7	96	92.105	ENSCAFG00020020086	-	90	72.065	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000000602	rpl7	99	89.474	ENSCAFG00020008863	-	88	79.508	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.774	ENSCAFG00020010586	RPL7L1	98	46.721	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCAFG00020017800	-	94	81.070	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000000602	rpl7	94	94.737	ENSCHIG00000020888	-	95	82.573	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSCHIG00000008256	-	97	82.645	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	94.737	ENSCHIG00000019636	-	89	75.309	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	89.474	ENSCHIG00000019721	-	96	76.096	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	85.507	ENSCHIG00000012399	-	98	80.247	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	46.122	ENSCHIG00000010307	-	100	47.154	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	92	34.513	ENSCHIG00000021712	-	96	34.802	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	46.091	ENSCHIG00000018263	-	100	45.492	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	98	86.842	ENSCHIG00000004863	-	98	78.189	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	99	75.845	ENSCHIG00000021291	-	90	72.614	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	92.105	ENSCHIG00000017520	-	97	80.498	Capra_hircus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	94.737	ENSTSYG00000006100	-	99	82.988	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.490	ENSTSYG00000004848	-	96	44.490	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	100	40.094	ENSTSYG00000028303	-	92	40.909	Carlito_syrichta
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ENSACIG00000000602	rpl7	98	72.195	ENSTSYG00000031719	-	100	67.339	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.340	ENSTSYG00000034839	-	97	44.309	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	97	74.257	ENSTSYG00000027148	-	94	67.623	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	97	37.917	ENSTSYG00000035034	-	100	37.917	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	97	83.168	ENSTSYG00000029576	-	99	83.168	Carlito_syrichta
ENSACIG00000000602	rpl7	95	37.879	ENSCAPG00000012737	RPL7L1	100	37.864	Cavia_aperea
ENSACIG00000000602	rpl7	97	79.703	ENSCAPG00000012202	-	96	79.703	Cavia_aperea
ENSACIG00000000602	rpl7	97	88.614	ENSCPOG00000004140	-	96	88.614	Cavia_porcellus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	40.891	ENSCPOG00000021189	RPL7L1	100	40.891	Cavia_porcellus
ENSACIG00000000602	rpl7	97	86.842	ENSCCAG00000023460	-	95	73.967	Cebus_capucinus
ENSACIG00000000602	rpl7	93	100.000	ENSCCAG00000001352	-	94	65.714	Cebus_capucinus
ENSACIG00000000602	rpl7	91	82.723	ENSCCAG00000022670	-	90	77.093	Cebus_capucinus
ENSACIG00000000602	rpl7	100	44.534	ENSCCAG00000023000	-	100	44.534	Cebus_capucinus
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