EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001022 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6255 bases
Position: chrCCOE01002212.1:5102-11356
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001214	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001270	-	1602	-	ENSACIP00000001214	533 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001022	-	97	66.731	ENSACIG00000003888	-	97	66.731
ENSACIG00000001022	-	98	72.212	ENSACIG00000014898	-	96	72.779
ENSACIG00000001022	-	95	70.727	ENSACIG00000023726	-	95	70.727
ENSACIG00000001022	-	87	39.019	ENSACIG00000009814	-	85	39.019
ENSACIG00000001022	-	98	65.583	ENSACIG00000014961	-	95	65.583
ENSACIG00000001022	-	94	69.291	ENSACIG00000012148	-	94	69.488
ENSACIG00000001022	-	95	68.885	ENSACIG00000003168	-	95	68.885
ENSACIG00000001022	-	94	68.191	ENSACIG00000021889	-	91	68.191
ENSACIG00000001022	-	96	58.915	ENSACIG00000008246	-	92	58.915
ENSACIG00000001022	-	94	69.062	ENSACIG00000008585	-	98	69.062
ENSACIG00000001022	-	88	36.122	ENSACIG00000009923	-	77	36.531
ENSACIG00000001022	-	98	65.643	ENSACIG00000014982	-	98	65.643
ENSACIG00000001022	-	85	35.881	ENSACIG00000022228	-	78	35.881
ENSACIG00000001022	-	72	67.526	ENSACIG00000023712	-	97	67.526
ENSACIG00000001022	-	96	69.186	ENSACIG00000008256	-	96	69.186
ENSACIG00000001022	-	98	66.031	ENSACIG00000002240	-	98	66.031
ENSACIG00000001022	-	94	68.849	ENSACIG00000021449	-	93	68.849
ENSACIG00000001022	-	97	64.896	ENSACIG00000010569	-	97	64.896
ENSACIG00000001022	-	98	61.686	ENSACIG00000014973	-	98	61.686
ENSACIG00000001022	-	93	31.250	ENSACIG00000022269	-	85	31.496
ENSACIG00000001022	-	93	66.600	ENSACIG00000021882	-	93	66.466

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001022	-	96	68.039	ENSAPOG00000005726	-	94	68.039	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001022	-	84	35.256	ENSAPOG00000016636	-	91	35.470	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001022	-	95	65.347	ENSAPOG00000005749	-	93	65.347	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001022	-	96	65.753	ENSAPOG00000021040	-	85	65.753	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001022	-	96	61.176	ENSAPEG00000000062	-	95	61.176	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001022	-	93	71.053	ENSATEG00000023346	-	91	71.053	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001022	-	96	67.251	ENSATEG00000019965	-	95	67.251	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001022	-	96	57.926	ENSATEG00000017635	-	94	57.926	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001022	-	96	66.796	ENSATEG00000012558	-	95	66.796	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001022	-	96	63.265	ENSACLG00000017259	-	95	63.265	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	97	58.721	ENSACLG00000018271	-	95	58.721	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	95	67.085	ENSACLG00000006538	-	98	67.085	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	97	62.906	ENSACLG00000021761	-	96	62.906	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	93	59.919	ENSACLG00000018599	-	94	59.919	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	94	60.750	ENSACLG00000010007	-	76	60.750	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	91	61.983	ENSACLG00000006543	-	88	62.272	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	78	70.820	ENSACLG00000009330	-	81	70.820	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	85	64.577	ENSACLG00000006285	-	99	64.577	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	71	67.717	ENSACLG00000015361	-	94	67.717	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	96	34.637	ENSACLG00000023468	-	88	34.823	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	67	40.318	ENSACLG00000023033	-	93	40.318	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	96	34.990	ENSACLG00000023126	-	98	34.990	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	97	69.006	ENSACLG00000009261	-	98	69.006	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001022	-	88	46.598	ENSAMXG00000029346	-	91	47.571	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	95	40.583	ENSAMXG00000039672	-	97	40.848	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	93	32.762	ENSAMXG00000036353	-	90	32.762	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	97	39.372	ENSAMXG00000034407	-	97	39.074	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	95	53.953	ENSAMXG00000030535	-	95	53.953	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	96	41.379	ENSAMXG00000037920	-	99	40.467	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	92	40.154	ENSAMXG00000032695	-	94	40.154	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	93	34.100	ENSAMXG00000035937	-	91	34.100	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	91	44.016	ENSAMXG00000033407	-	92	44.082	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	95	37.597	ENSAMXG00000041770	-	93	37.597	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001022	-	93	35.977	ENSCVAG00000015205	-	92	35.977	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	92	64.431	ENSCVAG00000007269	-	92	64.431	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	92	34.722	ENSCVAG00000011261	-	92	34.722	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	97	54.932	ENSCVAG00000008127	-	97	54.932	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	96	61.961	ENSCVAG00000009446	-	98	61.961	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	89	35.031	ENSCVAG00000008633	-	89	35.234	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	69	68.937	ENSCVAG00000014791	-	100	68.937	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	97	60.194	ENSCVAG00000008146	-	97	60.194	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	94	56.487	ENSCVAG00000006308	-	90	56.487	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000001022	-	96	56.471	ENSCVAG00000000224	-	86	56.250	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001022	-	89	64.854	ENSCVAG00000007831	-	97	61.942	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000001022	-	50	63.941	ENSCVAG00000022669	-	95	63.941	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000001022	-	93	32.171	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	88	32.171	Eptatretus_burgeri
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ENSACIG00000001022	-	93	48.527	ENSELUG00000010967	-	99	48.381	Esox_lucius
ENSACIG00000001022	-	93	57.171	ENSFHEG00000006425	-	97	57.315	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000001022	-	97	59.730	ENSFHEG00000006411	-	97	59.730	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001022	-	95	59.127	ENSFHEG00000006430	-	96	59.127	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000001022	-	95	58.135	ENSFHEG00000006408	-	96	58.135	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001022	-	97	59.038	ENSFHEG00000006403	-	98	59.038	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001022	-	95	58.071	ENSFHEG00000023034	-	98	58.071	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001022	-	94	35.590	ENSGMOG00000005680	-	86	35.521	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	94	34.047	ENSGMOG00000019330	-	88	33.397	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	88	34.151	ENSGMOG00000019825	-	98	34.504	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	95	34.893	ENSGMOG00000011319	-	98	34.893	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	94	34.351	ENSGMOG00000017552	-	86	34.351	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	85	33.839	ENSGMOG00000008232	-	98	33.839	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	57	34.185	ENSGMOG00000019529	-	74	33.043	Gadus_morhua
ENSACIG00000001022	-	98	58.566	ENSGAFG00000005023	-	95	58.566	Gambusia_affinis
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