EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001025 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-89b17.4
Alias: fj14g06|fj60g01|fk87f09|wu:fj14g06|wu:fj60g01|wu:fk87f09
Full Name: si:dkey-89b17.4
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6172 bases
Position: chrCCOE01000620.1:66518-72689
Accession: ZDB-GENE-030131-8215
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	1	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	2	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	3	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	4	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	5	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	6	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	7	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	8	9
ENSACIP00000001238	zf-C2H2	PF00096.26	8e-78	9	9
ENSACIP00000001251	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-53	1	5
ENSACIP00000001251	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-53	2	5
ENSACIP00000001251	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-53	3	5
ENSACIP00000001251	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-53	4	5
ENSACIP00000001251	zf-C2H2	PF00096.26	4.7e-53	5	5
ENSACIP00000001251	zf-met	PF12874.7	3.5e-09	1	2
ENSACIP00000001251	zf-met	PF12874.7	3.5e-09	2	2
ENSACIP00000001238	zf-met	PF12874.7	7.6e-07	1	2
ENSACIP00000001238	zf-met	PF12874.7	7.6e-07	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001308	-	3657	-	ENSACIP00000001251	1218 (aa)	-	-
ENSACIT00000001295	-	4467	-	ENSACIP00000001238	1488 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	60	34.839	ENSACIG00000024444	-	65	48.214
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	33.028	ENSACIG00000017683	-	84	33.028
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	88	32.867	ENSACIG00000009717	-	98	32.867
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	34.419	ENSACIG00000017013	-	57	39.286
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	52	45.872	ENSACIG00000007096	-	83	45.872
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	98	39.535	ENSACIG00000014123	znf236	74	39.726
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	77	36.538	ENSACIG00000013470	-	62	36.538
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	74	40.336	ENSACIG00000019815	-	92	40.336
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	98	38.411	ENSACIG00000022293	-	98	33.333
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	46.552	ENSACIG00000022625	-	96	46.552
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	91	44.444	ENSACIG00000016182	-	94	42.727
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	48.182	ENSACIG00000004666	-	94	45.455
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	33.486	ENSACIG00000008448	-	72	33.486
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	34.906	ENSACIG00000011153	-	79	41.818
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	41.732	ENSACIG00000000286	-	74	41.732
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	30.542	ENSACIG00000015429	-	78	42.188
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	74	47.273	ENSACIG00000001767	zbtb41	69	47.273
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	48.000	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	88	48.000
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	70	41.818	ENSACIG00000006755	-	97	41.818
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	84	36.290	ENSACIG00000011541	-	68	38.532
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	87	35.878	ENSACIG00000021986	-	98	35.878
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	73	32.000	ENSACIG00000007000	-	63	38.571
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	53	36.937	ENSACIG00000018404	-	80	36.937
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	33.333	ENSACIG00000003556	-	69	31.274
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	32.377	ENSACIG00000011515	-	70	32.231
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	68	38.971	ENSACIG00000003754	-	97	38.971
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	90	30.961	ENSACIG00000010647	-	99	41.905
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	67	33.898	ENSACIG00000001369	-	89	40.964
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	66	39.496	ENSACIG00000016354	gfi1ab	53	40.952
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	85	47.458	ENSACIG00000004041	-	95	30.233
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	36.054	ENSACIG00000017050	-	99	44.681
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	63	34.188	ENSACIG00000009755	-	74	34.188
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	33.333	ENSACIG00000004745	-	98	34.328
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	91	40.602	ENSACIG00000017647	-	94	40.602
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	88	30.469	ENSACIG00000017644	-	88	30.000
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	61	38.947	ENSACIG00000016117	-	84	38.947
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	40.909	ENSACIG00000007882	-	81	40.909
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	95	48.193	ENSACIG00000023049	znf646	97	55.072
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	83	41.860	ENSACIG00000006172	-	95	41.860
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	62	32.520	ENSACIG00000009128	-	85	33.913
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	63	37.405	ENSACIG00000009780	-	75	37.405
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	79	35.088	ENSACIG00000013149	-	83	34.821
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	36.047	ENSACIG00000014282	znf526	89	34.454
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	68	43.636	ENSACIG00000019447	-	71	40.000
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	46.835	ENSACIG00000004626	-	86	46.835
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	30.544	ENSACIG00000023794	-	84	37.931
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	51.786	ENSACIG00000012084	-	95	45.283
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	60	43.636	ENSACIG00000000311	-	58	43.636
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	73	41.509	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	81	41.509
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	41.071	ENSACIG00000022658	-	96	30.539
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	78	30.992	ENSACIG00000023212	-	78	39.695
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	64	33.333	ENSACIG00000007855	-	89	40.659
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	54	32.231	ENSACIG00000019804	-	87	40.000
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	62	32.530	ENSACIG00000002944	-	92	32.530
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	55	37.168	ENSACIG00000003720	-	65	40.952
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	30.769	ENSACIG00000022330	-	86	42.342
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	38.843	ENSACIG00000010966	-	51	38.843
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	86	30.348	ENSACIG00000019710	-	72	41.026
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	76	48.276	ENSACIG00000018440	-	96	48.276
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	34.286	ENSACIG00000013604	-	86	43.750
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	37.963	ENSACIG00000013163	-	80	37.963
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	34.615	ENSACIG00000016944	-	94	34.615
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	39.669	ENSACIG00000019791	-	90	39.669
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	33.333	ENSACIG00000017653	-	96	33.333
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	76	49.091	ENSACIG00000022738	-	95	44.304
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	87	31.579	ENSACIG00000013750	-	83	31.579

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	43.097	ENSAPOG00000020151	znf646	100	42.670	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	93.625	ENSAPOG00000018015	si:dkey-89b17.4	100	93.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.289	ENSAOCG00000012062	znf646	100	55.769	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	93.785	ENSAOCG00000018684	si:dkey-89b17.4	100	93.785	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.226	ENSAPEG00000006427	znf646	100	55.769	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	94.361	ENSAPEG00000007719	si:dkey-89b17.4	100	94.361	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	91.799	ENSATEG00000016814	si:dkey-89b17.4	100	91.879	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.360	ENSATEG00000015206	znf646	90	58.182	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.608	ENSACLG00000012712	znf646	100	42.528	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	95.295	ENSACLG00000016017	si:dkey-89b17.4	100	95.295	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.026	ENSAMXG00000035525	znf646	100	39.173	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	68.603	ENSAMXG00000001155	si:dkey-89b17.4	99	67.846	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	87.097	ENSCSEG00000010769	si:dkey-89b17.4	100	86.290	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	56.579	ENSCSEG00000012389	znf646	100	57.143	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	87.997	ENSCVAG00000012420	si:dkey-89b17.4	100	87.997	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.743	ENSDARG00000061424	znf646	100	52.542	Danio_rerio
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	67.471	ENSDARG00000075545	si:dkey-89b17.4	100	67.049	Danio_rerio
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.927	ENSELUG00000010423	znf646	98	48.148	Esox_lucius
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	72.713	ENSELUG00000015516	si:dkey-89b17.4	98	72.433	Esox_lucius
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	93	43.590	ENSFHEG00000000561	znf646	98	43.590	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	87.629	ENSFHEG00000019457	si:dkey-89b17.4	100	88.184	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	60.377	ENSGMOG00000016554	znf646	99	60.377	Gadus_morhua
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	55.556	ENSGAFG00000016353	-	93	55.556	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	89.163	ENSGAFG00000000345	si:dkey-89b17.4	100	89.163	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	74.297	ENSGACG00000014714	si:dkey-89b17.4	100	74.297	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	60.377	ENSGACG00000008733	znf646	88	60.377	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	95.375	ENSHBUG00000013093	si:dkey-89b17.4	100	95.375	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	42.555	ENSHBUG00000004840	znf646	100	63.636	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	99	39.738	ENSHCOG00000014890	znf646	100	51.190	Hippocampus_comes
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