EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001068 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9894 bases
Position: chrCCOE01000097.1:1978099-1987992
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002213	DEAD	PF00270.29	1.9e-49	1	1
ENSACIP00000001998	DEAD	PF00270.29	2.5e-49	1	1
ENSACIP00000002203	DEAD	PF00270.29	4.1e-49	1	1
ENSACIP00000002182	DEAD	PF00270.29	4.3e-49	1	1
ENSACIP00000002206	DEAD	PF00270.29	4.3e-49	1	1
ENSACIP00000002131	DEAD	PF00270.29	4.8e-49	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002287	-	1746	-	ENSACIP00000002206	581 (aa)	-	-
ENSACIT00000002075	-	1458	-	ENSACIP00000001998	485 (aa)	-	-
ENSACIT00000002284	-	1773	-	ENSACIP00000002203	590 (aa)	-	-
ENSACIT00000002294	-	1335	-	ENSACIP00000002213	444 (aa)	-	-
ENSACIT00000002263	-	1797	-	ENSACIP00000002182	598 (aa)	-	-
ENSACIT00000002316	-	375	-	ENSACIP00000002235	124 (aa)	-	-
ENSACIT00000002212	-	1890	-	ENSACIP00000002131	629 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001068	-	69	33.913	ENSACIG00000000989	eif4a2	82	36.337
ENSACIG00000001068	-	65	30.395	ENSACIG00000006033	ddx31	62	30.729
ENSACIG00000001068	-	84	32.374	ENSACIG00000009666	ddx59	72	33.333
ENSACIG00000001068	-	77	30.263	ENSACIG00000014378	ddx27	96	39.394
ENSACIG00000001068	-	82	42.857	ENSACIG00000023986	-	61	44.717
ENSACIG00000001068	-	91	78.251	ENSACIG00000022414	ddx5	94	82.533
ENSACIG00000001068	-	54	33.233	ENSACIG00000016665	zgc:193690	67	32.231
ENSACIG00000001068	-	55	43.548	ENSACIG00000013747	ddx56	52	43.548
ENSACIG00000001068	-	66	31.527	ENSACIG00000002843	ddx52	72	31.084
ENSACIG00000001068	-	82	36.905	ENSACIG00000008618	DDX41	68	39.609
ENSACIG00000001068	-	90	74.099	ENSACIG00000006502	DDX5	95	64.570
ENSACIG00000001068	-	92	90.000	ENSACIG00000007438	-	87	92.031
ENSACIG00000001068	-	71	30.226	ENSACIG00000018534	ddx18	56	32.768
ENSACIG00000001068	-	87	40.376	ENSACIG00000007376	ddx42	55	42.857
ENSACIG00000001068	-	68	30.159	ENSACIG00000007580	ddx55	61	31.868
ENSACIG00000001068	-	80	41.928	ENSACIG00000013354	-	76	42.549
ENSACIG00000001068	-	65	30.241	ENSACIG00000018355	-	67	30.128
ENSACIG00000001068	-	83	39.225	ENSACIG00000012170	ddx43	62	42.157
ENSACIG00000001068	-	69	33.819	ENSACIG00000009719	eif4a3	83	36.443
ENSACIG00000001068	-	90	35.625	ENSACIG00000000022	ddx23	61	35.625
ENSACIG00000001068	-	70	32.698	ENSACIG00000011029	ddx49	76	33.158
ENSACIG00000001068	-	72	35.933	ENSACIG00000022802	ddx47	72	38.375
ENSACIG00000001068	-	81	32.353	ENSACIG00000012927	ddx10	53	30.719
ENSACIG00000001068	-	67	37.609	ENSACIG00000017623	ddx4	85	41.399

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSG00000108654	DDX5	100	89.759	Homo_sapiens
ENSACIG00000001068	-	97	93.711	ENSAPOG00000002796	-	98	93.634	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSAPOG00000002749	ddx5	86	73.420	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001068	-	90	77.928	ENSAPOG00000018223	DDX5	97	65.047	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSAMEG00000002685	DDX5	68	82.533	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSAOCG00000022960	ddx5	93	75.258	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001068	-	97	93.711	ENSAOCG00000003224	-	100	90.755	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001068	-	90	77.703	ENSAOCG00000010337	DDX5	97	65.047	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001068	-	97	93.920	ENSAPEG00000012868	-	100	90.923	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001068	-	90	77.703	ENSAPEG00000002878	DDX5	97	65.047	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSAPEG00000014685	ddx5	88	73.557	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSATEG00000010482	ddx5	90	71.504	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001068	-	90	77.928	ENSATEG00000005840	DDX5	78	75.930	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001068	-	95	95.012	ENSATEG00000008746	-	99	95.012	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001068	-	94	78.913	ENSAPLG00000009071	DDX5	76	82.969	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000001068	-	95	68.298	ENSACAG00000025568	-	77	72.885	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001068	-	95	78.419	ENSACAG00000000843	-	77	82.571	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001068	-	86	90.052	ENSACAG00000008158	-	94	81.869	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSANAG00000007624	DDX5	71	87.500	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001068	-	90	78.378	ENSACLG00000003098	DDX5	97	65.881	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSACLG00000018254	ddx5	73	82.571	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001068	-	95	76.618	ENSAMXG00000004466	ddx5	74	83.442	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001068	-	96	78.526	ENSAMXG00000015550	DDX5	88	82.732	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001068	-	63	89.389	ENSAMXG00000042015	-	97	95.793	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSBTAG00000018423	DDX5	75	82.533	Bos_taurus
ENSACIG00000001068	-	97	77.731	ENSCJAG00000019310	DDX5	81	82.751	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCAFG00000011713	DDX5	68	82.533	Canis_familiaris
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCAFG00020026563	DDX5	75	82.533	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCHIG00000011800	DDX5	75	82.533	Capra_hircus
ENSACIG00000001068	-	94	78.091	ENSTSYG00000012149	DDX5	81	82.096	Carlito_syrichta
ENSACIG00000001068	-	82	63.951	ENSCAPG00000007398	DDX5	97	68.395	Cavia_aperea
ENSACIG00000001068	-	95	78.511	ENSCPOG00000007133	DDX5	75	82.533	Cavia_porcellus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCCAG00000037932	DDX5	81	82.533	Cebus_capucinus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCATG00000040784	DDX5	81	82.533	Cercocebus_atys
ENSACIG00000001068	-	95	78.511	ENSCLAG00000006874	DDX5	75	82.533	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCSAG00000004022	DDX5	75	82.533	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000001068	-	94	75.435	ENSCHOG00000008207	DDX5	78	74.732	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000001068	-	94	78.696	ENSCPBG00000009227	DDX5	76	82.751	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000001068	-	92	86.504	ENSCPBG00000023015	-	94	89.637	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSCANG00000038487	DDX5	81	82.533	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000001068	-	95	78.298	ENSCGRG00001014644	Ddx5	74	82.314	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000001068	-	95	78.298	ENSCGRG00000013097	Ddx5	74	82.314	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000001068	-	90	77.477	ENSCSEG00000007987	DDX5	73	80.952	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000001068	-	89	78.539	ENSCSEG00000014167	ddx5	75	82.135	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000001068	-	92	77.042	ENSCVAG00000018093	ddx5	93	81.659	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001068	-	63	90.000	ENSCVAG00000015378	-	64	78.039	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001068	-	98	77.254	ENSDARG00000038068	ddx5	92	82.969	Danio_rerio
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ENSACIG00000001068	-	97	76.681	ENSDNOG00000039281	-	75	81.659	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000001068	-	95	78.298	ENSDORG00000004866	Ddx5	75	82.314	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSETEG00000019950	DDX5	74	82.533	Echinops_telfairi
ENSACIG00000001068	-	95	70.968	ENSEBUG00000011578	ddx5	67	74.713	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001068	-	91	76.906	ENSEBUG00000004340	ddx5	96	66.047	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSEASG00005014694	DDX5	93	82.533	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSECAG00000011132	DDX5	75	82.533	Equus_caballus
ENSACIG00000001068	-	92	84.292	ENSEEUG00000002487	-	62	89.462	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000001068	-	94	89.565	ENSELUG00000001184	-	96	82.400	Esox_lucius
ENSACIG00000001068	-	96	77.637	ENSELUG00000007424	DDX5	83	76.608	Esox_lucius
ENSACIG00000001068	-	93	86.739	ENSELUG00000024602	-	97	76.899	Esox_lucius
ENSACIG00000001068	-	96	77.004	ENSELUG00000009107	ddx5	78	78.112	Esox_lucius
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSFCAG00000003512	DDX5	71	87.500	Felis_catus
ENSACIG00000001068	-	95	78.846	ENSFALG00000002317	DDX5	75	83.188	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000001068	-	94	78.478	ENSFDAG00000019420	-	76	82.533	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000001068	-	95	64.392	ENSFDAG00000017549	-	78	68.192	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000001068	-	91	76.889	ENSFHEG00000011093	ddx5	93	81.522	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001068	-	90	78.153	ENSFHEG00000005567	DDX5	86	81.934	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001068	-	91	83.705	ENSFHEG00000015667	-	96	72.196	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001068	-	89	77.397	ENSGMOG00000010758	ddx5	74	79.526	Gadus_morhua
ENSACIG00000001068	-	95	78.419	ENSGALG00000003532	DDX5	76	82.751	Gallus_gallus
ENSACIG00000001068	-	89	78.767	ENSGAFG00000017380	ddx5	86	83.247	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001068	-	82	80.220	ENSGAFG00000010491	-	62	80.429	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001068	-	91	88.565	ENSGAFG00000013389	-	96	79.167	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001068	-	89	79.224	ENSGACG00000007026	ddx5	86	73.519	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000001068	-	90	66.889	ENSGACG00000019254	DDX5	79	66.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000001068	-	92	78.808	ENSGAGG00000020790	DDX5	76	82.751	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000001068	-	91	86.667	ENSGAGG00000021204	-	96	75.360	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSGGOG00000015418	DDX5	81	82.533	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000001068	-	90	78.378	ENSHBUG00000002856	DDX5	97	65.881	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000001068	-	89	78.995	ENSHBUG00000022017	ddx5	73	82.751	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000001068	-	95	78.511	ENSHGLG00000001771	DDX5	74	82.533	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000001068	-	95	78.511	ENSHGLG00100001046	DDX5	74	82.533	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000001068	-	92	85.144	ENSHCOG00000017168	-	94	76.214	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001068	-	90	77.703	ENSHCOG00000019168	DDX5	73	80.645	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001068	-	98	75.142	ENSHCOG00000008800	ddx5	74	82.969	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001068	-	97	90.985	ENSHCOG00000006456	-	99	81.764	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001068	-	96	79.158	ENSIPUG00000014448	ddx5	86	83.290	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000001068	-	96	78.333	ENSIPUG00000007815	ddx5	73	84.061	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSSTOG00000012526	DDX5	75	82.533	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSACIG00000001068	-	97	77.311	ENSTBEG00000009490	DDX5	95	82.314	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000001068	-	76	87.936	ENSTBEG00000012479	-	74	74.081	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSTTRG00000008793	DDX5	75	82.533	Tursiops_truncatus
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ENSACIG00000001068	-	88	88.010	ENSUMAG00000014651	-	93	88.010	Ursus_maritimus
ENSACIG00000001068	-	97	76.261	ENSVPAG00000010759	DDX5	74	81.223	Vicugna_pacos
ENSACIG00000001068	-	97	77.521	ENSVVUG00000006263	DDX5	75	82.533	Vulpes_vulpes
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ENSACIG00000001068	-	92	83.186	ENSXCOG00000012232	-	92	87.611	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000001068	-	92	76.872	ENSXMAG00000008305	ddx5	97	81.938	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000001068	-	90	77.703	ENSXMAG00000006131	DDX5	79	75.000	Xiphophorus_maculatus