EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001070 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3742 bases
Position: chrCCOE01002236.1:7666-11407
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001265	MMR_HSR1	PF01926.23	9.7e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001322	-	834	-	ENSACIP00000001265	277 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001070	-	83	53.448	ENSACIG00000016888	-	76	53.448
ENSACIG00000001070	-	82	45.726	ENSACIG00000016313	-	73	45.339
ENSACIG00000001070	-	57	53.125	ENSACIG00000012761	-	90	53.125
ENSACIG00000001070	-	59	51.220	ENSACIG00000000976	-	81	51.220
ENSACIG00000001070	-	75	52.153	ENSACIG00000004040	-	83	52.153
ENSACIG00000001070	-	74	38.144	ENSACIG00000005573	-	89	38.144
ENSACIG00000001070	-	78	49.545	ENSACIG00000002950	-	59	49.772
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ENSACIG00000001070	-	72	45.098	ENSACIG00000014655	-	76	45.098
ENSACIG00000001070	-	83	54.783	ENSACIG00000008045	-	88	55.172
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ENSACIG00000001070	-	72	51.471	ENSACIG00000006478	-	76	51.471
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ENSACIG00000001070	-	71	52.406	ENSACIG00000007158	-	67	52.406
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ENSACIG00000001070	-	71	45.500	ENSACIG00000014703	-	83	45.500
ENSACIG00000001070	-	76	50.237	ENSACIG00000000893	-	85	50.237
ENSACIG00000001070	-	82	64.035	ENSACIG00000023381	-	90	64.035
ENSACIG00000001070	-	58	49.689	ENSACIG00000001465	-	94	49.689
ENSACIG00000001070	-	86	62.762	ENSACIG00000007494	-	85	61.004
ENSACIG00000001070	-	72	46.500	ENSACIG00000019524	-	84	46.500
ENSACIG00000001070	-	86	67.364	ENSACIG00000002263	-	88	66.667
ENSACIG00000001070	-	81	36.052	ENSACIG00000005587	-	81	36.052
ENSACIG00000001070	-	66	37.433	ENSACIG00000014670	-	72	37.433
ENSACIG00000001070	-	87	88.382	ENSACIG00000004245	-	89	87.903
ENSACIG00000001070	-	80	48.908	ENSACIG00000012648	-	77	48.908
ENSACIG00000001070	-	65	36.170	ENSACIG00000014737	-	87	36.170
ENSACIG00000001070	-	65	89.503	ENSACIG00000008666	-	88	89.503
ENSACIG00000001070	-	79	47.321	ENSACIG00000005780	-	68	47.321
ENSACIG00000001070	-	67	48.936	ENSACIG00000007178	-	65	48.936
ENSACIG00000001070	-	73	41.667	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	41.667
ENSACIG00000001070	-	88	40.650	ENSACIG00000020244	-	99	40.650
ENSACIG00000001070	-	88	61.728	ENSACIG00000022366	-	88	61.728
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ENSACIG00000001070	-	58	51.515	ENSACIG00000012204	-	71	51.515
ENSACIG00000001070	-	81	44.889	ENSACIG00000014690	-	86	44.889
ENSACIG00000001070	-	76	49.533	ENSACIG00000012718	-	89	49.533
ENSACIG00000001070	-	69	43.750	ENSACIG00000012714	-	64	43.750
ENSACIG00000001070	-	81	46.320	ENSACIG00000006484	-	71	46.320
ENSACIG00000001070	-	81	48.918	ENSACIG00000016635	-	83	48.918
ENSACIG00000001070	-	82	58.333	ENSACIG00000008001	-	90	59.330
ENSACIG00000001070	-	73	46.078	ENSACIG00000014716	-	82	46.078
ENSACIG00000001070	-	75	47.143	ENSACIG00000007191	-	59	47.143
ENSACIG00000001070	-	75	30.986	ENSACIG00000007725	-	75	30.986
ENSACIG00000001070	-	84	61.373	ENSACIG00000001455	-	86	61.373
ENSACIG00000001070	-	68	36.082	ENSACIG00000009811	-	79	36.082
ENSACIG00000001070	-	75	46.919	ENSACIG00000014662	-	86	46.919
ENSACIG00000001070	-	71	41.546	ENSACIG00000012061	-	62	42.995
ENSACIG00000001070	-	66	48.087	ENSACIG00000015088	-	73	48.087
ENSACIG00000001070	-	72	46.269	ENSACIG00000014745	-	91	46.269
ENSACIG00000001070	-	82	46.552	ENSACIG00000019149	-	70	47.414
ENSACIG00000001070	-	69	33.803	ENSACIG00000009149	-	73	33.803
ENSACIG00000001070	-	77	49.309	ENSACIG00000022222	-	69	49.309
ENSACIG00000001070	-	64	44.444	ENSACIG00000000631	-	73	41.593
ENSACIG00000001070	-	70	44.103	ENSACIG00000014634	zgc:113625	79	43.655
ENSACIG00000001070	-	73	46.569	ENSACIG00000020225	-	86	43.426
ENSACIG00000001070	-	75	34.562	ENSACIG00000003050	-	94	35.377
ENSACIG00000001070	-	81	48.485	ENSACIG00000022355	-	79	48.485
ENSACIG00000001070	-	70	38.614	ENSACIG00000003906	-	66	38.614
ENSACIG00000001070	-	95	58.271	ENSACIG00000007466	-	90	63.519
ENSACIG00000001070	-	75	45.498	ENSACIG00000014680	-	91	45.498
ENSACIG00000001070	-	89	63.158	ENSACIG00000003582	-	82	62.451

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001070	-	73	46.798	ENSAPOG00000007322	-	65	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	78	44.037	ENSAPOG00000001315	-	67	44.037	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	73	51.232	ENSAPOG00000011509	-	74	50.226	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	94	62.308	ENSAPOG00000021159	-	83	62.891	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	92	62.109	ENSAPOG00000008063	-	80	63.200	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	75	48.792	ENSAPOG00000020897	-	79	48.804	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	73	46.117	ENSAPOG00000014243	-	85	46.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	86	61.250	ENSAPOG00000012716	-	85	60.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	75	52.174	ENSAPOG00000006169	-	61	51.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	75	52.174	ENSAPOG00000006488	-	85	51.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	70	45.178	ENSAPOG00000022240	-	57	45.178	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	72	47.030	ENSAPOG00000007333	-	75	42.802	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	76	46.729	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	75	46.729	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	89	42.491	ENSAPOG00000014759	-	91	42.491	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	68	50.267	ENSAPOG00000001262	-	89	50.267	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	83	41.221	ENSAPOG00000001268	-	67	41.221	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001070	-	81	51.111	ENSAOCG00000023255	-	80	51.111	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	73	44.335	ENSAOCG00000011167	-	67	44.776	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	72	47.030	ENSAOCG00000011155	-	78	43.233	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	80	50.667	ENSAOCG00000021905	-	82	43.956	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	79	40.909	ENSAOCG00000011794	-	66	40.909	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	72	43.564	ENSAOCG00000012651	-	86	43.902	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	84	48.718	ENSAOCG00000023240	-	87	48.718	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	84	50.855	ENSAOCG00000008525	-	68	50.855	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	81	52.000	ENSAOCG00000008522	-	74	52.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	83	48.855	ENSAOCG00000014702	-	87	48.855	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	71	47.475	ENSAOCG00000001993	-	80	48.792	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001070	-	81	50.442	ENSAPEG00000015763	-	83	43.796	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000001070	-	79	40.909	ENSAPEG00000000770	-	66	40.909	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001070	-	73	47.573	ENSAPEG00000012191	-	70	47.573	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001070	-	73	41.176	ENSAPEG00000013651	-	80	41.176	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001070	-	88	52.245	ENSAPEG00000003884	-	79	52.245	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000001070	-	73	44.335	ENSAPEG00000012179	-	69	44.776	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001070	-	70	49.223	ENSAPEG00000016554	-	79	49.275	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001070	-	74	43.750	ENSATEG00000017202	-	62	43.220	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	84	63.445	ENSATEG00000014028	-	75	63.445	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	73	44.279	ENSATEG00000020431	zgc:113625	94	40.249	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	73	45.771	ENSATEG00000020391	-	83	45.771	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	88	47.970	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	86	48.444	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	73	47.783	ENSATEG00000017198	-	85	42.745	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	72	46.535	ENSATEG00000017193	-	67	45.022	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	79	42.222	ENSATEG00000005844	-	66	42.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	70	57.949	ENSATEG00000016536	-	59	57.949	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	90	62.000	ENSATEG00000013008	-	86	62.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	88	60.656	ENSATEG00000014085	-	83	61.475	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	76	52.857	ENSATEG00000019003	-	80	52.857	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001070	-	84	37.872	ENSACLG00000011913	-	68	37.872	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000001070	-	86	65.417	ENSACLG00000025976	-	75	65.417	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001070	-	69	45.641	ENSACLG00000003276	-	75	45.641	Astatotilapia_calliptera
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