EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001197 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6958 bases
Position: chrCCOE01000075.1:115720-122677
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001444	GTP_EFTU	PF00009.27	6.8e-54	1	1
ENSACIP00000001444	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	4.2e-14	1	1
ENSACIP00000001444	GTP_EFTU_D3	PF03143.17	3.1e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001502	-	1389	-	ENSACIP00000001444	462 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001197	-	95	36.569	ENSACIG00000006643	GSPT1	85	36.652
ENSACIG00000001197	-	95	37.783	ENSACIG00000007028	-	87	37.783
ENSACIG00000001197	-	95	40.909	ENSACIG00000017087	hbs1l	74	40.909
ENSACIG00000001197	-	90	89.855	ENSACIG00000005630	-	100	89.855
ENSACIG00000001197	-	90	89.855	ENSACIG00000001219	-	99	89.855
ENSACIG00000001197	-	90	90.338	ENSACIG00000011859	eef1a1b	100	90.338
ENSACIG00000001197	-	97	68.000	ENSACIG00000020985	si:dkey-37o8.1	84	68.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSG00000156508	EEF1A1	100	98.621	Homo_sapiens
ENSACIG00000001197	-	99	90.217	ENSG00000101210	EEF1A2	100	97.368	Homo_sapiens
ENSACIG00000001197	-	100	91.126	ENSAPOG00000001743	eef1a1b	100	91.126	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001197	-	97	91.314	ENSAPOG00000001301	EEF1A1	99	91.314	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001197	-	93	89.744	ENSAMEG00000001552	EEF1A2	99	89.744	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001197	-	100	64.363	ENSAMEG00000014898	-	100	64.363	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001197	-	100	85.281	ENSAMEG00000003800	-	100	85.281	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001197	-	98	90.308	ENSAMEG00000007786	-	97	90.308	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSAOCG00000012886	eef1a1b	100	90.693	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001197	-	100	90.260	ENSAOCG00000001055	-	100	90.260	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001197	-	100	96.104	ENSAOCG00000022025	-	100	96.104	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001197	-	100	91.991	ENSAPEG00000016322	-	100	91.991	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSAPEG00000001072	eef1a1b	100	90.693	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001197	-	100	96.320	ENSAPEG00000016257	-	100	96.320	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001197	-	100	90.260	ENSAPEG00000012561	-	100	90.260	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001197	-	100	97.619	ENSATEG00000003212	-	100	97.619	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001197	-	100	90.909	ENSATEG00000001388	eef1a1b	100	90.909	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001197	-	100	91.342	ENSATEG00000012623	EEF1A1	100	91.342	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001197	-	89	88.862	ENSAPLG00000008691	EEF1A2	99	88.862	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000001197	-	100	90.260	ENSAPLG00000009349	EEF1A1	100	90.260	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000001197	-	99	89.783	ENSACAG00000006007	EEF1A2	99	89.783	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSACAG00000004556	-	100	90.693	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001197	-	96	85.973	ENSANAG00000020685	-	100	85.973	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	99	90.217	ENSANAG00000035272	EEF1A2	99	90.217	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	83	88.052	ENSANAG00000009320	-	100	88.052	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	99	85.870	ENSANAG00000038380	-	98	87.963	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	100	80.087	ENSANAG00000004878	-	100	80.087	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	97	88.222	ENSANAG00000028383	EEF1A1	100	88.222	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001197	-	100	91.126	ENSACLG00000007936	eef1a1b	100	91.126	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001197	-	100	98.918	ENSACLG00000022529	-	100	98.918	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001197	-	100	91.126	ENSACLG00000026047	EEF1A1	100	91.126	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001197	-	100	90.476	ENSAMXG00000020651	eef1a1b	100	90.476	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001197	-	99	89.130	ENSAMXG00000002854	eef1a2	99	89.130	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001197	-	100	93.939	ENSAMXG00000029743	-	100	93.939	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001197	-	100	91.126	ENSAMXG00000004487	EEF1A1	100	91.126	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001197	-	99	90.217	ENSBTAG00000021685	EEF1A2	99	90.217	Bos_taurus
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSBTAG00000014534	EEF1A1	100	90.693	Bos_taurus
ENSACIG00000001197	-	94	90.741	ENSBTAG00000034185	-	98	90.741	Bos_taurus
ENSACIG00000001197	-	99	90.217	ENSCJAG00000010227	EEF1A2	99	90.217	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001197	-	100	74.242	ENSCJAG00000017492	-	100	74.242	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001197	-	92	89.202	ENSCJAG00000022080	-	99	89.202	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001197	-	100	88.528	ENSCJAG00000001365	-	100	88.528	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001197	-	100	90.260	ENSCAFG00000012222	-	100	90.260	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	86.797	ENSCAFG00000023039	-	100	86.797	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	90.476	ENSCAFG00000029427	-	100	90.476	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSCAFG00000002656	EEF1A1	100	90.693	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	89.177	ENSCAFG00000003668	-	100	89.177	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	90.693	ENSCAFG00000018586	-	100	90.693	Canis_familiaris
ENSACIG00000001197	-	100	88.528	ENSCAFG00000028808	-	100	88.528	Canis_familiaris
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ENSACIG00000001197	-	100	88.528	ENSCAFG00000014497	-	100	88.528	Canis_familiaris
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ENSACIG00000001197	-	100	89.610	ENSCAFG00020024258	-	100	89.610	Canis_lupus_dingo
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ENSACIG00000001197	-	100	74.242	ENSMNEG00000030982	-	100	74.242	Macaca_nemestrina
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