EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001369 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7644 bases
Position: chrCCOE01000522.1:27440-35083
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001663	zf-C2H2	PF00096.26	5e-34	1	6
ENSACIP00000001663	zf-C2H2	PF00096.26	5e-34	2	6
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ENSACIP00000001663	zf-C2H2	PF00096.26	5e-34	6	6
ENSACIP00000001663	zf-met	PF12874.7	7.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001732	-	912	-	ENSACIP00000001663	303 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001369	-	78	42.857	ENSACIG00000010660	-	92	42.857
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ENSACIG00000001369	-	80	42.286	ENSACIG00000023162	-	57	42.286
ENSACIG00000001369	-	82	37.600	ENSACIG00000007882	-	78	38.849
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ENSACIG00000001369	-	78	74.257	ENSACIG00000008886	znf1164	82	74.257
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ENSACIG00000001369	-	83	35.443	ENSACIG00000001767	zbtb41	62	35.443
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ENSACIG00000001369	-	78	31.333	ENSACIG00000009443	-	56	31.333
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ENSACIG00000001369	-	87	37.220	ENSACIG00000006806	-	58	39.785
ENSACIG00000001369	-	86	38.136	ENSACIG00000013470	-	60	38.462
ENSACIG00000001369	-	81	44.118	ENSACIG00000019447	-	68	40.764
ENSACIG00000001369	-	84	37.853	ENSACIG00000004626	-	80	38.115
ENSACIG00000001369	-	82	43.103	ENSACIG00000015429	-	81	43.103
ENSACIG00000001369	-	86	42.202	ENSACIG00000023313	-	90	42.202
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ENSACIG00000001369	-	88	38.189	ENSACIG00000023212	-	77	38.298
ENSACIG00000001369	-	95	43.697	ENSACIG00000004745	-	91	43.697
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ENSACIG00000001369	-	96	40.529	ENSACIG00000003556	-	68	40.254
ENSACIG00000001369	-	89	41.361	ENSACIG00000016182	-	90	41.361
ENSACIG00000001369	-	83	41.096	ENSACIG00000019534	-	89	41.096
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ENSACIG00000001369	-	97	41.767	ENSACIG00000013604	-	97	41.296
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ENSACIG00000001369	-	79	35.659	ENSACIG00000018641	snai2	53	35.659
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ENSACIG00000001369	-	81	41.290	ENSACIG00000019710	-	71	41.290
ENSACIG00000001369	-	81	39.831	ENSACIG00000016117	-	86	39.831
ENSACIG00000001369	-	83	39.286	ENSACIG00000014282	znf526	86	33.051
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ENSACIG00000001369	-	85	42.308	ENSACIG00000019791	-	92	42.938
ENSACIG00000001369	-	97	39.683	ENSACIG00000017050	-	97	42.727
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ENSACIG00000001369	-	84	41.453	ENSACIG00000004041	-	92	41.880
ENSACIG00000001369	-	95	39.416	ENSACIG00000012263	znf319b	88	34.855
ENSACIG00000001369	-	78	38.559	ENSACIG00000011515	-	64	42.056
ENSACIG00000001369	-	83	31.278	ENSACIG00000011516	-	80	31.278
ENSACIG00000001369	-	83	40.000	ENSACIG00000013750	-	80	40.000

Orthologs

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ENSACIG00000001369	-	84	40.408	ENSAPOG00000021383	-	64	40.408	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	82	39.726	ENSAPOG00000005195	-	63	38.983	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	85	47.826	ENSAPOG00000013982	-	66	47.826	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	78	33.594	ENSAPOG00000010200	-	55	33.594	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	83	40.541	ENSAPOG00000021959	-	55	40.541	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	82	36.576	ENSAPOG00000019061	-	74	36.576	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001369	-	83	40.367	ENSAOCG00000017602	-	68	40.367	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	83	35.686	ENSAOCG00000016905	-	78	35.686	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	79	40.271	ENSAOCG00000002430	-	73	40.271	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	83	40.851	ENSAOCG00000017595	-	61	40.851	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	84	38.819	ENSAOCG00000010471	-	67	38.819	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	81	40.000	ENSAOCG00000007134	-	76	35.227	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	83	39.184	ENSAOCG00000002795	-	65	39.184	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	83	36.017	ENSAOCG00000012813	-	72	39.474	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001369	-	82	40.851	ENSAPEG00000012443	-	61	40.851	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	83	40.367	ENSAPEG00000012470	-	68	40.367	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	84	37.398	ENSAPEG00000013097	-	75	37.398	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	83	35.909	ENSAPEG00000001546	-	88	35.909	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	79	40.271	ENSAPEG00000013044	-	56	40.271	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	82	38.342	ENSAPEG00000019106	-	51	38.144	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	84	43.151	ENSAPEG00000015337	-	96	43.023	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001369	-	83	38.860	ENSATEG00000013871	-	54	38.660	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001369	-	89	32.567	ENSATEG00000019378	-	61	32.567	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001369	-	83	36.723	ENSATEG00000008674	-	50	36.723	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001369	-	82	38.144	ENSACLG00000000102	-	56	38.144	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001369	-	85	35.616	ENSACLG00000017487	-	64	35.616	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001369	-	96	34.228	ENSACLG00000020231	-	93	36.134	Astatotilapia_calliptera
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