EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001465 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5294 bases
Position: chrCCOE01002313.1:9459-14752
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001777	MMR_HSR1	PF01926.23	4.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000001853	-	474	-	ENSACIP00000001777	157 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001465	-	76	60.000	ENSACIG00000008001	-	54	60.000
ENSACIG00000001465	-	76	43.519	ENSACIG00000005573	-	51	43.519
ENSACIG00000001465	-	93	39.490	ENSACIG00000000631	-	55	39.490
ENSACIG00000001465	-	74	43.089	ENSACIG00000020244	-	52	43.089
ENSACIG00000001465	-	80	88.095	ENSACIG00000001596	-	51	88.095
ENSACIG00000001465	-	76	46.774	ENSACIG00000000976	-	62	46.774
ENSACIG00000001465	-	78	40.310	ENSACIG00000014690	-	50	40.310
ENSACIG00000001465	-	93	51.613	ENSACIG00000001455	-	55	51.613
ENSACIG00000001465	-	75	39.837	ENSACIG00000014716	-	50	39.837
ENSACIG00000001465	-	88	47.552	ENSACIG00000012761	-	60	47.552
ENSACIG00000001465	-	84	45.000	ENSACIG00000012718	-	57	45.000
ENSACIG00000001465	-	76	46.774	ENSACIG00000000893	-	50	46.774
ENSACIG00000001465	-	82	37.594	ENSACIG00000014745	-	60	37.594
ENSACIG00000001465	-	76	57.258	ENSACIG00000008666	-	60	57.258
ENSACIG00000001465	-	76	32.593	ENSACIG00000014730	zgc:172131	68	32.593
ENSACIG00000001465	-	82	49.624	ENSACIG00000016635	-	50	49.624
ENSACIG00000001465	-	94	37.500	ENSACIG00000016502	-	69	37.500
ENSACIG00000001465	-	94	49.689	ENSACIG00000001070	-	58	49.689
ENSACIG00000001465	-	85	45.652	ENSACIG00000005223	-	51	45.652
ENSACIG00000001465	-	78	42.748	ENSACIG00000014680	-	57	42.748
ENSACIG00000001465	-	86	36.429	ENSACIG00000014655	-	51	36.429
ENSACIG00000001465	-	89	51.034	ENSACIG00000023381	-	55	51.724
ENSACIG00000001465	-	81	45.455	ENSACIG00000012204	-	55	45.455
ENSACIG00000001465	-	96	38.415	ENSACIG00000019524	-	69	38.415
ENSACIG00000001465	-	75	43.089	ENSACIG00000014662	-	50	43.089
ENSACIG00000001465	-	75	46.341	ENSACIG00000022374	-	63	46.341
ENSACIG00000001465	-	95	42.236	ENSACIG00000015088	-	65	42.236
ENSACIG00000001465	-	87	37.762	ENSACIG00000014703	-	57	37.762
ENSACIG00000001465	-	84	45.714	ENSACIG00000012707	-	52	45.714
ENSACIG00000001465	-	98	47.904	ENSACIG00000007494	-	53	50.932

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001465	-	73	42.149	ENSAPOG00000014243	-	50	42.149	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001465	-	87	37.671	ENSAPOG00000007361	-	82	37.671	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001465	-	77	50.794	ENSAPOG00000001262	-	61	50.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001465	-	68	40.351	ENSAOCG00000011143	-	67	40.351	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001465	-	62	40.952	ENSAOCG00000012536	-	81	40.952	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001465	-	87	38.462	ENSAOCG00000012651	-	60	38.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001465	-	76	48.000	ENSAPEG00000012179	-	55	40.625	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001465	-	98	33.714	ENSAPEG00000000770	-	52	33.714	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001465	-	74	41.463	ENSAPEG00000013651	-	52	41.463	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001465	-	66	40.541	ENSAPEG00000003102	-	57	40.541	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001465	-	69	42.241	ENSAPEG00000018782	-	77	42.241	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001465	-	76	56.250	ENSATEG00000014028	-	58	56.250	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001465	-	76	45.161	ENSATEG00000020391	-	51	45.161	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001465	-	76	42.742	ENSACLG00000011599	-	51	42.742	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	80	59.091	ENSACLG00000008592	-	50	59.091	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	78	55.118	ENSACLG00000003287	-	65	55.906	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	76	45.161	ENSACLG00000023600	-	52	45.161	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	57	40.625	ENSACLG00000005151	-	86	40.625	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	89	35.862	ENSACLG00000003276	-	54	35.862	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	80	57.031	ENSACLG00000017459	-	58	56.693	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	78	46.094	ENSACLG00000023747	-	54	46.094	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	72	52.101	ENSACLG00000021980	-	87	52.101	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	94	51.250	ENSACLG00000026926	-	54	51.250	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	82	41.791	ENSACLG00000023502	-	54	42.969	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	76	44.355	ENSACLG00000023760	-	52	44.355	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	94	37.805	ENSACLG00000023766	zgc:113625	67	37.805	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	93	36.709	ENSACLG00000023555	-	67	36.709	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	81	42.424	ENSACLG00000011572	-	55	42.424	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	76	43.548	ENSACLG00000011578	-	52	43.548	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	83	53.383	ENSACLG00000008397	-	52	53.383	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	74	55.372	ENSACLG00000003401	-	50	55.372	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	76	56.452	ENSACLG00000010048	-	50	56.452	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001465	-	76	36.000	ENSAMXG00000041240	-	52	36.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	81	43.182	ENSAMXG00000041148	-	51	43.182	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	82	36.923	ENSAMXG00000031086	-	62	36.923	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	68	43.243	ENSAMXG00000042243	-	54	43.243	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	82	40.496	ENSAMXG00000035621	-	56	40.496	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	44.355	ENSAMXG00000035878	-	52	44.355	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	83	42.963	ENSAMXG00000021622	-	56	42.963	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	48.000	ENSAMXG00000002402	-	52	48.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	74	45.455	ENSAMXG00000033886	-	53	45.455	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	77	48.413	ENSAMXG00000037339	-	88	48.413	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	68	46.429	ENSAMXG00000037755	-	58	46.429	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	75	45.968	ENSAMXG00000041888	-	60	45.968	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	75	40.650	ENSAMXG00000033160	-	55	40.650	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	37.097	ENSAMXG00000036272	-	60	35.246	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	45.161	ENSAMXG00000032368	-	53	43.089	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	80	50.806	ENSAMXG00000002562	-	86	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	77	46.774	ENSAMXG00000038457	-	58	46.774	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	75	43.089	ENSAMXG00000026503	-	53	43.089	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	84	43.796	ENSAMXG00000006341	-	52	43.796	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	40.945	ENSAMXG00000037647	-	53	40.945	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	70	48.276	ENSAMXG00000029911	-	73	48.276	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	84	45.588	ENSAMXG00000038070	-	67	45.775	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	84	37.681	ENSAMXG00000043776	-	50	37.681	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	75	42.520	ENSAMXG00000040298	-	51	42.520	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	74	45.455	ENSAMXG00000038335	-	54	45.455	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001465	-	76	49.194	ENSAMXG00000038694	-	83	49.194	Astyanax_mexicanus
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ENSACIG00000001465	-	68	48.673	ENSCVAG00000017220	-	68	48.673	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001465	-	80	56.098	ENSCVAG00000018802	-	54	56.098	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001465	-	74	46.774	ENSCVAG00000009808	-	54	46.774	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001465	-	93	47.403	ENSCVAG00000023434	-	55	47.403	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001465	-	80	50.382	ENSCVAG00000021672	-	65	50.382	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001465	-	74	48.361	ENSCVAG00000004346	-	52	48.361	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000001465	-	76	50.806	ENSELUG00000015016	-	55	50.806	Esox_lucius
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ENSACIG00000001465	-	76	48.800	ENSFHEG00000009740	-	63	48.800	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001465	-	77	44.444	ENSFHEG00000009496	-	60	44.444	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001465	-	94	58.065	ENSFHEG00000017393	-	60	58.871	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001465	-	77	48.031	ENSFHEG00000009715	-	56	48.031	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001465	-	74	37.398	ENSGMOG00000001269	-	60	37.398	Gadus_morhua
ENSACIG00000001465	-	82	35.821	ENSGAFG00000018273	-	70	35.821	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	75	43.902	ENSGAFG00000008951	-	50	43.902	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	62	51.961	ENSGAFG00000000209	-	58	51.961	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	79	43.704	ENSGAFG00000002926	-	52	43.704	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	55	49.451	ENSGAFG00000003916	-	77	49.451	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	76	47.244	ENSGAFG00000018264	-	51	47.244	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001465	-	75	39.024	ENSGACG00000018283	zgc:113625	57	39.024	Gasterosteus_aculeatus
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