EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001596 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 741 bases
Position: chrCCOE01002332.1:12434-13174
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000001951	MMR_HSR1	PF01926.23	5.2e-09	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000002028	-	741	-	ENSACIP00000001951	246 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001596	-	76	40.104	ENSACIG00000020234	-	67	40.104
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ENSACIG00000001596	-	74	42.021	ENSACIG00000014662	-	76	42.021
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ENSACIG00000001596	-	62	47.500	ENSACIG00000012761	-	70	47.500
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ENSACIG00000001596	-	63	47.205	ENSACIG00000000631	-	56	47.205
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ENSACIG00000001596	-	77	48.223	ENSACIG00000012648	-	65	48.223
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ENSACIG00000001596	-	85	55.093	ENSACIG00000001455	-	79	55.093
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ENSACIG00000001596	-	84	56.808	ENSACIG00000002263	-	77	57.277
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ENSACIG00000001596	-	78	59.184	ENSACIG00000003582	-	62	58.883
ENSACIG00000001596	-	80	47.573	ENSACIG00000022355	-	68	47.783

Orthologs

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ENSACIG00000001596	-	86	45.370	ENSAPOG00000006169	-	59	45.370	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	74	46.237	ENSAPOG00000014759	-	62	46.237	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	73	49.457	ENSAPOG00000001262	-	88	49.457	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	72	55.738	ENSAPOG00000012716	-	64	54.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	74	47.059	ENSAPOG00000011509	-	64	47.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	72	41.530	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	65	41.530	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	77	43.878	ENSAPOG00000007333	-	57	43.878	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	70	40.223	ENSAPOG00000014243	-	74	40.223	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000001596	-	76	57.068	ENSAPOG00000008063	-	62	57.068	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	52	39.552	ENSAPOG00000007361	-	76	39.552	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	74	41.270	ENSAPOG00000001315	-	58	41.270	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	85	40.183	ENSAPOG00000001268	-	54	40.183	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	76	53.368	ENSAPOG00000021159	-	63	54.404	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	76	48.168	ENSAPOG00000006488	-	74	48.168	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	77	42.857	ENSAPOG00000022240	-	56	42.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001596	-	75	47.917	ENSAPOG00000007322	-	66	47.917	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000001596	-	77	43.878	ENSAOCG00000011155	-	57	43.878	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000001596	-	77	48.969	ENSAOCG00000008525	-	56	48.969	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001596	-	76	49.738	ENSAOCG00000008522	-	63	49.738	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001596	-	71	51.397	ENSAOCG00000014702	-	59	51.397	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001596	-	75	38.342	ENSAOCG00000012651	-	80	38.342	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001596	-	73	47.826	ENSAOCG00000001993	-	71	47.826	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001596	-	80	45.146	ENSAOCG00000011167	-	68	45.146	Amphiprion_ocellaris
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