EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001860 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7777 bases
Position: chrCCOE01000286.1:814843-822619
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002330	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-22	1	4
ENSACIP00000002330	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-22	2	4
ENSACIP00000002330	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-22	3	4
ENSACIP00000002330	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-22	4	4
ENSACIP00000002305	zf-C2H2	PF00096.26	5.5e-13	1	1
ENSACIP00000002330	zf-met	PF12874.7	1.1e-07	1	2
ENSACIP00000002330	zf-met	PF12874.7	1.1e-07	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002418	-	1035	-	ENSACIP00000002330	344 (aa)	-	-
ENSACIT00000002392	-	831	-	ENSACIP00000002305	276 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001860	-	63	38.961	ENSACIG00000000286	-	76	34.978
ENSACIG00000001860	-	69	30.196	ENSACIG00000006755	-	90	30.196
ENSACIG00000001860	-	50	48.352	ENSACIG00000004041	-	96	48.352
ENSACIG00000001860	-	76	41.975	ENSACIG00000008611	-	93	30.503
ENSACIG00000001860	-	53	46.154	ENSACIG00000007000	-	73	33.645
ENSACIG00000001860	-	67	44.860	ENSACIG00000017050	-	97	49.462
ENSACIG00000001860	-	94	35.294	ENSACIG00000015835	-	99	35.294
ENSACIG00000001860	-	52	38.194	ENSACIG00000020938	zbtb47b	68	41.935
ENSACIG00000001860	-	59	51.613	ENSACIG00000022738	-	90	48.980
ENSACIG00000001860	-	59	45.055	ENSACIG00000004626	-	85	45.055
ENSACIG00000001860	-	52	41.667	ENSACIG00000018952	-	56	41.667
ENSACIG00000001860	-	58	40.625	ENSACIG00000006806	-	68	43.011
ENSACIG00000001860	-	82	48.810	ENSACIG00000019102	-	59	48.810
ENSACIG00000001860	-	94	45.977	ENSACIG00000022645	-	96	45.977
ENSACIG00000001860	-	50	37.895	ENSACIG00000019534	-	82	37.895
ENSACIG00000001860	-	76	50.000	ENSACIG00000010647	-	96	50.000
ENSACIG00000001860	-	54	45.000	ENSACIG00000011515	-	74	45.000
ENSACIG00000001860	-	55	50.000	ENSACIG00000013604	-	92	50.000
ENSACIG00000001860	-	51	40.594	ENSACIG00000015411	-	87	40.594
ENSACIG00000001860	-	53	44.792	ENSACIG00000009780	-	84	44.792
ENSACIG00000001860	-	59	46.429	ENSACIG00000023162	-	69	46.429
ENSACIG00000001860	-	69	40.541	ENSACIG00000019447	-	95	40.541
ENSACIG00000001860	-	57	40.000	ENSACIG00000019815	-	85	46.739
ENSACIG00000001860	-	69	50.549	ENSACIG00000006172	-	98	50.549
ENSACIG00000001860	-	70	39.130	ENSACIG00000023049	znf646	95	35.246
ENSACIG00000001860	-	94	47.222	ENSACIG00000004641	-	90	47.222
ENSACIG00000001860	-	63	44.086	ENSACIG00000003515	-	93	37.143
ENSACIG00000001860	-	86	47.312	ENSACIG00000011541	-	96	47.312
ENSACIG00000001860	-	50	43.750	ENSACIG00000003720	-	74	43.750
ENSACIG00000001860	-	67	45.161	ENSACIG00000013750	-	73	45.161
ENSACIG00000001860	-	68	31.858	ENSACIG00000018404	-	78	38.532
ENSACIG00000001860	-	55	40.000	ENSACIG00000013149	-	80	40.000
ENSACIG00000001860	-	52	42.857	ENSACIG00000009755	-	78	42.857
ENSACIG00000001860	-	57	46.552	ENSACIG00000007096	-	93	46.552
ENSACIG00000001860	-	67	43.182	ENSACIG00000000406	prdm5	71	43.182
ENSACIG00000001860	-	55	44.086	ENSACIG00000016944	-	84	44.086
ENSACIG00000001860	-	87	45.783	ENSACIG00000017013	-	81	45.783
ENSACIG00000001860	-	55	31.928	ENSACIG00000016133	-	68	31.928
ENSACIG00000001860	-	70	30.769	ENSACIG00000001296	-	58	30.769
ENSACIG00000001860	-	74	34.191	ENSACIG00000023794	-	75	35.152
ENSACIG00000001860	-	89	36.598	ENSACIG00000004666	-	99	47.778
ENSACIG00000001860	-	65	45.361	ENSACIG00000000311	-	84	45.361
ENSACIG00000001860	-	62	44.086	ENSACIG00000024444	-	70	44.086
ENSACIG00000001860	-	95	35.294	ENSACIG00000023313	-	96	35.664
ENSACIG00000001860	-	53	43.972	ENSACIG00000004745	-	87	43.972
ENSACIG00000001860	-	85	46.237	ENSACIG00000023212	-	93	46.237
ENSACIG00000001860	-	76	39.264	ENSACIG00000013470	-	94	49.505
ENSACIG00000001860	-	53	42.500	ENSACIG00000016182	-	81	47.664
ENSACIG00000001860	-	66	42.308	ENSACIG00000014123	znf236	55	42.308
ENSACIG00000001860	-	51	41.584	ENSACIG00000012263	znf319b	67	41.584
ENSACIG00000001860	-	82	49.462	ENSACIG00000017647	-	96	48.052
ENSACIG00000001860	-	51	48.387	ENSACIG00000022658	-	87	48.387
ENSACIG00000001860	-	69	31.818	ENSACIG00000013613	scrt1b	84	31.818
ENSACIG00000001860	-	57	37.097	ENSACIG00000009128	-	98	37.097
ENSACIG00000001860	-	54	41.176	ENSACIG00000015429	-	79	47.297
ENSACIG00000001860	-	61	41.441	ENSACIG00000007882	-	86	41.441
ENSACIG00000001860	-	56	48.913	ENSACIG00000011153	-	80	48.913
ENSACIG00000001860	-	71	44.086	ENSACIG00000009717	-	97	44.086
ENSACIG00000001860	-	58	50.526	ENSACIG00000019710	-	80	50.526
ENSACIG00000001860	-	61	42.857	ENSACIG00000023513	znf384l	50	42.857
ENSACIG00000001860	-	58	40.217	ENSACIG00000022625	-	86	43.434
ENSACIG00000001860	-	54	50.962	ENSACIG00000019791	-	92	48.624

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001860	-	53	40.777	ENSAPOG00000011470	-	71	40.777	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001860	-	59	47.500	ENSAPOG00000022174	-	90	48.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001860	-	62	46.154	ENSAPOG00000021980	-	97	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001860	-	81	42.857	ENSAPOG00000005259	-	89	45.161	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001860	-	77	38.393	ENSAPOG00000016137	-	59	38.393	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001860	-	54	47.183	ENSAOCG00000013978	-	90	45.161	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001860	-	80	42.857	ENSAOCG00000007388	-	72	39.806	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001860	-	54	45.070	ENSAPEG00000012217	-	71	46.154	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001860	-	50	38.462	ENSAPEG00000013048	-	73	38.462	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001860	-	68	51.613	ENSAPEG00000013550	-	98	54.839	Amphiprion_percula
ENSACIG00000001860	-	54	46.512	ENSACLG00000021022	-	68	51.111	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001860	-	51	37.624	ENSAMXG00000029059	-	78	38.542	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000001860	-	80	35.461	ENSCING00000004863	zf(c2h2)-93	95	35.461	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000001860	-	54	39.130	ENSCSAVG00000006745	-	85	34.752	Ciona_savignyi
ENSACIG00000001860	-	87	46.237	ENSCSAVG00000006608	-	99	56.818	Ciona_savignyi
ENSACIG00000001860	-	59	43.617	ENSCSAVG00000006650	-	99	43.617	Ciona_savignyi
ENSACIG00000001860	-	50	38.739	ENSCVAG00000002506	-	97	47.368	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001860	-	54	46.535	ENSCVAG00000002500	-	90	46.535	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001860	-	53	43.333	ENSCVAG00000015159	-	52	43.333	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001860	-	63	36.842	ENSCVAG00000013048	-	62	33.548	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001860	-	60	35.115	ENSCVAG00000018485	-	98	34.307	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001860	-	60	38.000	FBgn0020309	crol	60	40.288	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000001860	-	66	38.532	FBgn0037120	CG11247	79	38.532	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000001860	-	52	39.744	ENSEBUG00000006811	-	81	39.744	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001860	-	50	40.602	ENSEBUG00000009220	-	83	40.602	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001860	-	64	45.652	ENSEBUG00000006233	-	73	45.556	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001860	-	51	46.067	ENSEBUG00000015456	-	94	46.067	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001860	-	60	47.312	ENSFHEG00000003405	-	76	47.312	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	58	55.263	ENSFHEG00000021003	-	81	52.632	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	51	45.161	ENSFHEG00000017885	-	93	42.373	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	90	39.865	ENSFHEG00000005983	-	87	42.574	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	52	50.000	ENSFHEG00000019704	-	99	50.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	57	46.237	ENSFHEG00000017989	-	81	46.237	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	53	41.958	ENSFHEG00000013803	-	73	41.958	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	65	42.424	ENSFHEG00000013486	-	87	42.424	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	81	41.844	ENSFHEG00000013302	-	95	41.844	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	82	47.423	ENSFHEG00000007396	-	95	47.423	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	54	44.444	ENSFHEG00000015571	-	76	44.444	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	66	40.860	ENSFHEG00000013792	-	92	43.158	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	50	47.475	ENSFHEG00000005993	-	79	47.475	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	60	46.226	ENSFHEG00000016540	-	82	46.226	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	58	36.813	ENSFHEG00000013625	-	82	36.813	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001860	-	56	42.708	ENSGAFG00000014188	-	99	42.373	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	52	46.237	ENSGAFG00000011278	-	65	46.237	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	71	43.564	ENSGAFG00000011999	-	92	43.564	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	68	39.560	ENSGAFG00000012083	-	75	39.560	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	52	37.903	ENSGAFG00000003119	-	64	37.600	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	87	39.103	ENSGAFG00000000521	-	80	39.103	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	71	44.792	ENSGAFG00000012733	-	72	44.792	Gambusia_affinis
ENSACIG00000001860	-	53	40.496	ENSHCOG00000008601	-	78	47.727	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001860	-	62	47.312	ENSHCOG00000020972	-	99	47.312	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001860	-	50	42.029	ENSHCOG00000015438	-	58	42.029	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001860	-	67	46.809	ENSKMAG00000008316	-	86	46.809	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000001860	-	55	43.269	ENSKMAG00000020025	-	90	43.269	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000001860	-	64	41.111	ENSKMAG00000006563	-	99	45.370	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000001860	-	50	37.600	ENSKMAG00000020339	-	76	42.391	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000001860	-	60	45.161	ENSLACG00000017381	-	74	41.958	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000001860	-	63	38.636	ENSLOCG00000016466	-	97	38.636	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000001860	-	56	43.678	ENSMALG00000009834	-	86	39.437	Monopterus_albus
ENSACIG00000001860	-	94	42.593	ENSNBRG00000006757	-	95	42.593	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000001860	-	58	48.387	ENSONIG00000018058	-	99	48.387	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000001860	-	56	42.857	ENSONIG00000019044	-	99	46.479	Oreochromis_niloticus
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