EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000001933 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cpeb3
Alias: si:ch211-129m12.2
Full Name: cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35189 bases
Position: chrCCOE01000440.1:586389-621577
Accession: ZDB-GENE-090312-68
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002396	RRM_1	PF00076.22	9.1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002486	-	2034	-	ENSACIP00000002396	677 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000001933	cpeb3	67	71.711	ENSACIG00000000739	CPEB4	82	59.488
ENSACIG00000001933	cpeb3	84	62.270	ENSACIG00000000358	cpeb2	70	62.104
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	53.537	ENSACIG00000016815	cpeb4a	83	55.472

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	71.646	ENSG00000107864	CPEB3	100	72.361	Homo_sapiens
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.198	ENSAPOG00000003625	cpeb3	100	97.198	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.032	ENSAMEG00000014204	CPEB3	100	73.593	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.194	ENSAOCG00000015423	cpeb3	100	97.194	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	94.256	ENSATEG00000010649	cpeb3	100	94.256	Anabas_testudineus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.195	ENSACAG00000006335	CPEB3	100	80.466	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.377	ENSANAG00000037406	CPEB3	100	74.515	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.341	ENSACLG00000018590	cpeb3	89	97.341	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	72.905	ENSBTAG00000015450	CPEB3	92	95.270	Bos_taurus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.722	ENSCJAG00000008495	CPEB3	100	75.104	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	70.914	ENSCAFG00000007423	CPEB3	100	71.548	Canis_familiaris
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.204	ENSCAFG00020001981	CPEB3	89	95.270	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.826	ENSCHIG00000017337	CPEB3	100	74.687	Capra_hircus
ENSACIG00000001933	cpeb3	85	85.681	ENSTSYG00000003928	CPEB3	82	85.681	Carlito_syrichta
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.967	ENSCCAG00000033267	CPEB3	100	74.654	Cebus_capucinus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.793	ENSCATG00000038447	CPEB3	100	74.033	Cercocebus_atys
ENSACIG00000001933	cpeb3	70	86.192	ENSCLAG00000011817	CPEB3	95	86.192	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	70.914	ENSCSAG00000006579	CPEB3	100	71.290	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000001933	cpeb3	56	77.632	ENSCHOG00000000272	-	100	77.632	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.778	ENSCPBG00000023779	CPEB3	100	80.938	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.691	ENSCANG00000040306	CPEB3	100	74.792	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.722	ENSCGRG00001003846	Cpeb3	100	74.548	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000001933	cpeb3	62	87.234	ENSCGRG00000002839	Cpeb3	100	87.234	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000001933	cpeb3	90	83.025	ENSCSEG00000008423	cpeb3	100	83.025	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	87.021	ENSCVAG00000005998	cpeb3	100	86.136	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	71.848	ENSDARG00000060103	cpeb3	100	70.821	Danio_rerio
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	68.923	ENSDNOG00000048639	CPEB3	100	68.846	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000001933	cpeb3	92	88.285	ENSDORG00000028940	Cpeb3	87	88.285	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	68.333	ENSETEG00000000111	CPEB3	100	68.112	Echinops_telfairi
ENSACIG00000001933	cpeb3	99	60.218	ENSEBUG00000010745	cpeb3	90	59.836	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.207	ENSEASG00005011095	CPEB3	100	74.861	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.309	ENSECAG00000000077	CPEB3	100	74.965	Equus_caballus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	86.009	ENSELUG00000019251	cpeb3	100	85.125	Esox_lucius
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.274	ENSFCAG00000032380	CPEB3	100	74.930	Felis_catus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	79.442	ENSFALG00000007952	CPEB3	87	79.589	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000001933	cpeb3	85	89.607	ENSFDAG00000016459	CPEB3	84	89.607	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	88.726	ENSFHEG00000021371	cpeb3	100	87.555	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000001933	cpeb3	89	86.093	ENSGMOG00000008307	cpeb3	99	85.099	Gadus_morhua
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.406	ENSGALG00000006912	CPEB3	100	81.552	Gallus_gallus
ENSACIG00000001933	cpeb3	99	92.047	ENSGACG00000002944	cpeb3	99	91.605	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.871	ENSGAGG00000008528	CPEB3	100	80.499	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.895	ENSGGOG00000016441	CPEB3	100	74.861	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.489	ENSHBUG00000004097	cpeb3	93	97.489	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.214	ENSHGLG00000014022	CPEB3	100	73.757	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.115	ENSHGLG00100005200	CPEB3	100	72.714	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	84.218	ENSHCOG00000005747	cpeb3	100	84.683	Hippocampus_comes
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	82.258	ENSIPUG00000018571	cpeb3	100	82.310	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.965	ENSSTOG00000028061	CPEB3	100	75.565	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	62	87.470	ENSJJAG00000009135	Cpeb3	100	87.470	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	94.428	ENSLBEG00000025961	cpeb3	100	94.282	Labrus_bergylta
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	77.566	ENSLACG00000011307	CPEB3	92	77.172	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	84.627	ENSLOCG00000007131	cpeb3	100	82.353	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	76.479	ENSLAFG00000018716	CPEB3	100	81.423	Loxodonta_africana
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	71.674	ENSMFAG00000025613	CPEB3	100	71.817	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.448	ENSMMUG00000015050	CPEB3	100	75.104	Macaca_mulatta
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.691	ENSMNEG00000045465	CPEB3	100	73.931	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000001933	cpeb3	90	85.681	ENSMLEG00000031794	CPEB3	97	85.681	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	96.058	ENSMAMG00000012794	cpeb3	100	94.453	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.489	ENSMZEG00005012068	cpeb3	100	97.489	Maylandia_zebra
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	79.589	ENSMGAG00000009148	CPEB3	99	79.736	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.074	ENSMAUG00000002789	Cpeb3	100	74.033	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.306	ENSMICG00000026866	CPEB3	100	74.162	Microcebus_murinus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.415	ENSMOCG00000016486	Cpeb3	100	74.377	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000001933	cpeb3	97	89.818	ENSMMOG00000008209	cpeb3	88	89.818	Mola_mola
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	93.944	ENSMALG00000009305	cpeb3	95	99.666	Monopterus_albus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.211	MGP_CAROLIEiJ_G0022910	Cpeb3	100	87.470	Mus_caroli
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.619	ENSMUSG00000039652	Cpeb3	100	87.470	Mus_musculus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.171	MGP_PahariEiJ_G0014405	Cpeb3	100	87.470	Mus_pahari
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.176	MGP_SPRETEiJ_G0023829	Cpeb3	100	87.470	Mus_spretus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	72.161	ENSMPUG00000017227	CPEB3	100	72.803	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.860	ENSNGAG00000015621	Cpeb3	100	75.000	Nannospalax_galili
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	92.467	ENSNBRG00000018343	cpeb3	91	92.171	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.238	ENSNLEG00000012600	CPEB3	100	74.896	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000001933	cpeb3	77	82.105	ENSMEUG00000009948	-	75	82.105	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	72.456	ENSODEG00000004591	CPEB3	100	72.442	Octodon_degus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.064	ENSOCUG00000010454	CPEB3	100	74.198	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	80.798	ENSORLG00000000726	cpeb3	100	82.275	Oryzias_latipes
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.536	ENSORLG00020004475	cpeb3	100	83.752	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	83.604	ENSORLG00015011683	cpeb3	100	85.672	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	81.979	ENSOMEG00000018265	cpeb3	93	82.422	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	70.678	ENSOGAG00000002002	CPEB3	100	70.376	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	71.648	ENSOARG00000016671	CPEB3	100	71.508	Ovis_aries
ENSACIG00000001933	cpeb3	70	84.728	ENSPPAG00000031528	CPEB3	99	79.008	Pan_paniscus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	71.012	ENSPPRG00000015654	CPEB3	100	71.648	Panthera_pardus
ENSACIG00000001933	cpeb3	67	85.746	ENSPTIG00000012018	CPEB3	97	95.172	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.895	ENSPTRG00000002753	CPEB3	100	74.619	Pan_troglodytes
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	72.261	ENSPANG00000021561	CPEB3	100	72.346	Papio_anubis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	88.971	ENSPKIG00000015878	cpeb3	98	87.647	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.060	ENSPMGG00000022722	cpeb3	100	73.167	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.415	ENSPEMG00000008448	Cpeb3	100	74.377	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.321	ENSPCIG00000017302	CPEB3	100	73.505	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	82.500	ENSPFOG00000011231	cpeb3	100	83.971	Poecilia_formosa
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	89.766	ENSPLAG00000002852	cpeb3	100	89.912	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	90.058	ENSPMEG00000021572	cpeb3	100	90.497	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	90.789	ENSPREG00000003085	cpeb3	100	90.936	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	67.313	ENSPPYG00000002481	CPEB3	100	68.384	Pongo_abelii
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	67.442	ENSPCAG00000012417	CPEB3	100	67.813	Procavia_capensis
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	74.028	ENSPCOG00000023690	CPEB3	100	74.022	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000001933	cpeb3	82	86.316	ENSPVAG00000007664	CPEB3	74	86.316	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	97.489	ENSPNYG00000005300	cpeb3	100	97.489	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	84.985	ENSPNAG00000012111	cpeb3	100	83.965	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	70.811	ENSRNOG00000020689	Cpeb3	94	70.204	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.757	ENSRBIG00000041079	CPEB3	100	75.000	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000001933	cpeb3	100	73.757	ENSRROG00000031558	CPEB3	100	75.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000001933	cpeb3	67	82.456	ENSSBOG00000035843	CPEB3	100	82.456	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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