EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002080 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3870 bases
Position: chrCCOE01000098.1:58441-62310
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002977	TROVE	PF05731.11	2e-15	1	1
ENSACIP00000002877	TROVE	PF05731.11	1.1e-14	1	1
ENSACIP00000002614	TROVE	PF05731.11	1.4e-14	1	1
ENSACIP00000002644	TROVE	PF05731.11	2.7e-14	1	1
ENSACIP00000002829	TROVE	PF05731.11	8.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002927	-	1311	-	ENSACIP00000002829	436 (aa)	-	-
ENSACIT00000002975	-	1341	-	ENSACIP00000002877	446 (aa)	-	-
ENSACIT00000002739	-	1332	-	ENSACIP00000002644	443 (aa)	-	-
ENSACIT00000003077	-	1254	-	ENSACIP00000002977	417 (aa)	-	-
ENSACIT00000003106	-	468	-	ENSACIP00000003003	155 (aa)	-	-
ENSACIT00000002709	-	1332	-	ENSACIP00000002614	443 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002080	-	100	69.434	ENSACIG00000010149	trove2	100	69.434

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSG00000116747	RO60	100	39.002	Homo_sapiens
ENSACIG00000002080	-	100	61.183	ENSAPOG00000015903	trove2	100	61.183	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002080	-	100	38.447	ENSAMEG00000015881	TROVE2	100	38.447	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002080	-	100	61.738	ENSAOCG00000000143	trove2	100	61.738	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002080	-	100	61.922	ENSAPEG00000003310	trove2	100	61.922	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002080	-	98	60.189	ENSATEG00000021195	trove2	100	59.817	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002080	-	99	39.024	ENSAPLG00000003121	TROVE2	98	39.024	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002080	-	98	40.076	ENSACAG00000008263	TROVE2	98	40.076	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSANAG00000027305	TROVE2	100	39.002	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002080	-	91	74.510	ENSACLG00000012217	trove2	99	58.559	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002080	-	100	42.344	ENSAMXG00000002118	trove2	98	41.852	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002080	-	100	38.192	ENSBTAG00000013812	TROVE2	63	38.192	Bos_taurus
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSCJAG00000008566	TROVE2	100	38.817	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSCAFG00000010552	TROVE2	97	38.817	Canis_familiaris
ENSACIG00000002080	-	99	38.879	ENSCAFG00020004457	TROVE2	100	39.139	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002080	-	100	38.262	ENSCHIG00000018260	TROVE2	100	38.262	Capra_hircus
ENSACIG00000002080	-	100	38.632	ENSTSYG00000004227	TROVE2	100	38.632	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002080	-	100	37.014	ENSCAPG00000009733	TROVE2	100	37.014	Cavia_aperea
ENSACIG00000002080	-	100	39.114	ENSCPOG00000000669	TROVE2	100	39.114	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002080	-	100	36.133	ENSCCAG00000027978	TROVE2	100	36.133	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSCATG00000027732	TROVE2	100	39.002	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002080	-	100	38.930	ENSCLAG00000016391	TROVE2	100	38.930	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSCSAG00000013402	TROVE2	100	39.002	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002080	-	83	52.096	ENSCHOG00000009571	TROVE2	82	49.718	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000002080	-	99	38.848	ENSCPBG00000010558	TROVE2	99	38.848	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSCANG00000041293	TROVE2	100	38.817	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002080	-	100	38.007	ENSCGRG00001016925	Trove2	100	38.007	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002080	-	100	38.007	ENSCGRG00000003396	Trove2	100	38.007	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002080	-	100	54.059	ENSCSEG00000009989	trove2	100	54.059	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002080	-	91	66.000	ENSCVAG00000008160	trove2	100	56.089	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002080	-	95	43.787	ENSDARG00000089225	trove2	94	43.787	Danio_rerio
ENSACIG00000002080	-	100	37.638	ENSDNOG00000002157	TROVE2	100	37.638	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002080	-	100	38.447	ENSDORG00000006152	Trove2	100	38.447	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002080	-	60	36.957	ENSETEG00000018261	TROVE2	95	36.890	Echinops_telfairi
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSEASG00005003388	TROVE2	100	38.817	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSECAG00000018653	TROVE2	100	39.002	Equus_caballus
ENSACIG00000002080	-	100	37.454	ENSEEUG00000014190	TROVE2	100	37.454	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002080	-	100	49.353	ENSELUG00000004473	trove2	100	49.353	Esox_lucius
ENSACIG00000002080	-	100	39.187	ENSFCAG00000010161	TROVE2	100	39.187	Felis_catus
ENSACIG00000002080	-	99	39.695	ENSFALG00000002913	TROVE2	99	38.920	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002080	-	100	39.114	ENSFDAG00000015923	TROVE2	100	39.114	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002080	-	100	57.196	ENSFHEG00000016128	trove2	100	57.196	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002080	-	99	38.848	ENSGALG00000002504	TROVE2	99	38.848	Gallus_gallus
ENSACIG00000002080	-	100	56.296	ENSGAFG00000011806	trove2	100	56.296	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002080	-	98	40.152	ENSGAGG00000017742	TROVE2	99	38.662	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSGGOG00000034815	TROVE2	100	39.002	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002080	-	100	60.781	ENSHBUG00000014208	trove2	100	60.781	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002080	-	100	39.299	ENSHGLG00000003152	TROVE2	100	39.299	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002080	-	100	39.299	ENSHGLG00100010586	TROVE2	100	39.299	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002080	-	100	51.560	ENSHCOG00000004153	trove2	100	51.560	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002080	-	98	36.862	ENSIPUG00000011780	trove2	98	36.862	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002080	-	100	37.380	ENSSTOG00000012307	TROVE2	100	37.380	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002080	-	100	38.192	ENSJJAG00000019489	Trove2	100	38.192	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002080	-	100	58.410	ENSKMAG00000004951	trove2	100	58.410	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002080	-	100	59.524	ENSLBEG00000009672	trove2	100	59.524	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002080	-	92	48.627	ENSLACG00000007822	TROVE2	98	39.400	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002080	-	100	44.404	ENSLOCG00000007384	trove2	100	44.404	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002080	-	100	38.632	ENSLAFG00000014808	TROVE2	100	38.632	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSMFAG00000016020	TROVE2	100	39.002	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002080	-	97	38.563	ENSMMUG00000022643	TROVE2	99	38.596	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSMNEG00000039348	TROVE2	100	39.002	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSMLEG00000040042	TROVE2	100	39.002	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002080	-	98	56.955	ENSMAMG00000002004	trove2	100	57.064	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002080	-	91	76.471	ENSMZEG00005008107	trove2	82	76.471	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002080	-	97	39.612	ENSMGAG00000005429	TROVE2	96	40.232	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002080	-	100	38.376	ENSMAUG00000008125	Trove2	100	38.376	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSMICG00000011506	TROVE2	100	38.817	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002080	-	100	38.192	ENSMOCG00000021175	Trove2	100	38.192	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002080	-	100	57.248	ENSMMOG00000017049	trove2	100	57.248	Mola_mola
ENSACIG00000002080	-	100	39.556	ENSMODG00000012203	TROVE2	100	39.556	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002080	-	100	57.404	ENSMALG00000007367	trove2	100	57.404	Monopterus_albus
ENSACIG00000002080	-	100	38.561	MGP_CAROLIEiJ_G0014676	Trove2	100	38.561	Mus_caroli
ENSACIG00000002080	-	100	37.454	ENSMUSG00000018199	Trove2	100	37.454	Mus_musculus
ENSACIG00000002080	-	100	38.930	MGP_PahariEiJ_G0027912	Trove2	91	38.930	Mus_pahari
ENSACIG00000002080	-	100	38.007	MGP_SPRETEiJ_G0015483	Trove2	100	38.007	Mus_spretus
ENSACIG00000002080	-	100	38.447	ENSMPUG00000004631	TROVE2	100	38.447	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002080	-	99	38.993	ENSMLUG00000001442	TROVE2	99	39.171	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000002080	-	100	38.745	ENSNGAG00000015898	Trove2	100	38.745	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002080	-	100	60.967	ENSNBRG00000005311	trove2	99	60.967	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSNLEG00000018048	TROVE2	100	39.002	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002080	-	74	33.582	ENSOPRG00000017247	TROVE2	99	33.831	Ochotona_princeps
ENSACIG00000002080	-	100	38.930	ENSODEG00000010468	TROVE2	100	38.930	Octodon_degus
ENSACIG00000002080	-	91	74.510	ENSONIG00000018579	trove2	100	58.559	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002080	-	98	38.346	ENSOANG00000002961	TROVE2	98	38.346	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002080	-	99	38.148	ENSOCUG00000012814	TROVE2	99	38.148	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002080	-	100	51.206	ENSORLG00000010951	trove2	100	51.020	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002080	-	100	51.391	ENSORLG00020009759	trove2	100	51.206	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002080	-	100	50.464	ENSORLG00015004497	trove2	100	50.278	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002080	-	100	50.365	ENSOMEG00000010440	trove2	100	50.365	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002080	-	96	39.006	ENSOGAG00000032047	TROVE2	97	39.006	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002080	-	100	38.447	ENSOARG00000009462	TROVE2	96	38.447	Ovis_aries
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPPAG00000043846	TROVE2	100	39.002	Pan_paniscus
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPPRG00000017233	TROVE2	100	39.002	Panthera_pardus
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPTIG00000015535	TROVE2	100	39.002	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPTRG00000001794	TROVE2	100	39.002	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPANG00000000341	TROVE2	100	39.002	Papio_anubis
ENSACIG00000002080	-	97	43.654	ENSPKIG00000018217	trove2	99	43.048	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002080	-	99	38.476	ENSPSIG00000009877	TROVE2	99	38.476	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002080	-	100	37.638	ENSPEMG00000001419	Trove2	100	37.638	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000002080	-	99	39.179	ENSPCIG00000028632	TROVE2	99	39.065	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002080	-	91	78.000	ENSPFOG00000006974	trove2	100	56.215	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002080	-	91	78.000	ENSPLAG00000009027	trove2	100	56.481	Poecilia_latipinna
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ENSACIG00000002080	-	91	76.000	ENSPREG00000005674	trove2	100	56.296	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPPYG00000000397	TROVE2	100	39.002	Pongo_abelii
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSPCAG00000003959	TROVE2	100	39.002	Procavia_capensis
ENSACIG00000002080	-	100	38.447	ENSPCOG00000015951	-	100	38.447	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000002080	-	91	37.474	ENSPVAG00000001182	TROVE2	99	37.474	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000002080	-	91	76.471	ENSPNYG00000020148	trove2	82	76.471	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002080	-	98	42.750	ENSPNAG00000024223	trove2	97	42.750	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002080	-	100	38.376	ENSRNOG00000003434	Trove2	100	38.376	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSRBIG00000030073	TROVE2	100	39.002	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000002080	-	100	39.002	ENSRROG00000034428	TROVE2	100	39.002	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000002080	-	100	38.817	ENSSBOG00000024070	TROVE2	100	38.817	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000002080	-	99	39.552	ENSSHAG00000013205	TROVE2	99	39.439	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000002080	-	99	43.017	ENSSFOG00015011990	trove2	98	43.017	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002080	-	98	58.757	ENSSMAG00000009058	trove2	100	57.952	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002080	-	100	58.791	ENSSDUG00000009083	trove2	100	58.791	Seriola_dumerili
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ENSACIG00000002080	-	98	38.764	ENSSARG00000009347	TROVE2	99	38.764	Sorex_araneus
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ENSACIG00000002080	-	97	40.388	ENSTGUG00000004126	TROVE2	100	40.232	Taeniopygia_guttata
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ENSACIG00000002080	-	70	36.882	ENSTBEG00000006806	TROVE2	76	36.882	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000002080	-	98	38.951	ENSTTRG00000009291	TROVE2	99	38.951	Tursiops_truncatus
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ENSACIG00000002080	-	88	46.667	ENSVPAG00000010303	TROVE2	76	41.951	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002080	-	96	38.050	ENSVVUG00000013405	TROVE2	72	38.004	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002080	-	100	39.483	ENSXETG00000017224	trove2	100	39.483	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002080	-	99	55.969	ENSXCOG00000007527	trove2	99	55.969	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002080	-	100	55.493	ENSXMAG00000004825	trove2	100	55.493	Xiphophorus_maculatus