EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002101 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: trmu
Alias: zgc:110555
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3613 bases
Position: chrCCOE01000404.1:197694-201306
Accession: ZDB-GENE-050522-540
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002690	tRNA_Me_trans	PF03054.16	1.7e-135	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002787	-	1251	-	ENSACIP00000002690	416 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000002101's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000002101's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002101	trmu	99	69.007	ENSG00000100416	TRMU	96	74.214	Homo_sapiens
ENSACIG00000002101	trmu	100	87.770	ENSAPOG00000014458	trmu	100	87.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000002101	trmu	96	69.576	ENSAMEG00000003319	TRMU	96	69.576	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002101	trmu	100	88.010	ENSAOCG00000013155	trmu	100	88.010	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000002101	trmu	100	87.770	ENSAPEG00000013350	trmu	100	87.770	Amphiprion_percula
ENSACIG00000002101	trmu	100	83.894	ENSATEG00000007814	trmu	100	83.894	Anabas_testudineus
ENSACIG00000002101	trmu	93	71.059	ENSAPLG00000016380	TRMU	98	71.059	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000002101	trmu	95	70.380	ENSACAG00000007720	TRMU	95	70.380	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.136	ENSANAG00000038053	TRMU	96	69.136	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.990	ENSACLG00000005395	trmu	100	93.990	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002101	trmu	95	78.734	ENSAMXG00000005282	trmu	96	78.734	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002101	trmu	95	70.529	ENSBTAG00000005595	TRMU	95	70.529	Bos_taurus
ENSACIG00000002101	trmu	91	40.921	WBGene00007114	mttu-1	98	40.921	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000002101	trmu	99	66.667	ENSCJAG00000000198	TRMU	99	66.667	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.136	ENSCAFG00000000779	TRMU	95	69.136	Canis_familiaris
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.136	ENSCAFG00020009184	TRMU	95	69.136	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000002101	trmu	99	68.537	ENSCHIG00000017074	TRMU	98	68.537	Capra_hircus
ENSACIG00000002101	trmu	96	70.175	ENSTSYG00000003853	TRMU	95	70.175	Carlito_syrichta
ENSACIG00000002101	trmu	94	66.093	ENSCAPG00000013034	TRMU	96	66.093	Cavia_aperea
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.727	ENSCPOG00000020780	TRMU	96	69.727	Cavia_porcellus
ENSACIG00000002101	trmu	99	67.067	ENSCCAG00000021641	TRMU	99	67.067	Cebus_capucinus
ENSACIG00000002101	trmu	96	69.674	ENSCATG00000032800	TRMU	95	69.674	Cercocebus_atys
ENSACIG00000002101	trmu	98	69.118	ENSCLAG00000017269	TRMU	97	69.118	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000002101	trmu	98	68.719	ENSCSAG00000005279	TRMU	96	68.719	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000002101	trmu	89	71.237	ENSCPBG00000011621	TRMU	93	71.237	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002101	trmu	95	48.232	ENSCING00000019371	-	97	48.232	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000002101	trmu	98	68.227	ENSCANG00000041645	TRMU	96	68.227	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.238	ENSCGRG00001001739	Trmu	96	68.238	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000002101	trmu	97	63.275	ENSCGRG00000002781	Trmu	96	63.275	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002101	trmu	99	78.986	ENSCSEG00000012382	trmu	99	78.986	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000002101	trmu	100	85.817	ENSCVAG00000001366	trmu	100	85.817	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000002101	trmu	100	72.596	ENSDARG00000043734	trmu	100	72.596	Danio_rerio
ENSACIG00000002101	trmu	64	53.731	ENSDNOG00000047245	-	94	53.731	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000002101	trmu	96	70.426	ENSDORG00000007455	Trmu	97	70.426	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002101	trmu	93	44.041	FBgn0040337	CG3021	95	44.041	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000002101	trmu	94	56.234	ENSEBUG00000007454	trmu	100	55.043	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.877	ENSEASG00005021725	TRMU	96	69.877	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.877	ENSECAG00000000467	TRMU	96	69.877	Equus_caballus
ENSACIG00000002101	trmu	69	51.049	ENSEEUG00000000074	-	68	51.049	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000002101	trmu	100	77.938	ENSELUG00000009464	trmu	99	80.707	Esox_lucius
ENSACIG00000002101	trmu	96	70.677	ENSFCAG00000006533	TRMU	95	70.677	Felis_catus
ENSACIG00000002101	trmu	89	70.526	ENSFALG00000010035	TRMU	96	70.526	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000002101	trmu	91	68.158	ENSFDAG00000017472	TRMU	97	68.158	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002101	trmu	100	86.538	ENSFHEG00000003162	trmu	98	88.556	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002101	trmu	97	72.236	ENSGMOG00000001323	trmu	100	72.236	Gadus_morhua
ENSACIG00000002101	trmu	95	71.712	ENSGALG00000031922	TRMU	95	71.712	Gallus_gallus
ENSACIG00000002101	trmu	99	87.561	ENSGAFG00000013331	trmu	98	87.561	Gambusia_affinis
ENSACIG00000002101	trmu	100	83.452	ENSGACG00000019024	trmu	100	83.452	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000002101	trmu	99	69.007	ENSGGOG00000000203	TRMU	98	69.007	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.510	ENSHBUG00000023421	trmu	100	93.510	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.905	ENSHGLG00000009278	TRMU	95	68.905	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.905	ENSHGLG00100018863	TRMU	95	68.905	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000002101	trmu	99	83.333	ENSHCOG00000013459	trmu	99	83.333	Hippocampus_comes
ENSACIG00000002101	trmu	96	77.057	ENSIPUG00000009785	trmu	99	77.057	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.479	ENSSTOG00000010993	TRMU	96	69.479	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000002101	trmu	99	67.146	ENSJJAG00000000667	Trmu	100	67.146	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002101	trmu	100	83.894	ENSKMAG00000008516	trmu	100	83.894	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002101	trmu	100	85.337	ENSLBEG00000018831	trmu	100	85.337	Labrus_bergylta
ENSACIG00000002101	trmu	97	74.938	ENSLACG00000013713	TRMU	96	74.938	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000002101	trmu	96	78.500	ENSLOCG00000016066	trmu	96	78.500	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000002101	trmu	96	61.425	ENSLAFG00000005129	TRMU	96	61.425	Loxodonta_africana
ENSACIG00000002101	trmu	98	68.966	ENSMFAG00000039767	TRMU	96	68.966	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000002101	trmu	98	68.966	ENSMMUG00000000807	TRMU	96	68.966	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002101	trmu	98	68.966	ENSMNEG00000028164	TRMU	96	68.966	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000002101	trmu	96	69.674	ENSMLEG00000033884	TRMU	95	69.674	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000002101	trmu	100	85.337	ENSMAMG00000004717	trmu	100	85.337	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.750	ENSMZEG00005015797	trmu	100	93.750	Maylandia_zebra
ENSACIG00000002101	trmu	76	69.939	ENSMGAG00000007550	TRMU	95	69.939	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000002101	trmu	96	68.170	ENSMAUG00000022282	Trmu	96	68.170	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000002101	trmu	95	69.620	ENSMICG00000029046	TRMU	96	69.620	Microcebus_murinus
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.486	ENSMOCG00000014641	Trmu	97	68.486	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002101	trmu	100	81.490	ENSMMOG00000007229	trmu	100	81.490	Mola_mola
ENSACIG00000002101	trmu	95	66.583	ENSMODG00000007433	TRMU	93	66.583	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000002101	trmu	100	84.615	ENSMALG00000007721	trmu	100	84.615	Monopterus_albus
ENSACIG00000002101	trmu	99	66.667	MGP_CAROLIEiJ_G0020134	Trmu	99	66.667	Mus_caroli
ENSACIG00000002101	trmu	97	67.990	ENSMUSG00000022386	Trmu	97	67.990	Mus_musculus
ENSACIG00000002101	trmu	97	67.742	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	97	67.742	Mus_pahari
ENSACIG00000002101	trmu	97	67.990	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	97	67.990	Mus_spretus
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.642	ENSMPUG00000002523	TRMU	96	68.642	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000002101	trmu	99	67.952	ENSNGAG00000005132	Trmu	99	67.952	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.510	ENSNBRG00000022690	trmu	100	93.510	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.727	ENSNLEG00000015773	TRMU	96	69.727	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000002101	trmu	79	57.492	ENSMEUG00000000216	TRMU	99	57.492	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.479	ENSODEG00000014745	TRMU	97	69.136	Octodon_degus
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.990	ENSONIG00000009821	trmu	100	93.990	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000002101	trmu	93	63.753	ENSOANG00000001891	TRMU	98	63.753	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002101	trmu	90	69.947	ENSOCUG00000003664	TRMU	94	68.782	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000002101	trmu	100	81.250	ENSORLG00000019015	trmu	99	81.250	Oryzias_latipes
ENSACIG00000002101	trmu	100	81.490	ENSORLG00020006830	trmu	99	81.490	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000002101	trmu	100	81.490	ENSORLG00015003907	trmu	99	81.490	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000002101	trmu	55	87.773	ENSOMEG00000015541	trmu	83	87.773	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000002101	trmu	97	67.990	ENSOGAG00000008096	TRMU	97	67.990	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000002101	trmu	91	68.158	ENSOARG00000019475	TRMU	93	68.158	Ovis_aries
ENSACIG00000002101	trmu	99	68.765	ENSPPAG00000033944	TRMU	98	68.765	Pan_paniscus
ENSACIG00000002101	trmu	96	70.426	ENSPPRG00000004197	TRMU	95	70.426	Panthera_pardus
ENSACIG00000002101	trmu	67	71.480	ENSPTIG00000014122	TRMU	97	73.106	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002101	trmu	99	68.765	ENSPTRG00000014510	TRMU	98	68.765	Pan_troglodytes
ENSACIG00000002101	trmu	95	69.873	ENSPANG00000023074	TRMU	97	67.123	Papio_anubis
ENSACIG00000002101	trmu	100	74.038	ENSPKIG00000002849	trmu	100	74.038	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000002101	trmu	88	70.879	ENSPSIG00000013020	TRMU	95	70.879	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000002101	trmu	100	83.654	ENSPMGG00000004083	trmu	100	83.654	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000002101	trmu	100	66.827	ENSPEMG00000014007	Trmu	98	66.827	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000002101	trmu	94	65.473	ENSPCIG00000009923	TRMU	93	65.063	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000002101	trmu	97	83.168	ENSPFOG00000008197	trmu	90	83.168	Poecilia_formosa
ENSACIG00000002101	trmu	99	86.232	ENSPLAG00000008414	trmu	99	86.232	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002101	trmu	100	86.538	ENSPMEG00000004326	trmu	100	86.538	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000002101	trmu	99	85.990	ENSPREG00000007980	trmu	99	85.990	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000002101	trmu	97	69.630	ENSPPYG00000011949	TRMU	96	69.630	Pongo_abelii
ENSACIG00000002101	trmu	93	62.274	ENSPCAG00000013462	TRMU	99	62.274	Procavia_capensis
ENSACIG00000002101	trmu	96	68.329	ENSPCOG00000016539	TRMU	96	68.329	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000002101	trmu	97	63.457	ENSPVAG00000013202	TRMU	96	63.840	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000002101	trmu	100	93.510	ENSPNYG00000005629	trmu	100	93.510	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002101	trmu	100	76.923	ENSPNAG00000006339	trmu	97	76.923	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002101	trmu	97	67.494	ENSRNOG00000016465	Trmu	97	67.494	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000002101	trmu	98	67.734	ENSRBIG00000038973	TRMU	96	67.734	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000002101	trmu	98	67.980	ENSRROG00000004267	TRMU	96	67.980	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000002101	trmu	93	32.518	YDL033C	SLM3	93	32.518	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000002101	trmu	99	67.788	ENSSBOG00000030184	TRMU	99	67.788	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000002101	trmu	91	72.559	ENSSFOG00015020664	trmu	99	72.559	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002101	trmu	100	84.856	ENSSMAG00000019450	trmu	100	84.856	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000002101	trmu	100	87.260	ENSSDUG00000011913	trmu	100	87.260	Seriola_dumerili
ENSACIG00000002101	trmu	100	87.019	ENSSLDG00000011684	trmu	100	87.019	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002101	trmu	95	60.506	ENSSPUG00000017123	TRMU	93	60.506	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000002101	trmu	100	85.337	ENSSPAG00000021875	trmu	100	85.337	Stegastes_partitus
ENSACIG00000002101	trmu	97	68.148	ENSSSCG00000000007	TRMU	96	68.148	Sus_scrofa
ENSACIG00000002101	trmu	89	72.118	ENSTGUG00000003663	-	100	72.118	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000002101	trmu	99	84.262	ENSTRUG00000001231	trmu	100	84.262	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000002101	trmu	99	83.133	ENSTNIG00000010484	trmu	98	83.133	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000002101	trmu	72	54.622	ENSTBEG00000011276	-	77	54.622	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000002101	trmu	95	71.139	ENSTTRG00000004160	TRMU	94	71.139	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000002101	trmu	70	72.509	ENSUAMG00000024825	TRMU	97	72.509	Ursus_americanus
ENSACIG00000002101	trmu	95	58.942	ENSUMAG00000019079	TRMU	97	72.374	Ursus_maritimus
ENSACIG00000002101	trmu	53	61.644	ENSVPAG00000000685	-	100	61.644	Vicugna_pacos
ENSACIG00000002101	trmu	99	67.805	ENSVVUG00000024963	TRMU	97	67.805	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000002101	trmu	96	74.564	ENSXETG00000023304	trmu	94	74.564	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000002101	trmu	99	85.132	ENSXCOG00000015105	trmu	99	85.132	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002101	trmu	99	87.440	ENSXMAG00000006697	trmu	99	87.440	Xiphophorus_maculatus