EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000002180 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 934 bases
Position: chrCCOE01000865.1:3191753-3192686
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000002682	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-25	1	5
ENSACIP00000002682	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-25	2	5
ENSACIP00000002682	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-25	3	5
ENSACIP00000002682	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-25	4	5
ENSACIP00000002682	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-25	5	5
ENSACIP00000002682	zf-met	PF12874.7	5.8e-12	1	3
ENSACIP00000002682	zf-met	PF12874.7	5.8e-12	2	3
ENSACIP00000002682	zf-met	PF12874.7	5.8e-12	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000002779	-	444	-	ENSACIP00000002682	147 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000002180	-	97	40.441	ENSACIG00000012636	ZNF319	89	40.441
ENSACIG00000002180	-	99	36.054	ENSACIG00000001767	zbtb41	65	36.054
ENSACIG00000002180	-	96	40.426	ENSACIG00000019815	-	90	40.426
ENSACIG00000002180	-	88	33.103	ENSACIG00000009443	-	53	33.103
ENSACIG00000002180	-	99	43.478	ENSACIG00000016182	-	85	43.478
ENSACIG00000002180	-	98	45.349	ENSACIG00000000286	-	70	45.349
ENSACIG00000002180	-	99	48.529	ENSACIG00000015429	-	76	48.529
ENSACIG00000002180	-	99	38.406	ENSACIG00000001369	-	86	38.406
ENSACIG00000002180	-	99	41.958	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	80	42.754
ENSACIG00000002180	-	99	35.616	ENSACIG00000016117	-	83	35.616
ENSACIG00000002180	-	98	45.690	ENSACIG00000015835	-	68	39.000
ENSACIG00000002180	-	94	42.336	ENSACIG00000023162	-	54	42.336
ENSACIG00000002180	-	95	37.963	ENSACIG00000004626	-	85	37.963
ENSACIG00000002180	-	97	39.640	ENSACIG00000023049	znf646	95	36.429
ENSACIG00000002180	-	94	41.304	ENSACIG00000013470	-	62	41.304
ENSACIG00000002180	-	99	46.575	ENSACIG00000014123	znf236	54	46.575
ENSACIG00000002180	-	93	42.063	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	85	42.063
ENSACIG00000002180	-	98	43.066	ENSACIG00000017050	-	93	44.444
ENSACIG00000002180	-	99	43.478	ENSACIG00000004745	-	94	43.478
ENSACIG00000002180	-	99	56.000	ENSACIG00000004041	-	94	41.606
ENSACIG00000002180	-	99	44.156	ENSACIG00000007096	-	71	44.156
ENSACIG00000002180	-	99	43.662	ENSACIG00000003515	-	93	43.662
ENSACIG00000002180	-	99	37.500	ENSACIG00000012263	znf319b	88	37.500
ENSACIG00000002180	-	98	41.860	ENSACIG00000017647	-	88	43.066
ENSACIG00000002180	-	99	45.255	ENSACIG00000009717	-	86	45.255
ENSACIG00000002180	-	99	41.739	ENSACIG00000024444	-	62	41.739
ENSACIG00000002180	-	95	44.186	ENSACIG00000008448	-	70	43.511
ENSACIG00000002180	-	93	42.336	ENSACIG00000003754	-	84	42.336
ENSACIG00000002180	-	99	44.828	ENSACIG00000019534	-	76	44.828
ENSACIG00000002180	-	100	44.526	ENSACIG00000010647	-	91	44.526
ENSACIG00000002180	-	98	41.732	ENSACIG00000013604	-	96	40.000
ENSACIG00000002180	-	98	42.222	ENSACIG00000013163	-	77	42.222
ENSACIG00000002180	-	99	43.333	ENSACIG00000018440	-	96	43.333
ENSACIG00000002180	-	99	42.029	ENSACIG00000017644	-	82	42.029
ENSACIG00000002180	-	94	40.310	ENSACIG00000022330	-	83	40.310
ENSACIG00000002180	-	95	40.876	ENSACIG00000012084	-	97	40.876
ENSACIG00000002180	-	99	38.571	ENSACIG00000000406	prdm5	75	38.571
ENSACIG00000002180	-	94	41.985	ENSACIG00000006806	-	60	41.985
ENSACIG00000002180	-	98	46.341	ENSACIG00000022625	-	82	46.341
ENSACIG00000002180	-	99	34.320	ENSACIG00000011516	-	79	34.320
ENSACIG00000002180	-	100	40.367	ENSACIG00000021986	-	92	40.367
ENSACIG00000002180	-	94	43.796	ENSACIG00000010637	-	53	43.796
ENSACIG00000002180	-	100	43.262	ENSACIG00000019710	-	73	43.262
ENSACIG00000002180	-	99	39.437	ENSACIG00000020938	zbtb47b	59	39.437
ENSACIG00000002180	-	98	44.915	ENSACIG00000006172	-	93	42.069
ENSACIG00000002180	-	95	37.179	ENSACIG00000007855	-	92	37.179
ENSACIG00000002180	-	95	42.029	ENSACIG00000011541	-	68	42.029
ENSACIG00000002180	-	99	39.535	ENSACIG00000007882	-	74	39.535
ENSACIG00000002180	-	94	40.000	ENSACIG00000006755	-	65	40.000
ENSACIG00000002180	-	94	41.176	ENSACIG00000017166	-	58	41.176
ENSACIG00000002180	-	96	41.538	ENSACIG00000023794	-	54	41.538
ENSACIG00000002180	-	97	40.876	ENSACIG00000009755	-	78	40.876
ENSACIG00000002180	-	99	39.252	ENSACIG00000013149	-	80	39.252
ENSACIG00000002180	-	97	45.882	ENSACIG00000010966	-	50	45.882
ENSACIG00000002180	-	99	46.729	ENSACIG00000022738	-	92	42.400
ENSACIG00000002180	-	99	41.221	ENSACIG00000009128	-	69	41.221
ENSACIG00000002180	-	99	45.536	ENSACIG00000004666	-	98	42.636
ENSACIG00000002180	-	93	41.481	ENSACIG00000011515	-	64	41.481
ENSACIG00000002180	-	94	45.000	ENSACIG00000010660	-	89	45.000
ENSACIG00000002180	-	98	42.029	ENSACIG00000009780	-	70	42.029
ENSACIG00000002180	-	97	42.308	ENSACIG00000016944	-	76	42.308
ENSACIG00000002180	-	93	42.969	ENSACIG00000000311	-	58	42.969
ENSACIG00000002180	-	99	40.952	ENSACIG00000014282	znf526	50	35.036
ENSACIG00000002180	-	98	43.357	ENSACIG00000003556	-	72	43.357
ENSACIG00000002180	-	100	39.706	ENSACIG00000017683	-	82	39.640
ENSACIG00000002180	-	99	41.667	ENSACIG00000022293	-	98	41.667
ENSACIG00000002180	-	97	37.956	ENSACIG00000008886	znf1164	80	37.956
ENSACIG00000002180	-	95	42.017	ENSACIG00000013750	-	59	42.017
ENSACIG00000002180	-	99	39.860	ENSACIG00000017013	-	50	39.860
ENSACIG00000002180	-	97	42.636	ENSACIG00000022658	-	94	42.636
ENSACIG00000002180	-	94	36.765	ENSACIG00000018641	snai2	53	36.765
ENSACIG00000002180	-	98	39.815	ENSACIG00000016133	-	51	39.815
ENSACIG00000002180	-	100	35.714	ENSACIG00000020982	znf710b	50	35.398
ENSACIG00000002180	-	97	38.095	ENSACIG00000018404	-	75	38.095
ENSACIG00000002180	-	98	40.000	ENSACIG00000007000	-	55	40.000
ENSACIG00000002180	-	100	45.263	ENSACIG00000017653	-	94	45.263
ENSACIG00000002180	-	98	37.719	ENSACIG00000006228	-	74	37.719
ENSACIG00000002180	-	100	44.444	ENSACIG00000011153	-	72	42.735
ENSACIG00000002180	-	93	38.235	ENSACIG00000004641	-	52	38.235
ENSACIG00000002180	-	100	40.984	ENSACIG00000010739	-	79	40.984
ENSACIG00000002180	-	99	37.879	ENSACIG00000023313	-	91	37.879
ENSACIG00000002180	-	100	35.433	ENSACIG00000002944	-	79	35.433
ENSACIG00000002180	-	98	40.708	ENSACIG00000019447	-	67	40.708
ENSACIG00000002180	-	98	36.429	ENSACIG00000017892	-	82	36.429
ENSACIG00000002180	-	95	43.678	ENSACIG00000003720	-	62	43.678
ENSACIG00000002180	-	99	41.606	ENSACIG00000023212	-	76	41.606
ENSACIG00000002180	-	99	37.931	ENSACIG00000015411	-	73	37.931
ENSACIG00000002180	-	95	41.667	ENSACIG00000007034	-	71	41.667
ENSACIG00000002180	-	99	43.796	ENSACIG00000019791	-	91	43.796

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000002180	-	99	70.345	ENSAMEG00000013858	-	76	70.345	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000002180	-	99	62.500	ENSACLG00000001258	-	91	62.500	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000002180	-	96	65.455	ENSAMXG00000015228	-	51	65.455	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000002180	-	99	73.451	ENSCAPG00000016268	-	99	73.451	Cavia_aperea
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSCPBG00000015742	-	99	72.388	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000002180	-	98	62.759	ENSCING00000011342	-	93	62.759	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000002180	-	97	63.380	ENSCSAVG00000005904	-	88	63.380	Ciona_savignyi
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSCGRG00000013485	-	99	72.388	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSDORG00000023443	-	99	72.388	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSFDAG00000019296	-	99	72.388	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000002180	-	96	65.138	ENSFHEG00000002747	-	50	51.974	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSGAGG00000015899	GFI1	99	72.388	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000002180	-	96	63.636	ENSIPUG00000021407	-	56	63.636	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000002180	-	99	73.451	ENSJJAG00000022622	-	99	73.451	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000002180	-	99	69.655	ENSKMAG00000003810	gfi1ab	64	69.655	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSMMUG00000005068	GFI1	99	72.388	Macaca_mulatta
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSMAUG00000021273	-	99	72.388	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSMOCG00000004478	-	99	72.388	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	MGP_CAROLIEiJ_G0027508	Gfi1	99	72.388	Mus_caroli
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	72.388	Mus_pahari
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSNGAG00000002549	-	99	72.388	Nannospalax_galili
ENSACIG00000002180	-	95	62.500	ENSNBRG00000001834	-	88	62.500	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002180	-	96	61.607	ENSNBRG00000010351	-	88	61.607	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSODEG00000006410	-	99	72.388	Octodon_degus
ENSACIG00000002180	-	99	71.233	ENSOANG00000022289	-	78	71.233	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000002180	-	99	70.940	ENSPTIG00000002680	-	88	70.940	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000002180	-	99	68.966	ENSPLAG00000010879	gfi1ab	51	68.966	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000002180	-	99	62.500	ENSPNYG00000001775	-	88	62.500	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000002180	-	75	64.545	ENSPNAG00000014299	-	56	64.545	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000002180	-	96	49.701	ENSSFOG00015008114	-	53	49.701	Scleropages_formosus
ENSACIG00000002180	-	96	56.154	ENSSLDG00000017614	-	95	56.154	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000002180	-	99	72.388	ENSUMAG00000011251	-	99	72.388	Ursus_maritimus
ENSACIG00000002180	-	99	70.588	ENSXCOG00000009186	-	92	70.588	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000002180	-	95	65.138	ENSXMAG00000006527	-	58	65.138	Xiphophorus_maculatus